| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP006584 | 3344744 = | NA (NA) | coding (163/330 nt) | LY180_15880 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
CATGCAATAAATACCGTTATCTTTTAATGGGATGGAACCATCCACAACCAACACATACTGCCCTTTGTACTTCTCAAGTGCGTTATGTTTGTTCTCTTCGACCTGATGACCGAAGGCGGCGGAAAGCACTTCGTGATACTCCAGAGAGATAGTCTCCAGCACGAGGTTTTCTACCGTTGGATGCGTTGCACGAAGCAGAGATTCCGTACAACCGGTGCACTCCTGCGCGCCAATCCAGATAACTGGCGGACGCTGCGGGTTAGTAACCGATTCGGCCATCTCTGCAGCGGCTTTGCTACTTAACCCCATGGTGGCGGCTAATGCTGCACAAAGCTTCATGAAATCACGACGGTTAATGCCGTGAGAATGGATGAGGGTGTTATCTCCAGTCATTTATAGTTATTCCGTTGCGAAGACCTGGCATATATTTTGCCTCAATCGCAAAATCAATAATGCGATCGATGCGCCATTTACCACACATTTATTATGGTTATCGATATCATGATACTGCGGCGGGGCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGTTT > CP006584/3268326‑3268904 | cATGAAATAAATACCGTTATCTTTTCATGGGATGGAACCACCCACAACCAACACATACTGCCCTTTGTACTTCTCAATTGCGTTATGTTTGTTCTCTTCGCCCTGATGACCGAAGGCGGCGGAAATCACTTCGTGATACTCCAGAGAGATAGTCTCCAGCACGAGGTTTTCTACCGTTGGATGCGTTGCACGAAGCAGAGATTCCGTACAACCGGTGCACTCCTGCGCGCCAATCCAGATAACTGGCGGACGCTGCGGGTTAGTAACCGATTCGGCCATCTCTGCAGCGGCTTTGCTa < 1:463644/298‑1 (MQ=255) 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caaaatcattaggggattcatcagTACTTAACCCCATGGTGGCGGCTAATGCTGCACAAAGCTTCATGAAATCACGACGGTTAATGCCGTGAGAATGGATGAGGGTGTTATCTCCAGTCATTTATAGTTATTCCGTTGCGAAGACCTGGCATATATTTTGCCTCAATCGCAAAATCAATAATGCGATCGATGCGCCATTTACCACACATTTATTATGGTTATCGATATCATGATACTGCGGCGGGGCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGataata > 1:226649‑M1/25‑298 (MQ=255) cGGCCATCTCTGCAGCGGCTTTGCTACTTAACCCtgagagatcccctcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagccacgagtaagtctcccctttttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaagcgacctgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagccttgaagtgcttgtccctaccgtgtctcttagcctaaacgccagccagccaccacgctcgttcaagcatccgggctcttagcagcacgag < 2:349908‑M2/298‑265 (MQ=255) atcattaggggattcatcagTACTTAACCCCATGGTGGCGGCTAATGCTGCACAAAGCTTCATGAAATCACGACGGTTAATGCCGTGAGAATGGATGAGGGTGTTATCTCCAGTCATTTATAGTTATTCCGTTGCGAAGACCTGGCATATATTTTGCCTCAATCGCAAAATCAATAATGCGATCGATGCGCCATTTACCACACATTTATTATGGTTATCGATATCATGATACTGCGGCGGGGCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTa < 1:565078‑M1/278‑1 (MQ=255) 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CATGCAATAAATACCGTTATCTTTTAATGGGATGGAACCATCCACAACCAACACATACTGCCCTTTGTACTTCTCAAGTGCGTTATGTTTGTTCTCTTCGACCTGATGACCGAAGGCGGCGGAAAGCACTTCGTGATACTCCAGAGAGATAGTCTCCAGCACGAGGTTTTCTACCGTTGGATGCGTTGCACGAAGCAGAGATTCCGTACAACCGGTGCACTCCTGCGCGCCAATCCAGATAACTGGCGGACGCTGCGGGTTAGTAACCGATTCGGCCATCTCTGCAGCGGCTTTGCTACTTAACCCCATGGTGGCGGCTAATGCTGCACAAAGCTTCATGAAATCACGACGGTTAATGCCGTGAGAATGGATGAGGGTGTTATCTCCAGTCATTTATAGTTATTCCGTTGCGAAGACCTGGCATATATTTTGCCTCAATCGCAAAATCAATAATGCGATCGATGCGCCATTTACCACACATTTATTATGGTTATCGATATCATGATACTGCGGCGGGGCGCTAAAACGAAGGGAAGAAGCATTAGTGTAATTAATTAAAGCAAGATAATACGTATGTTT > CP006584/3268326‑3268904 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |