| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006584 | 1312545 = | NA (NA) | 36 (1.280) | 33/586 | 0.1 | 100% | coding (17/1077 nt) | LY180_06190 | sodium:proton antiporter |
| ? | CP006584 | 1435623 = | 0 (0.000) | coding (698/951 nt) | LY180_06790 | universal stress protein E | |||||
CCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAACAGATCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTCCGCCGTGTTGCCGAGGAATGCTGCTGAAATACCGGTGCGTCCTACCGTGCCCAGAACCACAATCCCCGCCTGTAAGTGCTCCGCCAAATCAGGAATCACCTCTTCTGGCAGACCTTTTTCTACGTGCGTCATGTTTTCATTAATGCCGAATTTCTGCCGCAGAGCTTTCATTGCCAGCAAATGTTGCCCACGAATGGCATCGTTATAAACGCTCGGATCAAATTCCGGCAGTTCAATCGCGATATTAATTGGCGTTACTGGGTAAGCGCCAACCAGATGAACTTCGGTATGGTTGACTTGTTCTGCCAGTTCGATCGTCTCTTTGACCAGTTTTTCATTGAGTGCATTATGATACGGCTCTTCACTGGCGAGATTCACCGCCACCAGCGCCTTACCTCCTTCCGGCCACGGCTGGTCTTTCACCATCCACACCGGGCTTGGGCAT > CP006584/1435334‑1435910 | acgagcagctcagagcgttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctcacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaacactactagcccaaactttattaacaaatggttacgctttgtggaaatgaagggtggatctatcagcgacaaaat > 2:158509‑M2/290‑291 (MQ=255) gatctctcgggCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAACAGATCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTCCGCCGTGTTGCCGAGGAATGCTGCTGAAATACCGGTGCGTCCTACCTTGCCCAGAACCACAATCCCCGCCTGTAAGTGCTCCGCCAAATCAGGAATCACCTCTTCTGGCAGACCTTTTTCTACGTGCGTCATGTTTTCATTAATGCCGAATTTCTGCCGCAGAGCTct < 1:140433‑M1/293‑3 (MQ=255) tttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcagCGCAGAGCTTTCATTGCCAGCAAATGt < 1:336386‑M2/27‑1 (MQ=255) agagTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAACAGATCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTCCGCCGTGTTGCCGAGGAATGCTGCTGAAATACCGGTGCGTCCTACCGTGCCCAGAACCACAATCCCCGCCTGTAAGTGCTCCGCCAAATCAGGAATCACCTCTTCTGGCAGACCTTTTTCTACGTGCGTCATGTTTTCATTAATGCCGAATTTCTGCCGCAGAGCTctgatgaatcccctaatgattttggtaaa > 1:120925‑M1/1‑269 (MQ=255) cctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagaacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaaccgttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgccaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggagattatgaggggatccctcatCGCAGATCTTTCATTGCCAGCAAACATTGCCCACGAATGGCatcgtacac > 2:167302‑M2/249‑294 (MQ=255) cttcttCGTCATCCAGTTCACCGGGTGTATGTTACTGGTCAGGTTTAAAGACCAACAGCTAGCAGCGAAGATGAGAAATCACCTGTGCCGCCGTGGTGCCAAGGAATGCTGCTGAAATACCGGTGCGTCCTACCGTGCCCAGAACCACAATCCCCGCCTGTAAGTGCTCCGCCAAATCAGGAATCACCTCTTCTGGCAGACCTTTTTCTACGTGCGTCATGTTTTCATTAATGCCGAATTTCTGCCGCAGAGCTctgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaag < 2:120925‑M1/298‑45 (MQ=255) cttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcagCGCAGAGCTTTCATTGCCAGCAAATGTTGCCCACGAATGGCATCGTTATAAACGCTc < 1:141558‑M2/57‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |