New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | 1015342 = | 2 (0.050) | 44 (1.060) | 41/584 | 0.1 | 95.7% | coding (187/858 nt) | LY180_04750 | formate transporter |
? | CP006584 | 1153411 = | NA (NA) | intergenic (‑823/+12) | pgaA/LY180_05365 | poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine export protein/hypothetical protein |
TATCTATTAATAATAGAAAGGGATCTACAACCTACAGATTGGTGTAGCTTTATGGAAAAAGACTATTTGAGAATTAGTAGTACTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTAGCAGCATGATATCAAAACGCTCTGAGCTG > CP006584/1153124‑1153693 | tatCTATTAATAATAGAAAGGGATCTACAACCTACAGATTGGTGTAGCTTTATGGAAAAAGACTATTTGAGAATTAGTAGTACTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCTATCATGTTTCATTTATTTTTTAGCAGTTGTATTTCATTTATGATCGTAGGCATTTTTCAAACTTTATTATTAGTTTTGAGAGATcgc > 2:112074/1‑296 (MQ=255) tatATTAATAATAGAAAGGTATCTACAACCTATAAATGGGTGTAGCTTTATGGAAAAAGATTATTTGAGAATTAGTAGTACTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTTGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCt < 2:47931/296‑1 (MQ=255) ataataGAAAGGGATCTACAACCTACAGATTGGTGTAGCTTTATGGAAAAAGACTATTTGAGAATTAGTAGTACTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTCATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTTTTTCATTTATGACCGTAGGCATTTTTCAAACTTTATACTTATTTCTGAAAGATCCCTTCATAAtt > 2:330534/1‑298 (MQ=255) gATCTACAACCTACAGATTGGTGTAGCTTTATGGAAAAAGACTATTTGAGAATTAGTAGTACTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTTTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGt > 1:12283/1‑298 (MQ=255) cTACAGATTGGTGTAGCTTTATGGAAAAAGACTATTTGAGAATTAGTAGTACTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCAtgtgt > 1:191595/1‑298 (MQ=255) tGGAAAAAGACTTTTTTAGAATTGGTAGTAATGTATTAGTGTGCTTATTGTTTGGGGTGGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGAGCAACCTATCTGATTGTAATGATTGATTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCtagtag < 2:106401/298‑1 (MQ=39) aaaaaGACTATTTGAGAATTAGTAGTACTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGt < 1:330534/298‑1 (MQ=255) tATTTGAGAATTAGTAGTACTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCa < 2:91825/298‑1 (MQ=255) aaTTAGTAGTACTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACg < 2:355578/292‑1 (MQ=255) aaTTAGTAGTACTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACg > 1:355578/1‑292 (MQ=255) gtaCTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGCAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTACTGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTTTTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAATCTGTATACTTAGTTATGAGAGATCCCCTCATAATTTCCTCAAAGCGTAAACATGTGTGAATAAATTTTATTACCGTCGGTTTGCAGTCACGGGTACGTCTTACCt > 2:100650/1‑298 (MQ=255) gtaCTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCt > 1:61333/1‑298 (MQ=255) taCTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCtt > 1:124933/1‑298 (MQ=255) gTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGCTTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCATTTTGATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTCGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTCACCATGTGTTAATAAATTTTGATCTAGTACGTTTCCAGCAACGAGTAAGTCTGCCCCTGTTa > 2:234368/1‑298 (MQ=38) gTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTgtgt < 1:112074/298‑1 (MQ=255) gAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAg < 1:28835/298‑1 (MQ=255) gtttggtgttggtAAATATTTGGTTTAATGAGCCAGTCGTTGTAGAAGTTGTTTCCCTATCAACCTATTTTTTTGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTTCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTATGGAATTTTCAAACTATATACTTATTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAGATTTTGAGCTAGTAGGGGTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTAGTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTc < 2:295466/297‑1 (MQ=21) ttggttttggtGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCa < 1:316151/298‑1 (MQ=255) ttttggtGAATAGTTGGTTTAATCAGACAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGcc < 1:300818/298‑1 (MQ=255) aaTCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTa > 1:205956/1‑298 (MQ=255) ccAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTc > 1:244187/1‑298 (MQ=255) cAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGGAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCg > 1:37102/1‑298 (MQ=255) 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aCCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCt > 1:330702/1‑298 (MQ=255) ttGATGGTAATGATTTCTTTATTTTTTTTTTATACTGTTGCATTTATTTTTTTGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGGATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTccc < 2:330702/297‑1 (MQ=255) ggTAATGATTGTGTTTTTTTTTATCATTATGATTGCATTTATTTGTAGTTATTTTTATTTCTTATAGTACCGGTGGCATTTGTCAAACTGGATACTTAGTTCTGAGAGATCCCTTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATTTGTGAATAAATTTTGGACTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTTTGTGGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGACTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGGGCTCGTCCCAACCt < 2:34059/298‑1 (MQ=14) aTGATTGCTTTATTTTTTTTCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCACACTGTATATTTAGTTCTGAGCGATCCCCTCATAATTCCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCAACGAGTAAGTCGTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCCCAAACCTTCCATCCCTAATCAAATTGTGCAGAGCACATTTCGATTTCTGATTGTTTTAGCTGGGATGTACTTGTcacatcttcgtt > 2:42723/1‑290 (MQ=18) tGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTTTTTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAATCGAACTGTTTAAAGGTCGGTTCAATTTCTGACTGTCTTAGCCTGGGAGTGCTTGGTCCAACCtttttt > 2:54546/1‑298 (MQ=18) aTACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAg > 1:196005/1‑298 (MQ=255) gTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCAACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTTAGGATACGTTTCAATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCATCCTTGTTTCTCAACATGCACACCCGCAAGCCagc > 2:112991/1‑296 (MQ=17) ttCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTa < 1:371813/298‑1 (MQ=255) gTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTAGCAGCATGATATc > 1:53884/1‑298 (MQ=40) cAATTTTCAAATTGTTTACTTATTTTTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGGTGGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTAGCAGCATGATATCAAAAc < 2:124933/298‑1 (MQ=255) aaTTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTAGCAGCATGATATCAAAACg > 1:17726/1‑298 (MQ=38) cTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGCATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTATGTAGTCAGAATGCCGCAAAACTTGCATGCCTAAGCGAACTGTTTAGAGTACGTTGCGCTTTCTGACGTTGTTATCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTAAGCATGCACTCCCGCAAGCCAACACGTTAGTTGATGCATCCGGGCTTATATCAGAATGATCGCAAAAACCTCTgttctg > 2:2630/1‑293 (MQ=11) | TATCTATTAATAATAGAAAGGGATCTACAACCTACAGATTGGTGTAGCTTTATGGAAAAAGACTATTTGAGAATTAGTAGTACTGTATTAGTGAGCTTATTGTTTGGGCTTGCTTTGGTTTTGGTGAATAGTTGGTTTAATCAGCCAGGCGTTGAGGAAGTTGTTCCACGATCAACCTATCTGATGGTAATGATTGCTTTATTTTTTATCGATACTGTTGCATTTATTTTTATGCAGTTGTATTTCATTTATGACCGTAGGCAATTTTCAAACTGTATACTTAGTTCTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTGAGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTAGCAGCATGATATCAAAACGCTCTGAGCTG > CP006584/1153124‑1153693 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |