| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006584 | 840689 = | 37 (0.590) | 47 (0.830) | 44/526 | 0.3 | 55.9% | intergenic (+68/‑82) | LY180_03930/LY180_03935 | tRNA‑Lys/tRNA‑Val |
| ? | CP006584 | = 841381 | 41 (0.730) | intergenic (+125/‑280) | LY180_03950/LY180_03955 | tRNA‑Lys/quinolinate synthetase | |||||
TCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTTGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/841016‑840689‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggtgggtc‑gtgcaggatgactcgcttcgctCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTG < CP006584/841381‑841084 TCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTTGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTG < 1:561742/299‑1 GATGACTCGCTTCGCTTGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCCCCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑G > 1:476944/1‑299 CTCGCTTCGCTTGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAG < 1:451292/299‑1 ctcttccgatctCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGG < 1:7834/287‑1 CTTCGCTTGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGAGGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTTTAAGGGAGGTTCTCTCCCAGCTGCGCGAACCACCCGCACCTCCGCTGGATACTACAAACTACATCCCCCGAACCCCCCGCCATTA‑GTGCTGGGTC‑GTGCTGGATG > 2:386983/1‑299 CGCTTGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACT < 1:469681/299‑1 CCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCCCCCGGTACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCCCCACACCCACCGTAATTC‑ATGGTGGGTCGGTGCAGagacaggccata > 2:7834/1‑287 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ACATCTGAGTTTGATGTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTC > 1:506378/1‑299 GAGTTTGATGTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCACCTTGTAAGGGAGGTTCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCCCTGGATACTACAACCTACTTCCACCGAACCCACCGTCATTAGGTGGT‑GGTA‑GTGCAGGCTGACTCGCTCCGCCCGCCCCTCGGCCCGTCCCCCCGAGCGGCCCCGTTGTTTCGCCGCc > 2:158196/1‑298 AAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAAC < 1:158196/299‑1 TGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCT < 1:723259/299‑1 TGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCT < 1:726960/299‑1 TGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAG > 2:450427/1‑218 TGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAG < 1:450427/218‑1 GGGGCGGGCAGGATTGCAACCTGCGACCAGTTGATGTAAAGGCAACTGGTGTAGCAAGTGAGCGAACGTCGTGAGGGGTGGGGGATGACGGGATGGAACCGCCGACCCCCGCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCGGGGATAATCACCCGATACTGCGCTGGGTACTCCAACCTACTTCCACCGAACCAACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAG < 2:622152/299‑1 TCGTGCAGGAGCCGCACCGTGGACCAATGGATTAAACGTCACCTGCTTTACCAACCGAGTTAACGACCCGAGTGGTGGGGGATGGCGGGATCGAACCGCCGCCCCCCTCCTTGTAAGGGAGGGGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCGGGATACTACGACCTACTTCCTCCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTT < 2:59900/299‑1 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AATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGC > 1:684382/1‑299 AAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAAATAGCAAAAAAGCG > 1:282723/1‑299 AAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGTGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGC < 1:257647/299‑1 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TGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCT > 1:143942/1‑299 GCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGC < 1:559129/299‑1 CTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCG > 1:251907/1‑299 CGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACCCACACCTGCTGCCGGGTCGACTCTTTAAGTATCGCCAACAGCAAAAAAACGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCGGGGTTCGCACCCGCGACCCATTGGTTAAAAGTCAACTTCTCCACCCAATGCGCCTACGACCCCCTGCGGGATgtcgc > 2:285427/1‑294 CTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATC > 1:135084/1‑299 GATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATT < 1:462380/299‑1 ACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACACCTTCCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAG > 1:648734/1‑299 ctAACCACTTCCACCGATCCCTCCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGCTGACCCGCTCCGCTCGTCCTTCGGGCCGTCGCCCCGAGCGTCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACCCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATG < 1:91277/297‑1 AAACTACTTCCACCGCACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGG < 1:323913/299‑1 AAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGG > 1:480709/1‑299 CTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGG < 1:440284/299‑1 CCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAG < 1:437374/299‑1 ACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATT < 1:347516/299‑1 TGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTG < 1:430232/299‑1 TGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTG > 1:260457/1‑299 GTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAA > 1:675490/1‑299 CAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCTAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGT < 1:532231/299‑1 AGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGACGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAACCTGCGAACAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAAATGAGCTAACGACCCATTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGGGGGTCGTGCAGGAGTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTC > 1:276932/1‑299 ATGACTCGCTTCGCTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAAC < 1:503727/299‑1 CTCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACT < 1:539289/299‑1 TCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTG < 1:417294/299‑1 TCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTTGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGAGTGGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCGATACTGCGCTGGATACTACAAACTACTTCCACCGAACCCACCGTAATTA‑GTGGTGGGTC‑GTGCAGGATGACTCGCTTCGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/841016‑840689‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tggtgggtc‑gtgcaggatgactcgcttcgctCGCCCTTCGGGCCGTCGCCGCGAGCGGCTCCGTTGTTTCGCTGCGCTCAACTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTAAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTG < CP006584/841381‑841084 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |