New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP006584 | 5598 = | NA (NA) | 69 (1.140) | 55/564 | 0.2 | 98.6% | intergenic (+69/‑191) | LY180_00025/LY180_00030 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | CP006584 | 3172592 = | 1 (0.020) | coding (29/273 nt) | LY180_15050 | hypothetical protein |
CTGCGGAAATTACGTTAGTCCCGTCAGTAAAATTACAGATAGGCGATCGTGATAATCGTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACG‑GCTGGTGGAAACAACATTATGAATGGCGAGGCAATCGCTGGCACCCACACGGACCGCCGCCACCGCCGCGCCACCATAAGAAAGCTCCTCATGATCATCACGGCGGTCATGGTCCAGGCAAACATCACCGCTAAATGACAAATGCCGGGTAACAATCCGGCATTCAGC‑GCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTTGTATTATCCCTCCAGTGCAGAGAAAATCGGCCAGTTTTCTCTGCCTGCAGTCCGCATGCCGTATCGGGCCTTGGGTTCTAACCTGTTGCG‑TAGATTTATGCAGCGGACTGCCTTTCTCCCAAAGTGATAAACCGGACAGTATCATGGACCGGTTTTCCCGGTA‑ATCCGTATTTG‑CAAGGTTGGTTTCACTATGGAACATGAACTTCATTATATCGGTATCGACACCGCTAAAGAGAAACTGGATGTCGATGTGTTGCGTCCTGATGGTCGTCATCGCAC > CP006584/5300‑5877 | cTGCGGAAATTACGTTAGTCCCGTCAGTAAAATTACAGATAGGCGATCGTGATAATCGTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACG‑GCTGGTGGAAACAACATTATGAATGGCGAGGCAATCGCTGGCACCCACACGGACCGCCGCCACCGCCGCGCCACCATAAGAAAGCTCCTCATGATCATCACGGCGGTCATGGTCCAGGCAAACATCACCGCTAAATGACAAATGCCGGGTAACAATCCGGCATTCAGC‑GCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCtt < 1:318193/299‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |