Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP006584 | 1,372,567 | 0 | G | A | 27.3% | 92.0 / 27.8 | 57 | W19* (TGG→TAG) | LY180_06475 | hypothetical protein |
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TCCCTCATATTTATAGGGTAAATTACCTGTAAAGTAGTGTCTAATTACCCGCCTCGCAAATTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTAT‑AATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGCACTGCTGATTTGGAAAGTGTGGGGATAACTATGGTTGGTCAGGAGCAACTGGAGTCGTCACCATTATGTCAGCATAGTGACAATGAACCAGAAACGAAACGGGAATGTTCCGTCGTTATTCCAGACGACTGGCAACTAACAGCGCAGCAGCAAGCCTTTATAGAACTGTTTGCTGAAGATGATCAGC‑CGAAACAATAATTATCATCATTCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATAC > CP006584/1372276‑1372861 | tCCCTCATATTTATAGGGTAAATTACCTGTAAAGTAGTGTCTAATTACCCGCCTCGCAAATTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTAT‑AATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCtagctggc > 1:569675/1‑298 (MQ=255) 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aGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGCACTGCTGATTTGGAAAGTGTGGGGATAACTATGGTTGGTCAGGAGCAACTGGAGTCGTCACCATTATGTCAGCATAGTGACAATGAACCAGAAACGAAACGGGAATGTTCCGTCGTTATTCCAGACGACGGGCAACTAACAGACCAAACACAAGACTTTATAGAACTGTTTGCTTAAGAATATCAGC‑AGAAACAAAAATTaatctcaacttta > 2:45006/1‑286 (MQ=255) gAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGCACTGCTGATTTGGAAAGTGTGGGGATAACTATGGTTGGTCAGGAGCAACTGGAGTCGTCACCATTATGTCAGCATAGTGACAATGAACCAGAAACGAAACGGGAATGTTCCGTCGTTATTCCAGACGACTGGCAACTAACAGCGCAGCAGCAAGCCTTTATAGAACTGTTTGCTGAAGATGATCAGC‑CGAAACAATAATTATCATCATTCttatt < 1:609646/298‑1 (MQ=255) ccgccgCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGCACTGCTGATTTGGAAAGTGTGGGGATAACTCTGGTTGGTCAGGCGCAACTGGAGTCGTCACCATTATGTCCGCATAGTGACAATGAACCAGAAACGAAACGGGAATGTTCCGTAGTTATTCCAGACAACTGGCAACTAACAGCGCAGCAGCAATCTTTTATAGAATTGTTTGCAGAAGATGACCAGC‑GGAAACAATATATATCATCATTCTTTTTAACCa > 2:276209/1‑298 (MQ=255) 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TCCCTCATATTTATAGGGTAAATTACCTGTAAAGTAGTGTCTAATTACCCGCCTCGCAAATTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTAT‑AATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGCACTGCTGATTTGGAAAGTGTGGGGATAACTATGGTTGGTCAGGAGCAACTGGAGTCGTCACCATTATGTCAGCATAGTGACAATGAACCAGAAACGAAACGGGAATGTTCCGTCGTTATTCCAGACGACTGGCAACTAACAGCGCAGCAGCAAGCCTTTATAGAACTGTTTGCTGAAGATGATCAGC‑CGAAACAATAATTATCATCATTCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATAC > CP006584/1372276‑1372861 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |