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agTAATGTTTATTTAAAATATTTCAATGTCGTTATATAAATTACCTATAAAAAACAACCATGTATTTATCTTAAATATCAAAACCTTTATAACATCCGAAAAAGAAAGATACGAATAGCATTTACACAATACCCGGAATAGACTTTCGTCACTTTTAATTAAAGGGATGTTTTTATGCAGTGGTATTTAGCCGTATTAAAAAATTATGTTGGTTTCTCTGGTCGCGCACGTCGTAAAGAGTACTGGATGTTTACTCTGATTAACGCCATCGTCGGCGCTATTATCAATGTCATTCAAtt > 1:313720‑M1/3‑299 (MQ=255) tGTTTATTTAAAATATTTCAATGTCGTTATATAAATTACCTATAAAAAACAACCATGTCTTTATCTTAAATATCAAAACCTTTATAACATCCGAAAAAGAAAGATACGACTAGCATTTACACAACACCCGGAATAGACTTCCGTCACTTTTAATTAAATGGATGTTTTTATGAAGTGGTATTTATCCGTATTAAAAAATTATGCTGGTTTATATAGTCGCGCACGTCGTCAAGAGTACTGCATGTTTCCTCTGATTTAAACCCTCGTCCTCGCTATTCTCACTGATACTTACTTGAttt > 2:257357/1‑299 (MQ=255) gTTTATTTAAAATATTTCAATGTCGTTATATAAATTACCTATAAAAAACAACCATGTATTTATCTTAAATATCAAAACCTTTATAACATCCGAAAAAGAAAGATACGAATAGCATTTACACAATACCCGGAATAGACTTTCGTCACTTTTAATTAAAGGGATGTTTTTATGCAGTGGTATTTAGCCGTATTAAAAAATTATGTTGGTTTCTCTGGTCGCGCACGTCGTAAAGAGTACTGGATGTTTACTCTGATTAACGCCATCGTCGGCGCTATTATCAATGTCATTCAATTGAtttt < 1:19857/299‑1 (MQ=255) | CTGGTGGCGAAGGCATCCTGACGACAATCTACGGTATTCTGGTGTTTTTACCGTGGTGGGCAGTTCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGTTGTTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAAAACCGCTTTGGACCAGATCCGAAACTGGAACCTTAAAACAAATCTGCTCGCCGGATGTCTGACTCATCCGGCTTTTATCATCATGTTGATGAATGAATAATTTACTAATGTTTATTTAAAATATTTCAATGTCGTTATATAAATTACCTATAAAAAACAACCATGTATTTATCTTAAATATCAAAACCTTTATAACATCCGAAAAAGAAAGATACGAATAGCATTTACACAATACCCGGAATAGACTTTCGTCACTTTTAATTAAAGGGATGTTTTTATGCAGTGGTATTTAGCCGTATTAAAAAATTATGTTGGTTTCTCTGGTCGCGCACGTCGTAAAGAGTACTGGATGTTTACTCTGATTAACGCCATCGTCGGCGCTATTATCAATGTCATTCAATTGATTTT > CP006584/3378912‑3379504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |