New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | 2030792 = | NA (NA) | 43 (0.690) | 39/580 | 0.7 | 100% | intergenic (+74/+105) | znuB/LY180_09680 | zinc transporter/hypothetical protein |
? | CP006584 | 2414712 = | 0 (0.000) | coding (1018/1644 nt) | LY180_11545 | multidrug ABC transporter ATP‑binding protein |
GATTATTACTTCACTGCTGATTATTCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTGCCATTAGCCGCCAGAC > CP006584/2030502‑2031030 | gATTATTACTTCACTGCTGATTATTCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTTGATACTGTTa > 1:402578/1‑299 (MQ=255) attattACTTCACTGCTGATTATTCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTAt < 1:307479/299‑1 (MQ=255) attaCTTCACTGCTGATTATTCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGc > 1:550749/1‑299 (MQ=255) tgATTATTCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGtttttt < 1:574098/299‑1 (MQ=255) attattCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTcc < 1:571103/299‑1 (MQ=255) ttCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGt > 1:724162/1‑299 (MQ=255) tGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTACTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCATTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCCCGAGCCCCTTCTCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGTTTCTGTTATGGCCTGCAAGCTTATTCCTTGTCCgg > 1:284442/1‑299 (MQ=255) cAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTCGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGGCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTTAACCCATTTGTCGGATGCGGCCCGAGCGCCTTATCCCACCTACATACTTCGTGCGCCCTGTAGCTACTGTTATGGCCTGACAGTTTTTTCCTGGTCCGCtt > 2:235488/1‑299 (MQ=255) gCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTc > 1:320051/1‑299 (MQ=255) cTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGCTGGCTGGTGTCGCTGCTCTGGTGGGGATGGCGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTCTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTCGTGCTCTGTGCGGCACTGCTATTTCTTCTCAGTATGATGAACAACCAGGCCAGCTCATCTATCGCTGAACACATTTGTCGCCTGCGGCCCGCGCGCCTTATCCGCCCTACCTAGTTCGTGCCACCTGTAGCAACTGTTACGTCCTGCAACTTCTTCCCTGGTCCGTCTTcc > 2:463334/1‑299 (MQ=255) 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gCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAg < 1:200340/299‑1 (MQ=255) gAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATACCAGACACAGCGcc > 1:161738/1‑299 (MQ=255) ggCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGgcg > 1:705705/1‑299 (MQ=255) tAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCCCTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTCTCGATGCACCCATTTGTCGGATGCGGCGCGCGCGCCTTCTCCGACCCACACAGTTCGTCCGCATTGTTGATACTCCTACGTCCTGCCAGTTTTGTCGCAGCACGGTTTCCCGGCTCACAGGTCTGCCCAATCCACCGCCGTCAGGCGCCTCTTTTTTACA‑CCCTTCCGCGAGTTTTAcaccc > 2:705846/1‑298 (MQ=255) cGGTTTACCGTTTTCTGCGTTTTGCGTTGTGCCGGGGGGTCCGTCGGTGTGGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCgg < 2:537231/299‑1 (MQ=21) ttAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGCGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGCCCTGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCCTGCCAGCCACCGCGCCGTCCGCCC‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCCATTTTTAcgcccgcgccggttta > 2:583205/1‑287 (MQ=25) cTTTTCCCGGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCg < 1:526174/299‑1 (MQ=255) ttttCCGTGTTTGACGGGTCGCCGGCGGGTCCGGGGGGGGTGCTATGTGCGGCACTGTTTTTTATTACAAGTATGCTGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACAAATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGt < 2:320051/299‑1 (MQ=18) gTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCGGTGACGCATc < 1:358492/299‑1 (MQ=255) tttACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGa > 1:134885/1‑299 (MQ=255) aTACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCa < 1:603042/299‑1 (MQ=255) tACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCAc < 2:724162/299‑1 (MQ=255) tACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCAc < 1:491325/299‑1 (MQ=255) ccGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGc > 1:190963/1‑299 (MQ=255) ggtggtgggtggggCGGGACTGTTAGTTATTAGCAGTATGATGGAAAAGCAGGGCAGCTAAGTTATCGCTGAGCAGATGGGTTGGATGCGGGGCGAGCGCCTTTACCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACGGTTATGGCATGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTcc < 2:698672/286‑1 (MQ=14) tgCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACg < 1:160049/299‑1 (MQ=255) gCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGcc > 1:189424/1‑299 (MQ=255) aCTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAg > 1:696636/1‑299 (MQ=255) ttatttatTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCtcg < 1:79909/299‑3 (MQ=255) atttattCTCGGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCCATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTgcg < 1:400667/299‑1 (MQ=255) ttttgagagttggttgaAAATGCAGGGCAGCTAATCATTCGCTGAAGGCATTTGGCGGCGGCGGCGCGGGCGCCTGTTCCCGCCGACATAGTTCGGGCGGTCTGTAGATGCTGTTAGGGGCTGCAAGTTTTTTCCGGTGCCGGTTTCCCGGGTTGCAGGCATGCCAGACACGGCGCCGTACGGCG‑CTGTTTTGTTCATGCCTTCCGCGATTTTTGCGCGGGGACCGGATGATGCCGTGACGCATCGAGCGGCACGCCGGACTGCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGcat < 2:534746/285‑1 (MQ=2) tattCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGcat < 1:583205/299‑1 (MQ=255) ctcAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCatcatc < 1:542675/299‑1 (MQ=255) aGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATcgcg < 1:235488/299‑1 (MQ=255) gatgaAAAATCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGATCACATTTGTCGGATGCGGTGCGAGCGGCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACTGCACGTCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCgag < 1:241152/299‑1 (MQ=255) aaaGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCAc > 1:286203/1‑299 (MQ=255) aaGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCAcc > 1:44337/1‑299 (MQ=255) cAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCAcctttccttt > 1:339312/1‑299 (MQ=255) tAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAAGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTg > 1:644885/1‑299 (MQ=255) aTCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATCCGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTGcc > 1:397945/1‑299 (MQ=255) 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GATTATTACTTCACTGCTGATTATTCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCG‑CTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTGCCATTAGCCGCCAGAC > CP006584/2030502‑2031030 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |