New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | = 1015351 | 1 (0.040) | 23 (0.820) | 21/586 | 0.4 | 95.8% | coding (178/858 nt) | LY180_04750 | formate transporter |
? | CP006584 | = 1154738 | NA (NA) | coding (35/636 nt) | LY180_05370 | hydrolase |
TCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATA > CP006584/1154447‑1154985 | tCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTcc > 1:233523/1‑298 (MQ=11) ttCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCTCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCAt < 1:114614/298‑1 (MQ=14) ggttggCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGGGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGc < 1:49878/298‑1 (MQ=255) gTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTgg > 1:86632/1‑298 (MQ=255) aGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACAt > 1:43452/1‑298 (MQ=255) ttAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACCTCTTGTTGTCTGCTTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCACCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATAAACATTCGATTATGGCCGCGCGTGGCTGCTGGGGTAGGGATCTCGCGTGGCATCGCAGCTAACATTAAATATGTTTGTGGTGGAatt > 2:293414/1‑298 (MQ=17) aGCTGTTGTGTCTTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGGAAAGAGAGGTTGGTAAAATATCGAGTTCGCGCATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCAGTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAattgat < 2:80361/298‑1 (MQ=255) gAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGa > 1:277030/1‑298 (MQ=255) tAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGc > 1:99455/1‑298 (MQ=255) aaaaTATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGcc < 1:70915/298‑1 (MQ=255) aaaTATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCg > 1:168236/1‑298 (MQ=255) cGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGACTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGttttt < 1:293414/298‑1 (MQ=255) ttCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGcac > 1:307819/1‑298 (MQ=255) ttgCAGATGTTGTTTTCTGATGATTGATTTTTCGATGAACGATTTGATTATATATAATGATTTGTATCCCCCTTAACGTAATGATGTTTAACAAAAT‑CATTGGGTGATTCATCAGTGCTCCGCATCATTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCTGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGcacc < 2:86632/296‑1 (MQ=255) gCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAAGTTTGATGGTGAAATTGATTGCAGAGGTAAAATGTGTTAGCCGCCGTATCTGTGTTTTTCCGGGTTTCAGTGGCCGGTTTTTgacaccc > 2:305362/1‑292 (MQ=25) gcaaatGACACGATGGGAATCTGCCTTATATTAATGATTTCTTCGAAAAT‑GATTAGGGGTGTTACCATTGCGCCGCATATCTGGAGCTTTGTTAGGTAGCGTAGCTGGCTACGAGTGGTTGATGGGGTAGGGGTCCTGCGAGGCAGCGAAGATAACATGAAAGATGTTAGGTGTGAAATTGATTGCGGCGGTGAAAGGTTTGGTTCGCTGGAGCTGAGTATTGCCGGGTTGCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGcaa < 2:296488/294‑3 (MQ=255) atatGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGc > 1:51/1‑298 (MQ=255) aCAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCaa < 1:246975/298‑1 (MQ=255) aTGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGc < 1:18532/298‑1 (MQ=255) tgtATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCata > 1:41919/1‑298 (MQ=255) tattccccTTAATTTGATTATTTTT‑CTAAAATGAATTGGGGTATTCATCATGGCTCCGCATCCTTGGTACTTCATTAACGTGCGTATCTGGCCGCGGGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGGGCGGCATCGAAGCTAACATGAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCAtata < 2:168236/292‑1 (MQ=255) | TCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAAT‑CATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATA > CP006584/1154447‑1154985 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |