| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006584 | 4496128 = | NA (NA) | 32 (1.240) | 26/538 | 0.1 | 94.6% | intergenic (‑2037/‑83) | LY180_21445/LY180_21450 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | CP006584 | 4565632 = | 2 (0.070) | intergenic (‑372/+82) | LY180_21775/LY180_21780 | hypothetical protein/lysine 2,3‑aminomutase | |||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
TAGTTGTTAAAATAACATAAATAGCCGTACTCACTCTATATAAACAGAAAAGAAAGGTTAATTATTGGTGTTAGCTATATAAAAAGTAACAACAGCAATGCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATACTGATGAATCCCCTAATGATTTTTATCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCAT > CP006584/4565337‑4565928 | tggaggtgacgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgctttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCaa > 1:274473‑M2/296‑298 (MQ=255)tggaggtgacgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCaa > 1:172208‑M2/296‑298 (MQ=255) ggaggtgacgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCaaa > 1:185400‑M2/295‑298 (MQ=255) ggggggacgattccctaacaatgggtggattgttttgatgttatgttttgtttgcgctttggttggcaggttacgggcaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagcggtggagtcgttttaagtgtaagtcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCaaaa < 2:84978‑M2/5‑1 (MQ=255) 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aggtgacgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAAt < 1:275698‑M2/6‑1 (MQ=255) ggtgacgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAATc < 1:259327‑M2/7‑1 (MQ=255) gttacatttaccttataatcggtagattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagatgtttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAATCa < 2:160541‑M2/8‑1 (MQ=255) gtgacgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggcccagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgctaagctgttacgtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgtttagtgatttttcgcgaaaccatttgtacatatgacacagtttgtctccacatcaaattaatctattttacAAAAATCa > 2:79639‑M2/291‑298 (MQ=255) gtgacgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggtgcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAATCa < 1:282657‑M2/8‑1 (MQ=255) gtgacgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAATCa < 1:316534‑M2/8‑1 (MQ=255) gtgacgagtaacgaacaatcggtctgttcgtttgatgttatggtgtgttctcgcttggggtgggaggttacggtcaagttcggtaagagtgggagttgtacaggcaagtaatgagttgcaagccagcggtaaggtgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattgttaaagagagtcgtgtaaaatatcgaggtcgcacatcttgttgtctgattgttgatttttcgagaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacgtaatgatttttacCAAAATCa < 2:250992‑M2/8‑1 (MQ=255) tgacgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAATCAt > 1:335280‑M2/290‑298 (MQ=255) tgacgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgattttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAATCAtt > 1:215651‑M2/289‑298 (MQ=255) gacgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcgagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAATCAtt < 1:39589‑M2/10‑1 (MQ=255) gacgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAATCAtt > 1:14202‑M2/289‑298 (MQ=255) aggtttacgttagtatcgggcgttttggttggtggtattgtttgttttcgcttgggttggcaggttacggccaagttcggtaagtgggagagttttacagtcaagtaatgcgtgtcaagccaacgttaagtagttgaggcgttttaagtgtaattcggggaagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaaattaatgatttttacCAAAATCATTa < 2:237305‑M2/11‑1 (MQ=255) acgattacttaacaatcggtcgattctttggagtttatgttttgttctcgctttgggtggcaggttacgggcaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAATCATTa < 2:124678‑M2/11‑1 (MQ=255) acgattacctaatgagtggtcgattctttttatgttagtgtttgttctcgttttggttggcagggtacgggcaagttcggtaagagtgagagttttacagtaaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAATCATTa < 2:165354‑M2/11‑1 (MQ=255) acgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgttttttcgcgaaaccatttgttcatatgacaagatgtttatctaccttaacttaataatttttatCAAAatcaaat > 2:194668‑M2/288‑295 (MQ=255) 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cgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAATCATTAg > 1:184434‑M2/287‑298 (MQ=255) cgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAATCATTAg > 1:78278‑M2/287‑298 (MQ=255) cgattacctaacaatcggtcgattcgtttgatgttatgttttgttctcgctttggttggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttacCAAAATCATTAg < 1:136199‑M2/12‑1 (MQ=255) 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TAGTTGTTAAAATAACATAAATAGCCGTACTCACTCTATATAAACAGAAAAGAAAGGTTAATTATTGGTGTTAGCTATATAAAAAGTAACAACAGCAATGCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATACTGATGAATCCCCTAATGATTTTTATCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGTTTCGGCACCAGATATCCCGACACCAGTGTCAGCAACTCACGCATAATCTGCCGTGCTTCGTCATCACTCACCATAAAATGCGCCGCGCCCTGTACTTTATCGAGCACATGCAGGTAATACGGCATTACGCCGGCATCGAACAACGCAT > CP006584/4565337‑4565928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |