| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP006584 | 1312545 = | NA (NA) | 44 (1.060) | 40/586 | 0.1 | 100% | coding (17/1077 nt) | LY180_06190 | sodium:proton antiporter |
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AATAGGCCCGATAACTCGGGCCTTGTCAGTTATTGAAGAGTCGTTAATCGTCTTCTTCGTCATCCAGTTCAACGGGTGTCTGATACTGGTCAGGTTTAATGACCAACAGATCGCAGCGAAGATGATCAATCACCTGTTCCGCCGTGTTGCCGAGGAATGCTGCTGAAATACCGGTGCGTCCTACCGTGCCCAGAACCACAATCCCCGCCTGTAAGTGCTCCGCCAAATCAGGAATCACCTCTTCTGGCAGACCTTTTTCTACGTGCGTCATGTTTTCATTAATGCCGAATTTCTGCCGCAGAGCTTTCATTGCCAGCAAATGTTGCCCACGAATGGCATCGTTATAAACGCTCGGATCAAATTCCGGCAGTTCAATCGCGATATTAATTGGCGTTACTGGGTAAGCGCCAACCAGATGAACTTCGGTATGGTTGACTTGTTCTGCCAGTTCGATCGTCTCTTTGACCAGTTTTTCATTGAGTGCATTATGATACGGCTCTTCACTGGCGAGATTCACCGCCACCAGCGCCTTACCTCCTTCCGGCCACGGCTGGTCTTTCACCATCCACACCGGGCTTGGGCATTTGCGTAAC > CP006584/1435327‑1435919 | tagccgaacgagcagctcagagcgttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcagcg > 1:392269‑M2/297‑298 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |