New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | = 2568641 | 44 (1.060) | 3 (0.070) | 3/586 | 5.3 | 7.3% | coding (521/1164 nt) | LY180_12200 | multidrug transporter |
? | CP006584 | 2777616 = | 32 (0.770) | intergenic (‑10/+2) | recO/LY180_13165 | DNA repair protein RecO/GTPase Era | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TAAAGATCGCTGATAATATTGACCGATTGACCAATCCGTACATCCGTGAGTTGTGTTTCTTTAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACG > CP006584/2568347‑2568937 | tAACGATCGCTGATAATATTGACCGATTGACCAATCCGTACATCCGTGAGTTGTGTTTCTTTAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAg < 1:21819/298‑1 (MQ=255) aaaGATCGCTGATAATATTGACCGATTGACCAATCCGTACATCCGTGAGTTGTGTTTCTTTAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTACTATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTTTGTTCATTATTAAAGCTTTTTTCGCTTTATTAgt > 2:126599/1‑297 (MQ=255) tggCTGATAATATTGACCGATGGGCAAATCCGTACATCGGTTGGATTTGTTAGCTTGAAGTGTCCATTAACCCCCATTTGCCATTCCGGTACGACAGCCATTTACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGATATCGTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAAACGGAATCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCATGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGa < 2:271293/296‑1 (MQ=255) tCGCTGATAATATTGACCGATTGACCAATCCGTACATCCGTGAGTTGTGTTTCTTTAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGa > 1:349490/1‑298 (MQ=255) taataTTGACCGATTGACCAATCCGTACATCCGTGAGTTGTGTTTCTTTAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGc > 1:396693/1‑298 (MQ=255) atTGACCTATTGACCAATCCGTACATCCGTGAGTTGTGTTTCTTTAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTc < 1:189364/298‑1 (MQ=255) gACCGATTGACCAATCCGTACATCCGTGAGTTGTGTTTCTTTAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAAt > 1:45472/1‑298 (MQ=255) tacccAGTCCGGACATGCGGAGGTTGTGTTACTTTAACGGGTGCATTACCCCTGATTTGTCGTGCCGGTGCGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTTAACACTGCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATTCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCtt < 2:322508/295‑1 (MQ=255) gaccatccattACATCCTGGAGGTTTGTTTTTTTAAAGTTGGCATTAACCCACATTGGACGGGCCGGTCCGACAGCCAATAACGATTGTCCGGGGCGCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGAGCGTTTAGGCGCCAACCATGCTGCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAAAGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATGAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGAttt < 2:131113/288‑1 (MQ=255) aTCCGTACAGCCGTGAGTTGTGTTTCTTTAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGATAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGTCGGTAACCGGACTCTTAATATACTTACCTTTACGCGCCAACAAGGCTTCTTTAATCGCTCACGCATCATCAGCGACTTGTGCCTGACGGTTTAACGGTCAGTACCTTATTCTAGCTTTATTCGCTTTATAAGCTGGGATCGCGTCATTTATTGcctcctttatat > 2:191481/1‑288 (MQ=255) tCCGTACATCCGTGAGTTGTGTTTCTTTAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGcc < 2:56912/266‑1 (MQ=255) tCCGTACATCCGTGAGTTGTGTTTCTTTAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGcc > 1:56912/1‑266 (MQ=255) cGTGAGTTGTGTTTCTTTAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTa > 1:67477/1‑298 (MQ=255) tttAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTcc < 1:362399/298‑1 (MQ=255) tttAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTcc < 1:52323/298‑1 (MQ=255) ttAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCa < 1:150017/298‑1 (MQ=255) aGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGt < 1:73091/298‑1 (MQ=255) tAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACgg < 1:107122/298‑1 (MQ=255) tgtGTCCGGGGCTCCCTGTTTGGCCGACCTGAACACTTATCTGGGCAATATGGCCGGTAACCCGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTtata < 2:396693/296‑1 (MQ=255) tCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGa > 1:285277/1‑298 (MQ=255) actcgttCGCCGACCGTACCACTTCTCTGGGCGAAATAGCCGGTAACCGGACTGTTAATATCCCTACGGTTAGGCGCCAATCAGGCTGCTTTAGGTGGATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGAtt < 2:182430/293‑1 (MQ=255) cTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTTTTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATTCTCAAGCGTTTATTTTACATTAACACCCTGCTTCGCTACAGGCACTCGACGGTTATAATTTTTTAAAGAttt > 2:385396/1‑297 (MQ=255) cTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGAttg > 1:334116/1‑298 (MQ=255) cGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATa < 1:362031/298‑1 (MQ=255) ccGACCTGAACACTTCTCTGGTCAATAAGGCCGGTAACCGGCATTTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTTGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACt < 2:349490/298‑1 (MQ=255) ccGAACTGACCACTGCTTTTGGCAATATACCCGTTAACCGGACTCTTACTATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACt < 2:285277/298‑1 (MQ=255) aGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACt > 1:69039/1‑298 (MQ=255) gTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTTAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTTTTCCTGAATAATTGCCGCAGCGACTCCGGCACTGCAtt > 2:408681/1‑298 (MQ=255) tAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTg > 1:149877/1‑298 (MQ=255) aCCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGtt < 1:91525/298‑1 (MQ=255) ggCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAAACCCCTGCTTCGCTAACGGCCCTCGACGGTTATACTCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGGCACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGGAAGTATTGTTTTTTCGTTTGCAGAAAAatg > 2:23972/1‑297 (MQ=255) gTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGat < 1:126599/298‑1 (MQ=255) ttcatagtcTTGTGGCTGACGGTTTATTGGGTTGTTCATTATTAAAGCTTTATGCGGTTTCTAGGGTTGGTGTGGGGCATTGAAGGCCGCTTTGCGAATTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTTTTTTGAAATAACCCCCTTCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTa < 2:264096/290‑1 (MQ=255) acagACTTGTGGTTGACGGTTTAATGTGTTGGTTATTATTAAATCTTTATTCGCTTTATTAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTg < 2:157682/295‑1 (MQ=255) agtgcTTGTGGCTTACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCGGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTTCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGa < 2:334116/294‑1 (MQ=255) ataattGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGTTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAg < 2:149877/294‑1 (MQ=255) aCTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTg < 1:324353/298‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAACTAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCAACTTCGGAACGGCATTGTTTATCCTGTCAGATTAGTTTTTTCGTTTGCCGAACCATAGTTGCCAGATAATTTTTAGCGTTATGGTGTGct > 2:155468/1‑297 (MQ=255) agTTTAAGTGTGTGTTAATTATTAAAGCTTTATTAGCTTGATAAGTCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCGTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATc < 2:238909/297‑1 (MQ=255) ttAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGt > 1:134556/1‑298 (MQ=255) ttCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCTTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTg > 2:20438/1‑298 (MQ=255) aaGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAAt < 1:18820/298‑1 (MQ=255) aaGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAAt > 1:428494/1‑298 (MQ=255) tATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCAcc > 1:287578/1‑298 (MQ=255) ataAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACg > 1:108014/1‑298 (MQ=255) | TAAAGATCGCTGATAATATTGACCGATTGACCAATCCGTACATCCGTGAGTTGTGTTTCTTTAAAGTTGGCATTAACCCACATTTGACGTGCCGGTACGACAGCCATTAACGATTGTCCGGGGCTCACTGTTTCGCCGACCTGAACACTTCTCTGGGCAATATAGCCGGTAACCGGACTCTTAATATCCGTACGTTTAAGCGCCAACCAGGCTTCTTTAGTTGCATCCGCCGCTTCAACGACTTGTGGCTGACGGTTTAATGGTGTGTTCATTATTAAAGCTTTATTCGCTTTATAAGCCTGGATAGCGGCATTCAATGCCGCTTTGCTACTTATTAACGTATCTTTGGTATGCTCCAGCGTTTCTTTTGAAATAACCCCCTGCTTCGCTAACGGCACTCGACGGTTATAATCTTCTAAAGATTGTTGATACTGAATACGTGCTGAAGCGACTTCGGCACTGTATTGTTTATCCTGTAAGTATAGTTTATTCGTTTGCCGAACAATATTTGCCAGATTATTTTTAGCTTTATTGAGTGCGATAGTGGCATCAGTTTTATCCAGTGAAACTAAAATGTCACCTTGTCGAACG > CP006584/2568347‑2568937 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |