New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | 3268622 = | 1 (0.040) | 42 (1.500) | 38/586 | 0.0 | 97.7% | coding (97/1119 nt) | LY180_15515 | hydrogenase 2 small subunit |
? | CP006584 | 3344744 = | NA (NA) | coding (163/330 nt) | LY180_15880 | hypothetical protein |
ACATACGTATTATCTTGCTTTAATTAATTACACTAATGCTTCTTCCCTTCGTTTTAGCGCCCCGCCGCAGTATCATGATATCGATAACCATAATAAATGTGTGGTAAATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/3268902‑3268622 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAA‑GCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGA > CP006584/3344744‑3345035 acttcctaATTATCTTGTTTTAATTAATTACATTAATGCTTCTTCCCTTCGTTTTGGCGCCCCGCCGCAGTATCATGATATCGATAACCATAATAAATGTGTGGTAAATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAAT < 2:261626/290‑1 TCTTGCTTTAATTAATTACACTAATGCTTCTTCCCTTCGTTTTAGCGCCCCGCCGCAGTATCATGATATCGATAACCATAATAAATGTGTGGTAAATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAA < 1:43250/298‑1 TTGCTTTAATTAATTACACTAATGCTTCTTCCCTTCGTTTTAGCGCCCCGCCGCAGTATCATGATATCGATAACCATAATAAATGTGTGGTAAATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGACAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCAGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAA > 1:202516/1‑298 ttttatgTAATGCTTCTTCCCGGCGTGTTAACGCCCCGGTGCAGGATCAGGATATCGATAACCATAATAAATGTGTGGTAAATGGCGCATCTATCGCATTATTGAGTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGACAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCGTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAA < 2:568/291‑1 TCGTTTTAGCGCCCCGCCGCAGTATCATGATATCGATAACCATAATAAATGTGTGGTAAATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATA > 1:190169/1‑298 AGCGCCCCGCCGCAGTATCATGATATCGATAACCATAATAAATGTGTGGTAAATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATAGGTTTCAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAATGTGGATACAAATCTTTACATTTTATCAA > 2:297162/1‑298 GCGCCCCGCCGCAGTATCATGATATCGATAACCATAATAAATGTGTGGTAAATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAA < 1:219247/298‑1 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TAACCATAATAAATGTGTGGTAAATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGCGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGAC > 1:97245/1‑298 CATAATAAATGTGTGGTAAATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGACATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACA > 1:154271/1‑298 AATGTGTGGTAAATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCTCCACCATGGGGTTAAGTACAGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGTATCCACAACTTGTCATATGATCAAATGGTTT‑ACGAAAAAACAACAAATCAAACAAAAAacacat > 2:81768/1‑292 TGTGGTAAATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAA > 1:114850/1‑298 GTGGTAAATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAAC > 1:43897/1‑298 AATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATCCACATCTTGTCATATGATCATATGGTTTCGCGAAAACTAAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCacta > 2:146960/1‑294 CATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACA > 1:197831/1‑298 TCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACG > 1:136937/1‑298 GATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAACATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCATCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCCTTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACCTCTTGTCATATTATCAACTGGTTTCGGTAAAAATCAA‑TAAAAAAACAACAAGATGTCAGAACACGACATTTTACACCAC > 2:53356/1‑298 tatggagggcAAAGATATGCAAGTTCGTCGCAACGGCAGAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCGTCCATTCTCACGGCATTAACGTTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGAATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCC < 2:43897/288‑1 GAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAA > 2:29191/1‑298 gGGCAAAAATTATGCCACGCATTAGCAACGGAATAACTCTAAAGACCTGGAGATACAACCTTCATCCATTATCACGGCATTAACCTTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAAGGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAAT < 2:171775/297‑1 ATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAA > 2:119956/1‑298 GGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACG < 1:297162/298‑1 TAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATTATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAAATGTTCGAACTCGAAATTTTACACAACTCCCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTACACACCCTAACCTTGc > 2:315412/1‑297 TAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGG > 1:154730/1‑298 ACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCT < 1:81768/298‑1 AATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGACGCTTTGTGCCTCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGCTGAATCCCCTAATGATTTTGCTAAAAATCATTAAGTTAAGTTTGATACACATCTTGTCATAACAACAACTGCTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACCAGCTCTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTCTACCAATTCTCCACCGAATTACACATAAAACGACTCAACACATTAACGTTGGttccccta > 2:95950/1‑290 GGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTAC > 1:239846/1‑298 ATAACACCCTCAACCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGA < 1:147483/298‑1 CTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCT < 1:96404/298‑1 CATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAA < 1:53356/298‑1 ACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCACCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGATTAACGTTGGCTTTCCACGCATTACTTGACTGTAAAACCCTAACCCTTCCCGAACTTGG > 2:145821/1‑298 TGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAACTGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGCTGTGCGAACTCGATATTTTACACGCATCTCTTTACCAATTCTGCCACGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTACCGTTGCCTTGCCCCGCATTACTTGCACGAAAACCTCCCACTCTTACCAACGTCACCCGTATCCTGCCAAC > 2:12983/1‑298 GCTTTTTGCAGCATTTTCCGGCACATTGGGGTTAAGTCATGATTAATCCCCTAATGAGTTTGGTAATAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACCTTTTGTCAGATTGTCAAATGGTTTCGCGAATACTCAA‑TGCTCAGCCAACAAGATGTTCGAACTCGATATTTTTCACGACTCTCTGTACCAATTCTGCCCAGAATTACACTTAAAACGACTCGACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAA < 2:236240/298‑1 GCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAA‑GCGAGAA < 1:202498/298‑1 GCCGCCACCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGAGCGAACTCGATATTTTAAACGACTATCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCCACCAAAGGCGA‑AACAAAACAca > 2:160832/1‑296 CCATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAA‑GCGAGAACAAAACATAACATCAA > 1:253792/1‑298 CATGGGGTTAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAA‑GCGAGAACAAAACATAACATCAAA < 1:145821/298‑1 ggaagcgtAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATATTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAA‑GCGAGAACAAAACATAAAATCAAACG > 1:178231/9‑298 gtAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGATTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCATTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTTCCACGCATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCTAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAC‑ACGAGAACAAAACATAAAATCCAACAAATCGA > 2:306229/3‑298 TAAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACACATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAA‑GCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGA < 2:197831/298‑1 ACATACGTATTATCTTGCTTTAATTAATTACACTAATGCTTCTTCCCTTCGTTTTAGCGCCCCGCCGCAGTATCATGATATCGATAACCATAATAAATGTGTGGTAAATGGCGCATCGATCGCATTATTGATTTTGCGATTGAGGCAAAATATATGCCAGGTCTTCGCAACGGAATAACTATAAATGACTGGAGATAACACCCTCATCCATTCTCACGGCATTAACCGTCGTGATTTCATGAAGCTTTGTGCAGCATTAGCCGCCACCATGGGGTTAAGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/3268902‑3268622 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAA‑TAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAA‑GCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGA > CP006584/3344744‑3345035 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |