| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP006584 | 1644444–1644851 | 1645191–1644923 | 73–748 | 6 [5] | [5] 6 | LY180_07765/LY180_07770 | transposase/sulfatase |
CATCACTGACAAATGAGCGGTGTGGTGTTACTCGGTAGAATGCTCGCAAGGTCGGCTAGAAATTGGTCATGAGCTTTCTTTGAACATTGCTCTGAAAGCGGGAACGCTTTCTCATAAAGAGTAACAGAACGACCGTGTAGTGCGACTGAAGCTCGCAATACCATAAGTCGTTTTTGCTCACGAATATCAGACCAGTCAACAAGTACAATGGGCATCGTATTGCCCGAACAGATAAAGCTAGCATGCCAACGGTATACAGCGAGTCGCTCTTTGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATT > CP006584/1644912‑1645489 | gctgcgctggaaaTGGGCGGTGTGGTGGTAGTCGGTAGAATGCTCGCAAGGTCGGCTAGAAATTTGTCATGAGCTTTCTTTGAACATTGCTCTGAAAGCGGGAACGCTTTCTCATAAAGAGTAACAGAACGACCGTGTAGTGCGACTGAAGCTCGCAATACCATAAGTCGTTTTTGCTCACGAATATCAGACCAGTCAACAAGTACAATGGGCATCGTATTGCCCGAACAGATAAAGCTAGCATGCCAACGGTATACAGCGAGTCGCTCTTTGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATc < 2:160386/288‑1 (MQ=2) tcgtgggaaaTGATCGGTGTGGTGTTACTCGGTAGAATGCTCGCAAGGTCGGCTAGAAATTGGGTATGAGCTTTCTTTGAACATGGCTCTGAAAGCGGGAACGCTTTCTCAGAAAGAGTAACAGAACGGCCGTGTAGTGCGACTGAAGCTCGCAATACCATAAGTCGTTTTTGCTCACGAATATCAGACCAGTCAACAAGTACAATGGGCATCGTATTGCCCGAACAGATAAAGCTAGCATGCCAACGGTATACAGCGAGTCGCTCTTTGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGt < 2:142560/291‑1 (MQ=2) ataCAGCGAGTCGCTCTTTGTGGAGGTGACGATTACCTAACCATAGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGACACGTTCGGTACGCGTGAGAGTTTTACAGTCCAGTAATGCGAGGCAAGCAAACGATAAGCTTATGAGACGTTTAATGTGTAATTAGGGGCAGAAATGGTAAAGAGAGTCGTTTAACAGACCAAGTTCGCACATATTGTTGTCTGATTATTTCTTTTTCGCGAACCAATTTTATCATATTACAAGAttgatatacacctt > 2:264077/1‑285 (MQ=1) aGCGAGTCGCTCTTTGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAAAGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGGGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAACTATAGAGTTCGAACATCTTGTTGTATGATTATTTATTTTTCCCGAGACCACTTGATCCTATGACAAGATTTGTAttccacttaact > 2:136679/1‑287 (MQ=1) gTCGCTCTTTGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGTCGATCCGTTTGCTGTTATGTTTTGTTCTCGCGTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGTCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTAGTTTTAAGTTTAATTCAGGGCAGCAATGGTAAAGAGAGTCGTGTAACATATCGAATTCGCACCACTTGTTGTATGATTATTGATTTTTCGCGAACACATTTGACCAATTGACTAGATGTTTTTCTCCCGTAACATAAtt > 2:281756/1‑297 (MQ=11) gACGATTACCTAAAAATCGGTCGAGTCGTGTGATGTTATGTTTTGTTCCCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGTGTGAGCGTTTTCCAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCTAACGCTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTGGGCGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGCATTAGCACATCTAGTTCTCTGATTATTGATTTGTAGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTTTATCTACCTTAACTTAATGCtttttacgcaaatcgat > 2:57676/1‑285 (MQ=1) | CATCACTGACAAATGAGCGGTGTGGTGTTACTCGGTAGAATGCTCGCAAGGTCGGCTAGAAATTGGTCATGAGCTTTCTTTGAACATTGCTCTGAAAGCGGGAACGCTTTCTCATAAAGAGTAACAGAACGACCGTGTAGTGCGACTGAAGCTCGCAATACCATAAGTCGTTTTTGCTCACGAATATCAGACCAGTCAACAAGTACAATGGGCATCGTATTGCCCGAACAGATAAAGCTAGCATGCCAACGGTATACAGCGAGTCGCTCTTTGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATT > CP006584/1644912‑1645489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |