| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP006584 | 1643563 = | 58 (0.920) | 96 (1.570) | 72/568 | 0.0 | 77.1% | intergenic (‑223/‑80) | LY180_07760/LY180_07765 | sulfatase/transposase |
| ? | CP006584 | = 4565632 | 1 (0.020) | intergenic (‑372/+82) | LY180_21775/LY180_21780 | hypothetical protein/lysine 2,3‑aminomutase | |||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
AGAAATCCATTGCGGAAATCAGCTTGTCATAATTACCGGGTTGAAGTTTTCCTTTCCACCACATAAACATTGGGGTGTGAGTACCGCCAGGATAGGTCTGACTCTTATAGCCTTTTTGCGCCCCGTTCAGCGGCAGAGGACCATCGATAACCGCACCATTATCGGAGGTAAAGAGAATAATTGTATTGTCATACTGTCCGTTTTTCTTCAGTTGTTCGAGAATGCGTTTTACACCCTGATCAACAGAATAAACGGAAGCGTAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCA‑TATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAATCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCCTTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGACCGATTGTTAGGTAATCGTCACCTCCACAAAGAG > CP006584/1643271‑1643861 | tgttaaaataacataaatagccgtactcactctatataaacagaaaagaaaggttaattattggtgttagctatataaaaagtaacaacagcaatgcatatgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggaagcagcgtaaacgccttatccggcctacagttccttgcaaatccattcaatttcaatgcacgatgtagtcatgatactaataaaccccctaatgaattttatcAAAATCa < 2:58810‑M1/7‑1 (MQ=255) 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ccctaatgatttttatcAAAATCATTAAGTTAAGGTAGATACACATCTTGTCA‑TATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAATCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCCTTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGACCGATTGTTAGGGAATc < 1:577353‑M1/282‑1 (MQ=255) aatgatttttatcAAAATCATTAAGGTAAGGTAGGTACACATGTTGGCA‑TAGGATCGAATGGGTTCGCCAAAAATCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTGTCTTTCGCAATTCTGCCCGGAATTAGACTTAAACCGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCCTTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGGCCGATTGTTAGGTAATCGTCa > 2:516503‑M1/14‑299 (MQ=255) atgatttttatcAAAATCATTAAGTTAAGGTAGATACACATCTTGTCA‑TATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAATCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCCTTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGACCGATTGTTAGGTAATCGTCAc > 1:590340‑M1/13‑299 (MQ=255) | AGAAATCCATTGCGGAAATCAGCTTGTCATAATTACCGGGTTGAAGTTTTCCTTTCCACCACATAAACATTGGGGTGTGAGTACCGCCAGGATAGGTCTGACTCTTATAGCCTTTTTGCGCCCCGTTCAGCGGCAGAGGACCATCGATAACCGCACCATTATCGGAGGTAAAGAGAATAATTGTATTGTCATACTGTCCGTTTTTCTTCAGTTGTTCGAGAATGCGTTTTACACCCTGATCAACAGAATAAACGGAAGCGTAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCA‑TATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAATCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCCTTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGACCGATTGTTAGGTAATCGTCACCTCCACAAAGAG > CP006584/1643271‑1643861 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |