| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006584 | = 3305045 | 7 (0.070) | 93 (0.910) | 85/584 | 0.2 | 93.0% | intergenic (‑351/‑23) | ribB/LY180_15715 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone 4‑phosphate synthase/hypothetical protein |
| ? | CP006584 | 3344745 = | NA (NA) | coding (164/330 nt) | LY180_15880 | hypothetical protein | |||||
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CGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATT‑CACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCT > CP006584/3304752‑3305342 | gcgttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactacctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggcttcccccGCACTCAACCCCTACCATTACAgg < 2:125541‑M1/24‑1 (MQ=255) gatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTa > 2:947941‑M1/268‑298 (MQ=255) aCGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATT‑CACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgatttt < 1:699612‑M1/298‑23 (MQ=255) ctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACAACAATGATTg < 2:193193‑M1/40‑1 (MQ=255) gTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATT‑CACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatc < 1:621193‑M1/298‑33 (MQ=255) gcccgcgacaatcggtactcCCTCCCACCCGGACTCTAACCGGCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATT‑CACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaag < 2:697106‑M1/289‑39 (MQ=255) cGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATT‑CACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaataattaagtta > 2:657077‑M1/1‑257 (MQ=255) 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cTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCGCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACCGAGCGTAAAAAACAGCCAGaaacag > 2:709247/1‑293 (MQ=255) acacCTATCAGTACAGAGAAACTACAATGATTGACCCGCAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGTCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGCAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGCCGCGCATCGACCTTGTAAGCCGTGCAGCGTTCGACGTCCAACCGACAGTCCTATTCTGGACTCGACAGCAACGGACGCGGCTGGAACAAAGAATGAGAGAAAGGGAAAATCGCAGGACTGAGAGTTAAAAGCAGCCaaacacagatat > 2:367113/1‑287 (MQ=255) ccTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGActct < 1:709247/298‑1 (MQ=255) | CGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATT‑CACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGACTCT > CP006584/3304752‑3305342 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |