| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
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aTGAGGGGATCT‑CTCAGTattcagcgggagagccccgttgaaaacaggaaagtttttaacctgagattgttaaagatatattacagattaataatattcttaaaatgtggtaatttattaaatctgtaataaaagcgtaaacaactgccgctaggcttgctgatcccgcgcaacaaaacgccatgctttgcttgcagatggttggcaaccgacgaaagtcctgctaaaacgttcgttggatatcatttttcctaaaattgaatggcagagaaccatcagtgccagccaacccctggggg > 2:565202‑M1/1‑18 (MQ=255) aTGAGGGGATCT‑CTCAGTGCTTTGCATAAAGCACAGTCTTATACGTCCCTGAGAAGATGATTTTTCTGCGTGATAACTAATATTTTATGGTAATAGGATTATTCTTAATCACTATATG‑GCGTGGAAATGTAACGAAATGACAGGACAGGTACAATAGCCAAATGTGTACTATTTGCAACGCAATGTAAATTTTGGCATCAGTACATTGAGAAGAAAACGCGTTAATTGATGGTAATCTTAACTATATCAAGCGTTTGATAAAGACATATTTTGATACCTGGCCATGTGGAAGATATTGc > 1:620586/1‑299 (MQ=255) tGAGGGGATCT‑CTCAGTGCTTTGCATAAAGCACAGTCTTATACGTCCCTGAGAAGATGATTTTTCTGCGTGATAACTAATATTTTATGGTAATAGGATTATTCTTAATCACTATATG‑GCGTGGAAATGTAACGAAATGACAGGACAGGTACAATAGCCAATTGTGTACTATTTGCAACGCAATGTAAATTTTGGCATCAGTACATTGAGAAGAAAACGCGTTAATTGATGGTAATCTTAACTATATCAAGCGTTTGATAAAGACATATTTTGATACCTGGCCATGTGGCAGATATTGCt < 1:610457/299‑1 (MQ=255) | AACGAGCAGCTCAGAGAGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGT‑ACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCT‑CTCAGTGCTTTGCATAAAGCACAGTCTTATACGTCCCTGAGAAGATGATTTTTCTGCGTGATAACTAATATTTTATGGTAATAGGATTATTCTTAATCACTATATG‑GCGTGGAAATGTAACGAAATGACAGGACAGGTACAATAGCCAAATGTGTACTATTTGCAACGCAATGTAAATTTTGGCATCAGTACATTGAGAAGAAAACGCGTTAATTGATGGTAATCTTAACTATATCAAGCGTTTGATAAAGACATATTTTGATACCTGGCCATGTGGCAGATATTGCT > CP006584/347107‑347679 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |