| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006584 | 1643563 = | 92 (0.900) | 150 (1.510) | 106/566 | 0.0 | 77.1% | intergenic (‑223/‑80) | LY180_07760/LY180_07765 | sulfatase/transposase |
| ? | CP006584 | = 4565632 | 0 (0.000) | intergenic (‑372/+82) | LY180_21775/LY180_21780 | hypothetical protein/lysine 2,3‑aminomutase | |||||
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
GGGTAGAAATCCATTGCGGAAATCAGCTTGTCATAATTACCGGGTTGAAGTTTTCCTTTCCACCAC‑ATAAACATTGGGGTGTGAGTACCGCCAGGATAGGTCTGACTCTTATAGCCTTTTTGCGCCCCGTTCAGCGGCAGAGGACCATCGATAACCGCACCATTATCGGAGGTAAAGAGAATAATTGTATTGTCATACTGTCCGTTTTTCTTCAGTTGTTCGAGAATGCGTTTTACACCCTGATCAACAGAATAAACGGAAGCGTAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAATCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCCTTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGACCGATTGTTAGGTAATCGTCACCTCCACAAA > CP006584/1643267‑1643858 | atagttgttaaaataacataaatagccgtactcactctatataaacagaaaagaaaggttaattattggtgttagctatataaaaagtaacaacagcaatgcatatgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcagcgtaaacgccttatccggcctacagttcattgcaaatccattcaatttcaatgcacgatgtaggcctgatactgatgaatcccctaatgatttttatca < 1:716906‑M1/1‑1 (MQ=255) ggTAGAAATCCATTGCGGAAATCAGCTTGTCATAATTACCGGGTTGAAGTTTTCCTTTCCACCAC‑ATAAACATTGGGGTGTGAGTACCGCCAGGATAGGTCTGACTCTTATAGCCTTTTTGCGCCCCGTTCAGCGGCAGAGGACCATCGATAACCGCACCATTATCGGAGGTAAAGAGAATAATTGTATTGTCATACTGTCCGTTTTTCTTCAGTTGTTCGAGAATGCGTTTTACACCCTGATCAACAGAATAAACGGAAGCGTAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTaaaa < 1:1002444/298‑1 (MQ=255) agttgttaaaataacataaatagccgtactcactctatataaacagaaaagaaaggttaattattggtgttagctatataaaaagtaacaacagcaatgcatatgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcagcgtaaacgccttatccggcctacagttcattgcaaatccattcaatttcaatgcacgatgtaggcctgatactgatgaatcccctaatgatttttatcaaa < 1:137343‑M1/3‑1 (MQ=255) gttgttaaaataacataaatagccgtactcactctatataaacagaaaagaaaggttaattattggtgttagctatataaaaagtaacaacagcaatgcatatgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcagcgtaaacgccttatccggcctacagttcattgcaaatccattcaatttcaatgcacgatgtaggcctgatactgatgaatcccctaatgatttttatcaaaa > 1:182744‑M1/295‑298 (MQ=255) 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taatgatttttatcAAAATCATTAAGTTAAGGTAGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAATCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCCTTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGACCGATTGTTAGGTAATCGt < 2:474352‑M1/284‑1 (MQ=255) tttttaacAAAATCATGAAGTTAAAGTAGATACACATCTGGTCATATTATCAAAGATTTTCGCCAAAAATCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCACTAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCCTTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGACCGATTGTTAGGTAATCGTCACCTc > 2:208034‑M1/9‑298 (MQ=255) ttttatcAAAATCATTAAGTTAAGGTAGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAATCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCCTTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGACCGATTGTTAGGTAATCGTCACCTcc < 1:887626‑M1/291‑1 (MQ=255) | GGGTAGAAATCCATTGCGGAAATCAGCTTGTCATAATTACCGGGTTGAAGTTTTCCTTTCCACCAC‑ATAAACATTGGGGTGTGAGTACCGCCAGGATAGGTCTGACTCTTATAGCCTTTTTGCGCCCCGTTCAGCGGCAGAGGACCATCGATAACCGCACCATTATCGGAGGTAAAGAGAATAATTGTATTGTCATACTGTCCGTTTTTCTTCAGTTGTTCGAGAATGCGTTTTACACCCTGATCAACAGAATAAACGGAAGCGTAGTACTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCAAATGGTTTCGCCAAAAATCAATAATCAGACAACAAAATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCCGAATTACACTTAAAACGACTCAACAGCTTAACGTTGGCTTGCCACGCCTTACTTGACTGTAAAACTCTCACTCTTACCGAACTTGGCCGTAACCTGCCAACCAAAGCGAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGACCGATTGTTAGGTAATCGTCACCTCCACAAA > CP006584/1643267‑1643858 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |