New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | 4496128 = | NA (NA) | 58 (1.030) | 56/538 | 0.1 | 100% | intergenic (‑2037/‑83) | LY180_21445/LY180_21450 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | CP006584 | 4565632 = | 0 (0.000) | intergenic (‑372/+82) | LY180_21775/LY180_21780 | hypothetical protein/lysine 2,3‑aminomutase |
GGGTCGATAACAATAATGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTAT‑CGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAA‑CTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGA > CP006584/4495837‑4496395 | gggTCGATAACAATAATGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTAT‑CGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTaaaaa > 1:615215/1‑298 (MQ=255) ggTCGATAACAATAATGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTAT‑CGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAAt < 1:458089/298‑1 (MQ=255) tCGATAACAATAATGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTAT‑CGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCa < 1:577576/298‑1 (MQ=255) tAACAATAAGCCCTTTCTCGGCCTCAACGAACGTAAGGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACTTGTTACATTTTAC‑CGGTGATTTTGAACGGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCAttaa < 2:39451/298‑1 (MQ=255) agtccTGTCTCGACCTAAACAAACGTAGTGTTAGAGATATCCTTGGCGGGCACCGGATACATTTTAT‑CGGTGACTTTGAACAGGCCATAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGACACAGTGTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAGTTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTCATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGt < 2:274614/295‑1 (MQ=255) cTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTAT‑CGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGAt < 1:100811/298‑1 (MQ=255) tcGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGATGTATACGGTCCTCGCACTCTATACATTTTAT‑CGGTGTGTTTGAACAGGCCATAAATACTGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTGTACGGTTTCCGGCGCTGGGGCATTAATATCAAATTTGGAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATAcaca < 2:386859/298‑1 (MQ=255) cTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTAT‑CGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTg < 1:119331/298‑1 (MQ=255) tCAACGAACGTAATGTTCGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGCTACATTCTAT‑CGGTGACTGTGAACAGGCCAGCAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTGCCGGTTTCCGGCGCGTCCGCATTCATATCACATTTGTAATCGTCAGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCCCCTCACCCCACATACCTTCAACCATCAGCCCGGCGCTAAATCCCCGCTGGTCACTCAAGAATCCCCCAATGTTTTTGTTAACACCAAATAAGTTAAGTTgaaaccccaactttc > 2:410789/1‑284 (MQ=255) aacggacgGAATGTTAGTGATTTCCTGGACGGTCACCTGATA‑AGTGTATGCGGTGACTTTGACCAGGCGAGCAATACCGTTGGTGTGCGACTGAGGACACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGAGCTGCGGCATTAATATCGAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCa < 2:644232/298‑1 (MQ=37) 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aTTTTTG‑CGGTGACTTTGGAAAGGCCAGAAATACCAGTGATGTGGGACTGACCGCACAGGCTTGGGTTTTCGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGAcaacaa < 2:37928/298‑1 (MQ=37) ttAT‑CGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTACGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGAt < 1:29541/298‑1 (MQ=255) ggggatttttAACAGGCCAGAGTGACTTGTGATTCGCGACTGACGCCACGGGCTGGGGTTTGCGTGTTCCGGTGATGCTGCGTTATGGTCAAAGTCGTTATCGCGCGGGCGGTAGTAAACGTTACCGTTCGCATCTCGCAGAAGACCTTCAGCCAGCAGCGGATATATAAATCCACGCTGTGCACTGCTTAATCCCCTACTGTTTTTGGTCAAAAGCATTAAGTGAAGGTGGTTACATATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCg < 2:514779/292‑1 (MQ=12) 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cACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAA‑CTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAAc < 1:150513/298‑1 (MQ=255) aGAAAACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGTACTTATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATAATTAAGTTACGGTGGAGACACATATTGTAATATGATCAAATGGTGTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAA‑CTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGcc < 2:566958/298‑1 (MQ=255) tACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCACATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGCCTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAACTACACCTAAAAAGACTCAACAGCTTAACTTTGGCTTGCCAACCATTACTTACATGAAAAA‑CCCCCCCTCTTAACCAACCTGGCCgacacactccaaca > 2:557386/1‑285 (MQ=14) ttCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAA‑CTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAg > 1:222227/1‑298 (MQ=255) aTCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAA‑CTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCga > 2:364006/1‑298 (MQ=40) aTCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAA‑CTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCga > 1:629046/1‑298 (MQ=40) gcagcGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGCAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGAATCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAACAGACTCCAAAGCATAACTTTGGCTTGCCCCGACTTACTTGAATGGAAAACCACCCAC‑CTTAACAACATGGGCCGCACCCTGCCCACCAAACCGAAAACa > 2:83810/1‑298 (MQ=11) gATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAA‑CTCTCACTCTTACCGAACTTGCCCGTAACCTGCCACCCAACACGAGAACAaaacaaaaca > 2:239819/1‑298 (MQ=19) aCGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAA‑CTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGAGAGAACAAAACATAACATCAAACGaa > 1:395321/1‑298 (MQ=14) gCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAA‑CTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATc > 1:26649/1‑298 (MQ=31) tGGGCACTGAGTGATCGCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATTGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACACGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTGGACTGTAAAA‑CTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGa < 2:642725/298‑1 (MQ=9) | GGGTCGATAACAATAATGCCTTTCTCGCCCTCAACGAACGTAATGTTAGAGATATCCTGGCCGCGCACCTGATACATTTTAT‑CGGTGACTTTGAACAGGCCAGAAATACCGTTGATTTGCGACTGACGCCACAGGCTGGGGTTTACGGTTTCCGGCGCTGCGGCATTAATATCAAATTTGTAATCGTCCGCGCGGTAGTAAACTTTACCGTTCGCATCACGCAGAATACCTTCATCCAGCAGCGGGGCGATAAATCCACGCTGGGCACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCGAAAAATCAATAATCAGACAACAAGATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCATTACTTGACTGTAAAA‑CTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGA > CP006584/4495837‑4496395 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |