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cgcAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAACTGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCAGATTA‑CATACAAGACTGGAAAGTG‑GAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAGGGTTGGGAAGAtata > 2:488190/1‑299 (MQ=255) aGCGATtcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcatcacaactgatgcgatgggctgccagaaagatattgcagaaaagatacaaaaacagggaggtgattatttattcgcggtaaaaggaaaccaggggcggctaaataaagcctttgaggaaaaatttccgctgaaagaattaaataattcagagcatgacagttacg < 1:562577‑M1/299‑294 (MQ=255) ttcatgtcattagtgcgttctcaacaatgcatagtctggtcctcggacagatcaagacggatgagaaatccaatgagattacagccattcctgaacttcttaacatgatggatattaaaggaaaaatcatcacaactgatgcgatgggctgccagaaagatattgcagaaaagatacaaaaacagggaggtgattatttattcgcggtaaaaggaaaccaggggcggctaaataaagcctttgaggaaaaatttccgctgaaagaattaaataattcagagcatgacagttacgcaatg > 1:285544‑M1/1‑1 (MQ=255) | TATTCTACTGTTGACTATTTGCGCTGTCATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGTGAAACACATCTCGATTTTTTGAAG‑CAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACCATTGCCAGCGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCTTCAGATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGCCGCAGGGGAGCGATCAGGGAAAGATCATCAGAAGTTCACTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTCCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTA‑CAGACAAGCCTGGAAAGTG‑GAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAGGGTTGGGAAGATATAGAGGATTTTGG > CP006584/268837‑269426 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |