| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | CP006584 | 1,335,989 | 2720 bp→GCCTAATTAATTAATCCC | [LY180_06300]–[LY180_06310] | [LY180_06300], LY180_06305, [LY180_06310] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP006584 | 1335989 | 1338708 | 2720 | 26 [0] | [0] 31 | [LY180_06300]–[LY180_06310] | [LY180_06300],LY180_06305,[LY180_06310] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006584 | = 1335988 | 0 (0.000) | 25 (0.950) +GCCTAATTAATTAATCCC |
24/550 | 0.2 | 100% | intergenic (+301/+1) | LY180_06295/LY180_06300 | thymidine kinase/bifunctional acetaldehyde‑CoA/alcohol dehydrogenase |
| ? | CP006584 | 1338709 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/‑476) | LY180_06310/LY180_06315 | alcohol dehydrogenase/membrane protein | |||||
CTTTACTGACAGGGTGAGCAGGGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCGCTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGACCTGTAAAGTACAATATCCCTGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAAACGGCCCCAGAAGGGGCCGTTTATATTGCCAGACAGCGCTACTGATTAAGCGGATTTTTTCGCTTTTTTCTCAGCTTTAGCCGGAGCGGCTTCTTTTTTCGCTGCAGTTTCACCTTCTACATAATCACGACCGTAGTAGGTATCCAGCAGGATCTGTTTCAGCTCGGAGATCAGCGGGTAACGCGGGTTAGCGCCGGTGCACTGGTCATCGAACGCATCTTCAGACAGTTTATCCACGTTCGCCAGGAAGTCTGCTTCCTGAACGCCAGCTTCACGGATAGATTTCGGAATACCCAGTTCAGCTTTCAGCGTTTCCAGCCATGCCAGCAGTTTCTCGA > CP006584/1335697‑1336281 | cTTTACTGACAGGGTGAGCAGGGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCGCTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGACCTGTAAAGTACGATATCCCTGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAAACGGCCCCAGAAGGGGCCGTTTATGTTGCCAGACAGCGCTACTGAgcctaa < 1:46355‑M1/298‑7 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |