New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP006584 | 3305035 = | 3 (0.050) | 46 (0.750) | 40/584 | 0.6 | 93.9% | intergenic (‑341/‑33) | ribB/LY180_15715 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone 4‑phosphate synthase/hypothetical protein |
? | CP006584 | = 3672182 | NA (NA) | coding (475/477 nt) | LY180_17575 | membrane protein |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GTCTTAGGAGTGGCGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAAGCAGCCAGAT > CP006584/3304739‑3305331 | gTCTTAGGAGTGGCGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGc > 1:116010/1‑298 (MQ=255) 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ttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggcaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAAc < 1:338352‑M1/29‑1 (MQ=255) tatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACa < 1:508316‑M1/33‑1 (MQ=255) atgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGa < 1:456363‑M1/37‑1 (MQ=255) 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ccccGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaaggtggatacacatcttgtcatatgatcaaatggtttcgcga > 1:135156‑M1/1‑214 (MQ=255) agaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCCACCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAgg < 2:198450‑M1/95‑1 (MQ=255) cccGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACAAtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaaggtggatacacatcttgtcatatgatcaaatggtttcgcgaaa > 1:464121‑M1/1‑213 (MQ=255) 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ctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAagcagc < 1:265287‑M1/292‑1 (MQ=255) tctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGTGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCTCCAAACCCTACAAGCTCAGATGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTAGACGTCCAAACGCAAGTCATGTTACGGACATGTGCGAAACTGGCACTGCATGAACAAACAATGAGCGAACGGTAAAATCCACGTACTGAAGTtaaaaagaaaca < 2:532583‑M1/293‑6 (MQ=255) ggCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaaggtggatacacatcttgtcatatgatcaaatggtttcgcgaaaaatcaataatcagacaacaagatgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacacttaaaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgccttccttgactgtacaactctcactcttaccgaacttggccgtaaccttccaaccaaagcgaacaaaaaacataaaatcaaacaa > 2:517521‑M1/1‑12 (MQ=255) | GTCTTAGGAGTGGCGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAAGCAGCCAGAT > CP006584/3304739‑3305331 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |