| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP006584 | = 3379210 | 4 (0.100) | 43 (1.040) | 40/586 | 0.1 | 91.5% | intergenic (+78/‑164) | LY180_16040/LY180_16045 | membrane protein/membrane protein |
| ? | CP006584 | = 3672183 | NA (NA) | coding (474/477 nt) | LY180_17575 | membrane protein | |||||
GAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCAGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGTTGTTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAAAACCGCTTTGGACCAGATCCGAAACTGGAACCTTAAAACAAATCTGCTCGCCGGATGTCTGACTCATCCGGCTTTTATCATCATGTTGATGAATGAATAATTTACTAATGTTTATTTAAAATATTTCAATGTCGTTATATAAATTACCTATAAAAAACAACCATGTATTTATCTTAAATATCAAAACCTTTATAACATCCGAAAAAGAAAGATACGAATAGCATTTACACAATACCCGGAATAGACTTTCGTCACTTTTAATTAAAGGGATGTTTTTATGCAGTGGTATTTAGCCGTATTAAAAAATTATGTTGGTTTCTCTGGTCGCGCACGTCGTAAAGAGTACTGGATGTTTACTCTGATTAACGCCATCGTCGGCGCTATTATCAATGTCATTCAATTGATTT > CP006584/3378920‑3379503 | gctcagagcgttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcagTAATGTTTATTTaaaa < 1:336159‑M1/16‑1 (MQ=255) cttagatcgttttgttatcatgatgctattcgcccggatgcttcaactaacatggtggcttgcgggcgttcctgctcagaaacaaagttgggacaagcacttccaggctaacacaggcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcagTAATGTTTATTTAAAat > 2:300219‑M1/282‑298 (MQ=255) agcgttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcagTAATGTTTATTTAAAATATTTc < 1:320554‑M1/22‑1 (MQ=255) aTCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCAGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGTTGTTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAAAACCGCTTTGGCCCAGCTCCGACACTGGAACCTTAAAACAAACCCGCTCCCCGCATGTCTGACTCATCCGGCTTTTACACTCATGTTGAAGAATGAATAATTTACTAATGTTTActaatgaattccc > 2:156998‑M1/1‑285 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |