| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
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atcatcATGTTGATGAATGAATAATTTACTAATGTTTActgagagatcccctcataatttccccaaagcgtaaccatatgtatataaattttgcgctattagggttgcagcaacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaagagaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgttttagccaggatgtgattgtccaaaccttgtgtctgaactttaacgaccgcgagccaacatgttattggaagcatccgggcgataagcacaa > 2:717267‑M1/1‑38 (MQ=255) tgatgaATGAATAATTTACTAATGTTTActgagagatcccctcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagccacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaagcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtcccaaccttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgattagcagcatgatatcaaa > 1:435352‑M1/1‑28 (MQ=255) tgaatAATTTACTAATGTTTActgagagatcccctcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagccacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaagcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtcccaaccttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgattagcagcatgatatcaaaacgctct < 1:679487‑M1/299‑279 (MQ=255) tcagTAATGTTTATTTAAAATATTTCAATGTCGTTATATAAATTACCTATAAAAAACAACCATGTATTTATCTTAAATATCAAAACCTTTATAACATCCGAAAAAGAAAGATACGAATAGCATTTACACAATACCCGGAATAGACTTTCGTCACTTTTAATTAAAGGGATGTTTTTATGCAGTGGTATTTAGCCGTATTAAAAAATTATGTTGGTTTCTCTGGTCGCGCACGTCGTAAAGAGTACTGGATGTTTACTCTGATTAACGCCATCGTCGGCGCTATTATCAATGTCATTCaa > 2:447915‑M1/5‑299 (MQ=255) gTAATGTTTATTTAAAATATTTCAATGTCGTTATATAAATTACCTATAAAAAACAACCATGTATTTATCTTAAATATCAAAACCTTTATAACATCCGAAAAAGAAAGATACGAATAGCATTTACACAATACCCGGAATAGACTTTCGTCACTTTTAATTAAAGGGATGTTTTTATGCAGTGGTATTTAGCCGTATTAAAAAATTATGTTGGTTTCTCTGGTCGCGCACGTCGTAAAGAGTACTGGATGTTTACTCTGATTAACGCCATCGTCGGCGCTATTATCAATGTCATTCAATTg > 1:543221‑M1/2‑299 (MQ=255) gTTTATTTAAAATATTTCAATGTCGTTATATAAATTACCTATAAAAAACAACCATGTATTTATCTTAAATATCAAAACCTTTATAACATCCGAAAAAGAAAGATACGAATAGCATTTACACAATACCCGGAATAGACTTTCGTCACTTTTAATTAAAGGGATGTTTTTATGCAGTGGTATTTAGCCGTATTAAAAAATTATGTTGGTTTCTCTGGTCGCGCACGTCGTAAAGAGTACTGGATGTTTACTCTGATTAACGCCATCGTCGGCGCTATTATCAATGTCATTCAATTGAtttt > 1:353484/1‑299 (MQ=255) | CTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCAGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGTTGTTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAAAACCGCTTTGGACCAGATCCGAAACTGGAACCTTAAAACAAATCTGCTCGCCGGATGTCTGACTCATCCGGCTTTTATCATCATGTTGATGAATGAATAATTTACTAATGTTTATTTAAAATATTTCAATGTCGTTATATAAATTACCTATAAAAAACAACCATGTATTTATCTTAAATATCAAAACCTTTATAACATCCGAAAAAGAAAGATACGAATAGCATTTACACAATACCCGGAATAGACTTTCGTCACTTTTAATTAAAGGGATGTTTTTATGCAGTGGTATTTAGCCGTATTAAAAAATTATGTTGGTTTCTCTGGTCGCGCACGTCGTAAAGAGTACTGGATGTTTACTCTGATTAACGCCATCGTCGGCGCTATTATCAATGTCATTCAATTGATTTTA > CP006584/3378912‑3379505 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |