New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | = 1015351 | 2 (0.050) | 35 (0.840) | 34/586 | 0.3 | 94.6% | coding (178/858 nt) | LY180_04750 | formate transporter |
? | CP006584 | = 1154738 | NA (NA) | coding (35/636 nt) | LY180_05370 | hydrolase |
TTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCGGAAAT‑CCCAAATAT‑GAAATAGATG > CP006584/1154479‑1155022 | tttGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCt < 1:25293/298‑1 (MQ=255) gaGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGGGAGTTTTACATTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAg < 2:139852/297‑1 (MQ=255) aaGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATgggg > 1:92492/1‑298 (MQ=255) tAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATC‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTTCTCCGAATCACTGGCACCTCATTTAACTGCGTACCAGGACGCCAGTGGTTGATGGGGTCGGGaac > 2:3746/1‑296 (MQ=14) gagaGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGT‑ATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCgg < 1:414534/298‑1 (MQ=255) tttACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCg > 1:180464/1‑298 (MQ=255) gTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCCCTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCACCGAAGCTACCATTAAACATg > 2:172421/1‑298 (MQ=255) 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ttttAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTaaaa < 1:137220/298‑1 (MQ=255) aGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACATTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGttt > 1:338505/1‑298 (MQ=255) gtgtAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTg < 1:236756/298‑1 (MQ=255) aaTTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGat > 1:314728/1‑298 (MQ=255) aaGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTACTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCACCCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCATTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGTCGCGCGGGGCGGATGGGGTACGGAACCTGCGCGGCCTCGAAGCTAACACTAAAAATGTTTGAGGTGAAATGGATTGCAGCGGCAAAATGTTTTACTTGCTGGATCAGtttatttcag > 2:24791/1‑294 (MQ=18) gtgTCGTGTAAAATTTCGAGTTCGCACATCTTTTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGTTCATA‑TGACAAGATGTGTATCCCCCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGttt < 2:175981/296‑1 (MQ=255) cGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCAt < 1:30693/298‑1 (MQ=255) atatctgagtCGTACATCTTGTTGTCTGATTATTTATTTTTCGCGAAACTGTTTGTTCATA‑TGACAGGATGTGTATCAGACTTAACTTAATTATTTTTACCAAAATCATTAGGGGAGTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAAGATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGt < 2:53841/289‑1 (MQ=255) cGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGttttt < 1:419781/298‑1 (MQ=255) gAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGAAAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATATTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTg > 1:183119/1‑298 (MQ=255) gttgtCTTTTTTTTGATTTTT‑TCGTAAACTTTTGTGTATATTGACATGAAGTGTTTCACCATTAACTTAATGTTTTTTACGAAAATCATTAGGGGATTCATAAGTGCTCCGCATCTCTGGCACTTCGTTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGAGCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAATTTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAg < 2:102145/298‑1 (MQ=255) gttgtCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAg > 1:264039/1‑298 (MQ=255) tttGATTTTTCGCGAAACCATTTTACCATA‑TTACAAGTGGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGTTTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATaca < 2:180464/297‑1 (MQ=255) tttCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCga < 1:3746/298‑1 (MQ=255) aaCCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGAGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAACTTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCAGGTTTTAGTGAGCCGGTTTTTGCACCAAATGCAAAATCCACCAATACACAAGCggtagcccac > 2:200257/1‑289 (MQ=38) aTCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGCATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGcc > 1:117179/1‑298 (MQ=255) ata‑tGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCCTTAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATAAAAAAGCGATGATAGCCACTTTCGCCaag > 2:10736/1‑296 (MQ=255) tttttACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTCAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTTCCGGTTTTCATGATCCGGTTTTTGCACCAAATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGCTAATCGCCACAACCGCCAACGCAAGTGCGCAATAAATAAGCCAACCCGGAAAc‑cc > 2:56985/1‑298 (MQ=255) tACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCGGAAAT‑CCCaaa < 1:254145/298‑1 (MQ=255) tCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGAAAAAGCAACCAATACACAACCGATGGTCCCCACTAACGCCCGCCGCAAGGTGCATAAAAAAAGCCAACCCAGAAATACACAAAT‑T‑GAAAt > 2:414/1‑298 (MQ=255) ttAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGCTGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGTAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGATCCGGTTTTTGCTCCACATGCCAAAGCGACCAATACCCAAGCGATGATCCGCACTTTCCCCCCCAGCACAGTCCTAGTCATACACCCTCCAGGAAAT‑CCCCAATATCGAAATac > 2:317658/1‑297 (MQ=255) atgggtATTCATCATGGCGCGGCAGCACTGGCACTTCATTAGCATGCGTATGTGGCCGAGAGTGGTTGATGGGGGAGGGATACTGCGCGGCAACGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCGGAAAT‑CCCAAATAT‑GAAATAGAt < 2:92492/296‑1 (MQ=255) aGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAACCGACCAATACACAAGCAATGTCCGCCACTCACGCCAGCGGCAATGTGCCTCTAATAAACCATCCCGCAACT‑CCCCAACAT‑AAAATAGAtc > 2:282353/1‑297 (MQ=255) | TTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATA‑TGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCGGAAAT‑CCCAAATAT‑GAAATAGATG > CP006584/1154479‑1155022 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |