New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | 1015084 = | 1 (0.020) | 48 (0.780) | 47/586 | 0.4 | 98.0% | coding (445/858 nt) | LY180_04750 | formate transporter |
? | CP006584 | = 1154738 | NA (NA) | coding (35/636 nt) | LY180_05370 | hydrolase |
TCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCGGAAATCCCAAATATGAAATAGATGTGAAAGCCGTTGC > CP006584/1154452‑1155035 | tCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATc > 1:337127/1‑298 (MQ=32) gATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGc > 1:652793/1‑298 (MQ=34) tgttatgttTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGAAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCAc < 1:523874/298‑1 (MQ=21) gttttgttttgttttAGCTTTGGTGGGCAGGTTCAGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACt < 2:148753/298‑1 (MQ=255) tgttgtgcttttGGTTGGGAGGTTAAGGCCAAGTTCGGGAAGAGTGGGATTTTTACCGTCAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTGAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACa < 2:511250/289‑1 (MQ=14) cggtttgtttgGCAGGTTAGTGCAAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTa < 2:72436/295‑1 (MQ=255) tCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAgg < 1:632357/298‑1 (MQ=255) agggTGAGAGTTTTACAAGCAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTTAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGGAGAATTGGTAAAGAGAGGCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCt < 2:518959/295‑1 (MQ=255) agTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTAACAAAATCATTAGGGGTTTCATCAGAGCTCCGCATCACTGGCACTTTATTAACATGCTTTTTTGGCCTCGCGGGGTTGATGGGGTGGGGTTCCttg > 2:89063/1‑296 (MQ=14) agagTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCgg > 1:201546/1‑298 (MQ=255) gTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCAt < 1:89063/298‑1 (MQ=255) cAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGc < 1:229938/298‑1 (MQ=255) gCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTTGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTaaaaa < 1:147122/298‑1 (MQ=255) aGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATg > 1:409873/1‑298 (MQ=255) ttAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGTCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAATAGTTGATGGTGATatt > 2:78079/1‑298 (MQ=255) agTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAAGGTCGGTTAAAATATCGAGTTTGACCATCTTGTTGTTTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTaa < 2:652793/297‑1 (MQ=255) aaGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGtt < 1:78079/298‑1 (MQ=255) aGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTCTTCGCGAAACCATCTCATCATATGACAAGATGTGTATCCAACTTAAATTCATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATACGTCCTCCGACTCAATGGCCCTTCACTAAATTGCGTACGTGGCCGCTAGGGGCTAATGGGGAAGGGCTCCTGCGCGGCAGTGAAGCTAAACTTAAAACACTTGATGGTACAAGTTCTTGCAATGGTAAAATCttt > 2:163735/1‑298 (MQ=9) gtgtAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTg > 1:116201/1‑298 (MQ=255) gtAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGAc < 1:14569/298‑1 (MQ=255) cGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTATGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTAGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATAATTAGGGGATTCATCAGTGATCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATACGTATCTGGCCGCGAGTGGTCGATGGGGTAGGGATACTGCGCGGCAGCGAAGCTAACATTAAAAATGGTGATGGTGAAATAGATTGAAGCGGGAAAATGTTTGaagacatg > 2:409607/1‑291 (MQ=21) gaggCAGAATTGGTAAAGGGAGTCGTGTAAAATATCAAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATGATAGATTGTTCGCAAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTAACTACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATAAGTGACCAGCATCCCTGGCACTTAATTAACATGCGAATCTGGACGAGAGTGGTAGATGGGGTCGGGATCCGGCGCGGCATCGAAGTTAACAGTAAAGAGATTTATGGTGAAATTGTTCGCAGCGGTAAATCGtttacatagttgg > 2:270357/3‑288 (MQ=17) gggCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCAGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGa > 1:258077/1‑298 (MQ=255) cAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCt < 1:272987/298‑1 (MQ=255) tAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGc > 1:524397/1‑298 (MQ=255) aaGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCg < 1:140514/298‑1 (MQ=255) aaGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCg > 1:354182/1‑298 (MQ=255) gagatTCGGTTAAAATATACGGTTCGTACATTTTGTTGTTTGATTATTTATTTTTCGCGTAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGAAGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGt < 2:201546/298‑1 (MQ=37) agagTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGtt < 1:507289/298‑1 (MQ=255) attttgAGTTCGCATATTTGTTTGTTTGTTTATTGATTTTTGGAGAAAACATTTGACCATATGAAAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCCTCAGCGCGCCGCAGCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGt < 2:239120/293‑1 (MQ=37) cacaTCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCCGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGATCCGGTTTTTTcaccacc > 2:264104/1‑297 (MQ=255) aTCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGCTGGGGTATGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGCTTCGCTTGATCTGATTATTGCCGGTTGTCATGAGCCGTTTTTTGCACCACATgt > 2:61536/1‑297 (MQ=255) tgttgtCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTAATGGTGAAATTGAATGCAGCGTTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTAGTGCCGGATTTAATGTGCCGGTTTTTGCCCCACATGACaaa > 2:167786/1‑298 (MQ=255) gatttttgcataaaCCAGTTTATCATATGACAAGATGTGTATCAACCTTAATATAATGAGTATTAGCAAAATCAGTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATTCGTATCTGGCAGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACaa < 2:176177/287‑1 (MQ=255) tttCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCCCCAAATGAAAAAGCGACCAATAAAAAAGcca > 2:611333/1‑296 (MQ=255) gAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCg > 1:513059/1‑298 (MQ=255) tCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCa < 1:264104/298‑1 (MQ=255) cAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAAt < 1:231235/298‑1 (MQ=255) tgtgTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAACGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCa > 1:617226/1‑298 (MQ=255) tATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCCTGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGAGACCTATACCAAAGCAATAACCACCACATTCGCCAGCAGAACTGTGCctaaa > 2:398448/1‑296 (MQ=255) aCCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAg > 1:234808/1‑298 (MQ=255) aacttaaGGTTTTTTAAAAAAATTATGAGGGGATTGAGCAGTGGTACGCTTCACTGGCATTTCATTAACAGGCGTGTCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGGGCGGCATCGAAGCTAACAGTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATc < 2:528085/298‑1 (MQ=255) gtaaaTTATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCCTCAGTGTTCCGAATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAAGTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATccc < 2:617226/295‑1 (MQ=255) taaTGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCgg > 1:218407/1‑298 (MQ=255) aaTGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCGGa < 1:92210/298‑1 (MQ=255) cAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGattatt > 2:30836/1‑178 (MQ=255) cAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGattatt < 1:30836/178‑1 (MQ=255) aaaTCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCGGAAATCCCAAATATGa > 1:84301/1‑298 (MQ=255) cATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCGGAAATCCCAAATATGAAATa < 1:341299/298‑1 (MQ=255) cATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCATATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCGGAAATCCCAAATATGAAATa > 1:475255/1‑298 (MQ=255) aGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACCAAGCGACCAATACACCAGCGATGATCGCCACTCACCCCAGGCGCCAAGTGCATAAAAAAAGCCATCCCGGAAATCCCAAATATGAAATaactt > 2:285922/1‑294 (MQ=255) ggATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCGGAAATCCCAAATATGAAATAGATGTGa > 1:213084/1‑298 (MQ=255) ttCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTCCATTAACATGAGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATACTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGCAATTGATTGCAGCGCTAAACTGTTTGACTCGCTGGATATGATTATTGCCGGTATTCATGAGCCGGGTTTTGCACCAACTTACAACGCGACCACTACACAAGCGATGCTCGCCACGATCGACACCCGCGCTGATCATAGAACAATCCCTCCCTGAAATACCACATCAGAAATataaatggaat > 2:160011/1‑288 (MQ=255) caGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCGGAAATCCCAAATATGAAATAGATGTGAAAGCCGtt < 1:418006/298‑1 (MQ=255) gTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCGGAAATCCCAAATATGAAATAGATGTGAAAGCCGTTGc > 1:74879/1‑298 (MQ=255) | TCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCCACCTTAACTTAATGATTTTTACCAAAATCATTAGGGGATTCATCAGTGCTCCGCATCACTGGCACTTCATTAACATGCGTATCTGGCCGCGAGTGGTTGATGGGGTAGGGATCCTGCGCGGCATCGAAGCTAACATTAAAAATGTTGATGGTGAAATTGATTGCAGCGGTAAAATGTTTGACTCGCTGGATCTGATTATTGCCGGTTTTCATGAGCCGGTTTTTGCACCACATGACAAAGCGACCAATACACAAGCGATGATCGCCACTATCGCCAGCGGCAATGTGCATATAATAAGCCATCCCGGAAATCCCAAATATGAAATAGATGTGAAAGCCGTTGC > CP006584/1154452‑1155035 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |