New junction evidence | |||||||||||
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? | CP006584 | = 4334576 | 1 (0.020) | coding (21/1734 nt) | LY180_20755 | membrane protein |
ATAGCCGAACGAGCAGCTCAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP006584/4187790‑4188086 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TCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCT > 1:102356/1‑242 gcgaAGAAAAAAGTGTGGGCCACGCCCTTCCGGGCTAACACAGTGAAAAATCGAAACGTACTCTCAACATTGCGCATAGGCATGGAAGTTTTGGGGCAATCTGGCTACACAAAAACAAGGGAAGACTTACTCGTTGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAAGTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAATCCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACAT < 2:37030/294‑1 GCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACAT < 1:174752/298‑1 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TACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACT < 2:415248/200‑1 atTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGG < 1:96080/296‑1 GGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGA > 1:331270/1‑298 ATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTAACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATT > 1:133796/1‑298 TGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTG > 1:65616/1‑298 TACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGC > 1:352799/1‑298 aaACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTTAAAATTTATTCACACATGGTTACGGTTTGGAGAAATTATGAGGGGATTTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCTTGGGTTGGGAACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCGCTACTCTGCTACAGGCCATTAGTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCCCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCA < 1:358341/296‑1 ATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAAT < 1:334304/298‑1 CAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGC > 1:345697/1‑298 AAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGCAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCCACGGCATTCGCGACTCGCTGGTATTCAGCTCGCTGTGGTCGAGCCCGGGATTCCCCTTTCCGCATCGTACTAAAATTTTTTCCCCTGTAATCGACGTGGgg > 2:186936/1‑296 ACTAGGTCAAGATTTATTCACAAGTGGTTACGCTTTGGGGAAAGTATTGGGGGATCGCTCAGGGCTAACCCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGTTCTACTTTGGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGC < 2:390105/298‑1 TTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACG > 1:18199/1‑298 TTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGCGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCCCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTCCCGCAGCGGATTAAACTTATTGCCGCAGTAAGCGGCGTGGTGCTCTGGGCGTCCTCTCTGGCGTCGCTACGCTACTACG > 2:140053/1‑298 ATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCA > 1:332951/1‑298 TTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCAT < 1:134258/298‑1 ACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAAACGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTA < 1:105213/298‑1 ATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCCGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTTTGGCGGCGCTTTTCTACTCCGTCCTCTACGGG > 2:332600/1‑298 CGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGT > 1:369943/1‑298 TTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTAATGGCTTAACCCCTTTTTATCTGGAAAGCCCTGTGTTGGTGACTGCTCTTCTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCT < 2:344700/298‑1 GATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTCCGTCATCTACGGGCAGGCGTTCTCGCGGAGCGTTCTGTTTtt > 2:374602/1‑296 CTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTTGTGAT < 1:41343/298‑1 ATAGCCGAACGAGCAGCTCAGAGCGTTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP006584/4187790‑4188086 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTTGTGAT < CP006584/4334576‑4334286 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |