New junction evidence | |||||||||||
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? | CP006584 | 4740121 = | 71 (1.200) | intergenic (+362/‑118) | LY180_22625/fimA | tyrosine recombinase/type‑1 fimbrial protein subunit A |
CTATCGCATTATTCGCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGTTAAGGCATGCTTGCGGTTATGAACTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGACTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTCTTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAAAATCTATAAATAAAGATAACAATAGAATATTAAGCCAACAAATAAACTGAAAAAGTTTGTGCGCGATGCTTTCCTCTATGA > CP006584/4739510‑4740104 | acctggcccaactgaacggtttgatcaacagagcctgcatcaactgcgcaagcggcgttaacaacttcccctttaaagtgaacggtcccaccatttaccgtcgtagtatcggccagagccgctgcggaactgagggacagagccgacagaacaacgattgccagagttttaattttcatgctgctttcctttaaaaaactatttctaaatcgacatgggcagtcgttctgtacactttgttttgtcaacgagtttgactgccaacactgcacagttttcccccaaaagatgaaacatt > 2:210903‑M1/298‑298 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |