New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | CP006584 | = 3379210 | 0 (0.000) | 30 (1.070) | 29/586 | 0.1 | 100% | intergenic (+78/‑164) | LY180_16040/LY180_16045 | membrane protein/membrane protein |
? | CP006584 | = 3672183 | NA (NA) | coding (474/477 nt) | LY180_17575 | membrane protein |
AAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCAGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGTTGTTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAAAACCGCTTTGGACCAGATCCGAAACTGGAACCTTAAAACAAATCTGCTCGCCGGATGTCTGACTCATCCGGCTTTTATCATCATGTTGATGA‑ATGAATAATTTACTAATGTTTATTTAAAATATTTCAATGTCGTTATATAAATTACCTATAAAAAACAACCATGTATTTATCTTAAATATCAAAACCTTTATAACATCCGAAAAAGAAAGATACGAATAGCATTTACACAATACCCGGAATAGACTTTCGTCACTTTTAATTAAAGGGATGTTTTTATGCAGTGGTATTTAGCCGTATTAAAAAATTATGTTGGTTTCTCTGGTCGCGCACGTCGTAAAGAGTACTGGATGTTTACTCTGATTAACGCCATCGTCGGCGCTATTATCAATG > CP006584/3378921‑3379488 | gctcagagcgttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactagcatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcagTAATGTTTATTTaaaa > 1:722‑M1/283‑298 (MQ=255) 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atatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcagTAATGTTTATTTAAAATATTTCAATGTCGtt < 1:56214‑M1/31‑1 (MQ=255) atcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcagTAATGTTTATTTAAAATATTTCAATGTCGTtat > 1:324351‑M1/266‑298 (MQ=255) tcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagccagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctccacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttactctttggggaaattatgaggggatttctcagTACTGTTTATTTAAAATATTTCAAGTtcgttcta < 2:162726‑M1/34‑4 (MQ=255) 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AAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCAGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGTTGTTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAAAACCGCTTTGGACCAGATCCGAAACTGGAACCTTAAAACAAATCTGCTCGCCGGATGTCTGACTCATCCGGCTTTTATCATCATGTTGATGA‑ATGAATAATTTACTAATGTTTATTTAAAATATTTCAATGTCGTTATATAAATTACCTATAAAAAACAACCATGTATTTATCTTAAATATCAAAACCTTTATAACATCCGAAAAAGAAAGATACGAATAGCATTTACACAATACCCGGAATAGACTTTCGTCACTTTTAATTAAAGGGATGTTTTTATGCAGTGGTATTTAGCCGTATTAAAAAATTATGTTGGTTTCTCTGGTCGCGCACGTCGTAAAGAGTACTGGATGTTTACTCTGATTAACGCCATCGTCGGCGCTATTATCAATG > CP006584/3378921‑3379488 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |