| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP006584 | 1,335,968 | A→G | intergenic (+281/+21) | LY180_06295 → / ← LY180_06300 | thymidine kinase/bifunctional acetaldehyde‑CoA/alcohol dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP006584 | 1,335,968 | 0 | A | G | 97.7% | 310.6 / NA | 87 | intergenic (+281/+21) | LY180_06295/LY180_06300 | thymidine kinase/bifunctional acetaldehyde‑CoA/alcohol dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (43/42); minor base T (0/2); total (43/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
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CATCGCCACGATTAATAAGAATTTCTTTACTGACAGGGTGAGCAGGGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCGCTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGACCTGTAAAGTACAATATCCCTGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAAACGGCCCCAGAAGGGGCCGTTTATATTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCGGCTTCTTTTTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCAGGATCTGTTTCAGCTCGGAGATCAGCGGGTAACGCGGGTTAGCGCCGGTGCACTGGTCATCGAACGCATCTTCAGACAGTTTATCCACGTTCGCCAGGAAGTCTGCTTCCTGAACGCCAGCTTCACGGATAGATTTCGGAATACCCAGTTCAGCTTTCAGCGTTTCC > CP006584/1335673‑1336259 | cATCGCCACGATTAATAAGAATTTCTTTACTGACAGGGTGAGCAGGGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCGCTATACGCCTCACATGGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGACCTGTAAAGTACAATATCCCTGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAAACGGCCCCAGAAGGGGCCGTTTATGtt < 1:770663/298‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |