New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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cAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGCTTTGCATAAAGCACAGTCTTATACGGCCCTGAGAAGATGATTTTTCTGCGTGATAACTAATATTTTATGGTAAGAGGATTATTCTTAATCACTATATGGCGTGGAAATGTAACGAAATGACAGGACAGGTACAATAGCCAAATGTGTACTATTTGCAACGCAATGTAAATTTTGGCATCAGTACATTGAGAAGAAAACGCGTTAATTGATGGTAATCTTAACtata < 1:88622/298‑1 (MQ=255) aaCCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTattcagcgggagagccccgttgaaaacaggaaagtttttaacctgagattgttaaagatatattacagattaataatattcttaaaatgtggtaatttattaaatctgtaataaaagcgtaaacaactgccgctaggcttgctgatcccgcgcaacaaaacgccatgctttgcttgcagatggttggcaaccgacgacagtcctgctaaaacgttcgtttgatatcatt > 1:329494‑M1/1‑69 (MQ=255) ccTACTAGCTCACAATTTATTAGACCAGTGTTTCTATTTGGGGGAGTGATTAGTGGATCTTTCAGTGTTTTGCCTAAAGAATACAGTTTAACGTCCATGATAAGATGGTTTTTTGGCGTGATAACTTATATTTTATGGTAATAGGATTATTCTTGATCACTATATGGGGTGGAAATGTATCGAAAGGACAGGACAGGTACAATAGCCAAATGTGTACTATTTGCAACGCAATGTAAATTTTGGCATCAGTACATTGAGATGAAAACGCGTTAATTGATGGTAATCTTAACTATATCaa < 2:322612/298‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |