| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006584 | 4496731 = | NA (NA) | 391 (4.520) | 265/586 | 0.0 | NA | coding (521/1209 nt) | LY180_21450 | hypothetical protein |
| ? | CP006584 | = 4497432 | NA (NA) | intergenic (+13/+464) | LY180_21450/LY180_21455 | hypothetical protein/D‑allose kinase | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CGAACGAGCAGCTCAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGCGCTGGGCATCGTCAAAATCCTGACGATCGCTAAACGGTAATGATTTGGCGTAATTCTGATTAACCTGTTGGGTATATTGAGTGGCGGCTTTCGCTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTTAATAAGT > CP006584/4497141‑4497726 | cAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGTGAGAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGCGCTGGGCATCGTCAAAAt < 1:270920/298‑1 (MQ=25) agagCGTTTTTATATCATGGTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACAGGGTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGCGCTGGGCATCGTCAAAATc < 2:140985/298‑1 (MQ=25) gagCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGCGCTGGGCATCGTCAAAATcc > 1:364711/1‑298 (MQ=35) gCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCAACTAGCTCAAAATTTATTCACCCATGGTTACGCTTTGGGGCAATTATGAGGGGATCTCTCAGCGCGTGCCATCGTCAAAATCCTg > 2:44224/1‑298 (MQ=16) tttGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGCGCTGGGCATCGTCAAAATCCTGACGa < 1:525335/298‑1 (MQ=38) tGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGCGCTGGGCATCGTCAAAATCCTTACgtac > 2:358211/1‑295 (MQ=37) cATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTTGCTGCAACCCTACTAGCTCACAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTTGGGAAATTATGCGGGGATTCCTCAGCGCTGGGCCTCGCAAAAATCCTGACAAGCGCTaaa > 2:409198/1‑298 (MQ=11) 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cTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGCGCTGGGCATCGTCAAAATCCTGACGATCGCTAAACGGTAATGATTTGGCg > 1:502531/1‑298 (MQ=255) gctgaaaCTAACGTGTTGGCTTGCGTGCGTTCAGACTCAAAAACAAGGTGTGGACAAGCGCTTCCAGGCTAACACAGTCCGAAATCTAAACGTACTCGCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTGTGCGGCAGTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGCGCTGGGCATCGTCAAAATCCTGACGATCGCTAAACGGTAATGATTTGGCGTAAtt < 2:589382/293‑1 (MQ=17) cTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGCGCTGGGCATCGTCAAAATCCTGACGATCGCTAAACGGTAATGATTTGGCGTAATTc > 1:765423/1‑298 (MQ=255) cTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGCGCTGGGCATCGTCAAAATCCTGACGATCGCTAAACGGTAATGATTTGGCGTAATTc < 1:27549/298‑1 (MQ=255) ttCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGCGCTGGGCATCGTCAAAATCCTGACGATCGCTAAACGGTAATGATTTGGCGTAATTCt < 1:288282/298‑1 (MQ=255) acaacctggTTGCCTTGCGGCGGTTCAGGCCCGGAAACAAGGTTGGGACAAGCCCTTCCAGGCTAAAACATGCAGAAAGCGAAACGTACGCTCAACAGTTCGGTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATGCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGTATCTCTCAGCGCTGGGCATCGTCAAAATCCTGACGATCGCTAAACGGTAATGATGTGGCGTAATTCTGAtt < 2:287202/290‑1 (MQ=17) 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tctcAGCGCTGGGCATCGTCAAAATCCTGACGATCGCTAAACGGTAATGATTTGGCGTAATTCTGATTAACCTGTTGGGTATATTGAGTGGCGGCTTTCGCTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTtaataa > 1:344287/1‑298 (MQ=255) ctcAGCGCTGGGCATCGTCAAAATCCTGACGATCGCTAAACGGTAATGATTTGGCGTAATTCTGATTAACCTGTTGGGTATATTGAGTGGCGGCTTTCGCTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCAATGAAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTACAACGTTAATAAg > 2:14227/1‑298 (MQ=255) tcAGCGCTGGGCATCTTCAAAATCCTGACGATCGCTAAACGTTAAGGATGTTGCGTAATTCTTATTCACCTGTTGGGTATATCTAGTGGCTGCTCTCGCTTCCCCGTTCTCGTTAGCGGTATGTAGCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAATCGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTtaataatt < 2:312078/298‑3 (MQ=255) | CGAACGAGCAGCTCAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAA‑TAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGCGCTGGGCATCGTCAAAATCCTGACGATCGCTAAACGGTAATGATTTGGCGTAATTCTGATTAACCTGTTGGGTATATTGAGTGGCGGCTTTCGCTTCCTCTTTCGCGTTAGCGGTATTTACCATCATGCCGCTGGCGGCAGTTAACGCAATAACAATCCTGCTCAAACGGAATAACCGAGAGTTATTCATATAAATCTCCATTTATCATTTATGTCGTAAATATGTAATCCATGCAAAATACGTCATTTAAAGCTGGCGTTATCATAATTGGGAAATTGCGACTTTAATAAGT > CP006584/4497141‑4497726 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |