| New junction evidence | |||||||||||
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CCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGC‑AGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTTGCTCAG > 1:339260/1‑298 GCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGC‑AGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGGCTCAGGCCTTCC < 1:405441/298‑1 GCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGC‑AGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGGCTCAGGCCTTCC < 1:118552/298‑1 tCGTCAGGCCGCCCGGCGTGGTACGGGAGGTGGGGTGGCTGCCTGTTTCACGGGTCAGGCGGATGCCCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGC‑AGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGGCTCAGGCCTTCCTC < 2:205765/297‑1 GCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGC‑AGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGGCTCAGGCCTTCCTC > 1:114791/1‑298 CAGACCACCCTGCGTGGTACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGCACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGCCCGCGGCAATGACGGCGGTCAGCTCACCGCCGATGTTGTATTCCTCCCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGC‑CGTTAACTCTCCCCGGGCGCCGTATCCGGGGGCCGGGCTCCGGCCCTCCCCGCGG > 2:418819/1‑298 GACCGCCCTGCGTGGTACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCCCCGC‑AGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGCCTCAGGCCTTCCTCGCGGcg > 1:62316/1‑296 ctcttccgatctCGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGT‑GTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCTGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGC‑AGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGGCTCAGGCCTTCCTCGCGGTGCACCGC < 1:508370/286‑1 TGGTACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGATGCCGCCCGGGGCAATGACGGCGGACAGGCCACCGGCGATGTTGTTTTCATACCGGGTATCATGGCCCTGCGCGCCTATCCCCGC‑ACTGCACTTTCCACGGCTGTCGTTAGCGGCGTCTTGGCTCAGGCCTTCCTCGCGGTGCACCCCCGTCAa > 2:291361/1‑297 CGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGC‑AGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGGCTCAGGCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCACCTGAC < 1:212222/298‑1 GGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGT‑GTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCTGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTCTCTTTCACCCC‑AGTTACCTGTCCACGGCTGTCGTATGCGGGGTCCCGGCTCAGGCCTTCCCCGCGGTGCACCGCCagcccggaagac > 2:508370/1‑286 GAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGC‑AGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGGCTCAGGCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCACCTGACCA > 1:36700/1‑298 GAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCCGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCACGTCACCGGCGCTGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGACCTGCGCGTCCTTCCCCGC‑CGTTAACCGTCCACGGCTCTCGGATGCGTGTTACGTGCCCCGGCCCTCCCCGCTGTCCCCCGCCGTCACCGGACCc > 2:401638/1‑297 AAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGC‑AGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGGCTCAGGCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCACCTGACCAA > 1:462324/1‑298 GCCGCGTTCGTCATACTGCCACTGCTCTGCGGTTTCGCCATTCACGGTGCGGTGCGTGAGGCGGTCTGCTTCGTCATAGTGCCAGTGGGTGACCAGCCCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCGAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/794977‑794676‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acggaAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGATGACCCGTCCGGCAGCATCGTATTCCATACTGCGCGTCAGACCGCCCTGCGTGGTACGGATGGCCTTTCCCCACGCATCGTACTGTGTCCCGTTTCTGCTGCCGTCCGGGGCAATGACGGCGGTCAGGTCACCGGCGATGTTGTATTCATACCGCGTTTCATGGCCCTGCGTGTCTTTCACCGC‑AGTTAACTGTCCACGGCTGTCGTATGCGTGGTACTGGCTCAGGCCTTCCTCGCGGTGCACCGCCGTCACCTGACCAA < CP006584/794771‑794475 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |