| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
TTAAATAACAGTTACTAATCATTCATTTTCTACTTATATTTATATAAAGGAATATTATGTCTGCTTTTAAAAAGTCACTTCTTGTTGCTGGCGTAGCAATAATTCTTTCCAATAACGTATTTGCTGACGAAGGTCACGGCATTGTTAAATTTAAAGGTGAAGTTATCTCTGCTCCATGTTCAATTAAACCAGGTGACGAAGACTTAACTGTAAATCTGGGTGAAGTAGCAGATACCGTTCTGAAAAGCGACCAGAAATCTTTGGCTGAGCCTTTCACTATTCACCTGCAAGACTGCATGTTGAGCCAGGGTGGAACCACTTATTCAAAAGCGAAGGTTACTTTCACCACAGCGAATACTATGACGGGTCAGACTGACCTGCTGAAAAACACCAAAGAAACTGAAATCGGTGGTGCCACAGGCGTTGGCGTACGTATTCTGGATAGCCAGAGCGGCGAAGTGACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACATTCAACAATACTAACAGCTATCAGGAACTGAACTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCTACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTATA > CP006584/3305585‑3306175 | ttAAATAACAGTTACTAATCATTCATTTTCTACTTATATTTATATAAAGGAATATTATGTCTGCTTTTAAAAAGTCACTTCTTGTTGCTGGCGTAGCAATAATTCTTTCCAATAACGTATTTGCTGACGAAGGTCACGGCATTGTTAAATTTAAAGGTGAAGTTATCTCTGCTCCATGTTCAATTAAACCAGGTGACGAAGACTTAACTGTAAATCTGGGTGAAGTAGCAGATACCGTTCTGAAAAGCGACCAGAAATCTTTGGCTGAGCCTTTCACTATTCACCTGCAAGACTGCAt > 1:902207/1‑298 (MQ=255) 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ggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttaccaaaatcattaggggattcatcagTGTTGAGCCAGGGTGGAAcc > 1:921513‑M1/254‑273 (MQ=255) ggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttaccaaaatcattaggggattcatcagTGTTGAGCCAGGGTGGAAcc < 2:921513‑M1/20‑1 (MQ=255) ggcaggttacggccaagttcggtaagagtgagagttttacagtcaagtaatgcgtggcaagccaacgttaagctgttgagtcgttttaagtgtaattcggggcagaattggtaaagagagtcgtgtaaaatatcgagttcgcacatcttgttgtctgattattgatttttcgcgaaaccatttgatcatatgacaagatgtgtatccaccttaacttaatgatttttaccaaaatcattaggggattcatcagTGTTGAGCCAGGGTGGAACCACTTATTCAAAAGCGAAGGTTACtt > 1:931296‑M1/254‑298 (MQ=255) 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gggattcatcagTGTTGAGCCAGGGTGGAACCACTTATTCAAAAGCGAAGGTTACTTTCACCACAGCGAATACTATGACGGGTCAGACTGACCTGCTGAAAAACACCAAAGAAACTGAAATCGGTGGTGCCACAGGCGTTGGCGTACGTATTCTGGATAGCCAGAGCGGCGAAGTGACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACATTCAACAATACTAACAGCTATCAGGAACTGAACTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCTACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGc > 1:224222‑M1/13‑298 (MQ=255) tcagTGTTGAGCCAGGGTGGAACCACTTATTCAAAAGCGAAGGTTACTTTCACCACAGCGAATACTATGACGGGTCAGACTGACCTGCTGAAAAACACCAAAGAAACTGAAATCGGTGGTGCCACAGGCGTTGGCGTACGTATTCTGGATAGCCAGAGCGGCGAAGTGACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACATTCAACAATACTAACAGCTATCAGGAACTGAACTTCAAAGCACGTATGGAATCCCCAAGCAAAGAAGCTACCCCGGgcaacgtttaagctgcggccggataat < 2:161829‑M1/294‑14 (MQ=255) tcagTGTTGAGCCAGGGTGGAACCACTTATTCAAAAGCGAAGGTTACTTTCACCACAGCGAATACTATGACGGGTCAGACTGACCTGCTGAAAAACACCAAAGAAACTGAAATCGGTGGTGCCACAGGCGTTGGCGTACGTATTCTGGATAGCCAGAGCGGCGAAGTGACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACATTCAACAATACTAACAGCTATCAGGAACTGAACTTAAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCTACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGCCTGACtata < 2:820342‑M1/294‑1 (MQ=255) | TTAAATAACAGTTACTAATCATTCATTTTCTACTTATATTTATATAAAGGAATATTATGTCTGCTTTTAAAAAGTCACTTCTTGTTGCTGGCGTAGCAATAATTCTTTCCAATAACGTATTTGCTGACGAAGGTCACGGCATTGTTAAATTTAAAGGTGAAGTTATCTCTGCTCCATGTTCAATTAAACCAGGTGACGAAGACTTAACTGTAAATCTGGGTGAAGTAGCAGATACCGTTCTGAAAAGCGACCAGAAATCTTTGGCTGAGCCTTTCACTATTCACCTGCAAGACTGCATGTTGAGCCAGGGTGGAACCACTTATTCAAAAGCGAAGGTTACTTTCACCACAGCGAATACTATGACGGGTCAGACTGACCTGCTGAAAAACACCAAAGAAACTGAAATCGGTGGTGCCACAGGCGTTGGCGTACGTATTCTGGATAGCCAGAGCGGCGAAGTGACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACATTCAACAATACTAACAGCTATCAGGAACTGAACTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCTACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTATA > CP006584/3305585‑3306175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |