New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | 2030792 = | NA (NA) | 19 (0.690) | 18/578 | 0.6 | 100% | intergenic (+74/+105) | znuB/LY180_09680 | zinc transporter/hypothetical protein |
? | CP006584 | 2414712 = | 0 (0.000) | coding (1018/1644 nt) | LY180_11545 | multidrug ABC transporter ATP‑binding protein |
GCGTTGATTATTACTTCACTGCTGATTATTCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTGCCATTAGCCGCCAGACGGTCGCGGAACGCCCGTCCCCACTC > CP006584/2030497‑2031055 | gcgTTGATTATTACTTCACTGCTGATTATTCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATa < 1:179228/298‑1 (MQ=255) ttGATTATTACTTCACTGCTGATTATTCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTg < 1:39249/298‑1 (MQ=255) cAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGt > 1:329426/1‑298 (MQ=255) gtagtgcggggtgCTTTGGCCGTAGGCGGGAACAGCTGGGTGGTTTGGCTGTTTTGTGGGGGCGGGTGGCCGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGGTACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATTGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTc < 2:100554/286‑1 (MQ=38) cTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCt < 1:164937/284‑1 (MQ=255) cTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCt > 2:164937/1‑284 (MQ=255) cTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCg > 1:232555/1‑298 (MQ=255) ccGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCa < 1:176370/298‑1 (MQ=255) cGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAg > 1:195280/1‑298 (MQ=255) aaCAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGCCACAGCGcc > 1:273802/1‑298 (MQ=255) tGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTTAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGCCCTGTAGATACTGTTATGGCCTGCACGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGTTTGCACGCAGGCCCGACCCAGCGCCGTCCGGCCCTTGTTTGTTc > 2:160150/1‑298 (MQ=255) tggGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTGTTTTTTTCATCCCTTc < 1:197555/298‑1 (MQ=255) ggTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATCTAGATACCGTTATGGCCTGCAAGCTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATCCCACGCCCGCCAGACCCCGCCCCGCCCGGCCCTGTTTTTTTCCCACCTTCCCCGCATTTTACCCCCCTccccc > 2:162547/1‑296 (MQ=255) tAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGCCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTa > 1:284693/1‑298 (MQ=255) ggttgtacgtaggCCGGCGGGTGACTGTGTGCTGCTATGTGCGGTACTTTTCTTTATTCTCAGGTTGTTGAAAACGCCTCCCAGTGCATCTATCGCGTAACAGATGTTGCGGATGCGGTGCGCGCGCCTTTTCCGACCTACATCGTTCGTGCGACATTTAGATACTGTTATGGCCGTCAAGTGTTTGCCTGGTCCGGTTTCCCGTATTGCATGCATGCCAGACACAGCGCTGTCAGTCGCTGTTTTTTGCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCAt < 2:273802/286‑1 (MQ=9) gcggGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGa > 1:31666/1‑298 (MQ=255) gtgCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATa < 1:160150/298‑1 (MQ=255) tgCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATAc > 1:298680/1‑298 (MQ=255) gggaccttttatgtatTCTGTATGTGATGAAGAAGCAGGCAAGCTAATCTTTCGCTGAACACATTTGGCGGATGGGGGGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGGCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCGGACACAGCGCCGTCAGGCGATGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCtgt < 2:128215/290‑1 (MQ=14) tatttattCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTg > 1:107943/1‑298 (MQ=255) aaGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTTCGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCCTCGCGCCGAGAATCAc > 1:294824/1‑298 (MQ=255) tGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTGCCATTAGCCGCCAGACGGTCGCGGAAc > 1:212983/1‑298 (MQ=33) gggggcCTTTACCGACCGACATAGTTGGTGCGACATGTAGTGACTGGTATGGCCTGCAAGTTTGTTCCTGGTCCGGTGTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCCGGCGCTGTTTTTTTCGTCCCGTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTAAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTGCCATTAGCCGCCAGACGGTCGCGGAACGCCCGTcc < 2:232555/294‑1 (MQ=11) cTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTGCCATTAGCCGCCAGACGGTCGCGGAACGCCCGTCCCCACTc > 1:105530/1‑298 (MQ=31) | GCGTTGATTATTACTTCACTGCTGATTATTCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTGTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTGCCATTAGCCGCCAGACGGTCGCGGAACGCCCGTCCCCACTC > CP006584/2030497‑2031055 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |