New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | = 4188086 | NA (NA) | 28 (1.000) | 27/586 | 0.2 | 93.3% | coding (17/1167 nt) | LY180_20005 | hypothetical protein |
? | CP006584 | = 4334576 | 2 (0.070) | coding (21/1734 nt) | LY180_20755 | membrane protein |
TGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCT > CP006584/4187826‑4188354 | tgctgcTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATg < 1:263318/298‑1 (MQ=255) tAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGt > 1:53091/1‑298 (MQ=255) ttCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTCGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGCTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATCCTTGCTACACAATAACAAGGCAAGCATTACTCGTGGCTGCAACCATACTAGCTCACAATTTAATCACACATGTTTACTCTTTCGGTAAATCATGAGTGGATCTCTCCGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCCCAATGTTAATGTATGGTACTTTCACCCCAgaa > 2:321284/1‑296 (MQ=14) aaCTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTg < 1:9236/298‑1 (MQ=255) aaCATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCTTccagatcggaagag > 1:216609/1‑286 (MQ=255) tatcGGGCGGTCCTGCTCAAAAACAAGGATGGGAAAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAATGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCGTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGATCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTg < 2:72360/295‑1 (MQ=255) cATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGaa < 1:186686/298‑1 (MQ=255) gAAAAAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAAc < 2:155864/298‑1 (MQ=255) cAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGac > 1:41445/1‑298 (MQ=255) cggagtgtcgggatAAAACAGTGAGAAATCGAGACGAACTAGCGACAGGTGGCTTAGTGATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTAATCGTTGCGGCAAACCTAAGAGCGCAGAATTAAGTCACTCATGGTTACGCTGTGGGGAAAGGATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGGCGGTTGCCGATCAGAATATTAATGCAGGGTAATGTCATCCGAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAGCCGCTAgtt < 2:258543/285‑1 (MQ=18) aCGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCg < 1:276264/298‑1 (MQ=255) aGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGAGGCAAAAGTGAACTAAGTGAATCATGAACTGACACAACCGCCCTTTATCGCAGCGAAAAATAAATCGCCCTTGGAAGCGACATTGAGAtaca > 2:243415/1‑295 (MQ=255) gAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCAtt > 1:146085/1‑298 (MQ=255) aCAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCaga < 1:243415/298‑1 (MQ=255) cTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCCGCACAAGTGAACTTAGTGAATAATGCACTGACACAAACGCTATGTATAGCCGAGAAAAAAAAATCGCACGTGGAAGCGCAATTGCGATTAGCGTTCATGGGTGCATTCTGTACGACAATACAAGTTGACCCGGCAGAGTAAGGAAGGTTTTc > 2:52475/1‑298 (MQ=25) tCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTCTGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCCCGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTAATCGCCGCGAAAAATAAATCGCACGTGGACGCGACATTGCGATTCCCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGAAATTCGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGctttat > 2:18733/1‑296 (MQ=255) tGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGGTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCtttt < 1:86943/298‑1 (MQ=255) tCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGAt > 1:55575/1‑298 (MQ=255) cacaTGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGt > 1:279942/1‑298 (MQ=255) tGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGtt > 1:246266/1‑298 (MQ=255) cTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCt > 1:295205/1‑298 (MQ=255) | TGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGTGTTGAGCACGGTCCGTTGCCCATCACAATGTTAATGCATGGTAATGTCATCCCAGCACTGGCAGCGGCAAAAGTGAACTTAGTGAATAATGAACTGACACAACCGCTATTTATCGCCGCGAAAAATAAATCGCCCGTGGAAGCGACATTGCGATTCGCGTTTGGTGGCTCATTCTCTACGACATTAGATGTTGCCCCTGCAGAGTATGGAAAGTTTTCTTTTGGTGAGGGCCAGTTTACTTTTAATGGTGATGGTAGTTCATTGTCT > CP006584/4187826‑4188354 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |