| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP006584 | = 3672183 | NA (NA) | coding (474/477 nt) | LY180_17575 | membrane protein | |||||
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CP006584/3379496‑3379202‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTAGCAGCATGATATCAAAACGCTCT < CP006584/3672183‑3671906 TTGAATGAAATTGATAAGAGCGCCGACGATGGCGTTAATCAGAGGAAACATCCAGTACTCTTTACGACGTGCGCGACCAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGCTAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGGTATTGTGTAAATGCTATTCGTATCTTTCTTTTTCGGATGTTATAAAGGTTTTGATATTTAAGATAAATACATGGTTGTTTTTTATAGGTAATTTATATAACGACATTGAAAT‑ATTTTAAATAAACATTACTG < 2:330618/298‑1 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TTAAGATAAATACATGGTTGTTTTTTATAGGTAATTTATATAACGACATTGAAAT‑ATTTTAAATAAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAATCGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATAAACGCCCGCAACCCA > 2:529083/1‑298 AGATAAATACATGGTTGTTTTTTATAGGTAATTTATATAACGACATTGAAAT‑ATTTTAAATAAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACA > 1:53587/1‑298 GATAAATACATGGTTGTTTTTTATAGGTAATTTATATAACGACATTGAAAT‑ATTTTAAATAAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTTAGAGTACGTTTCGCTTTCTGACTGCTTTATCCTGGAAGTTCTTGTCCCCACCTTTTTTCTGAACATGTACGCCCCCAAGCCCACAT > 2:4037/1‑298 TACATTGTTTTTTTTTATAGGTAAATTATATAACGAAAATTAAATAATTTAAAATAAAC‑TTACTGGGAGATCCCCTTCTTATTTCCCCCAAGGGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGT < 2:484668/298‑1 TGGTTGTTTTTTATAGGTAATTTATATAACGACATTGAAAT‑ATTTTAAATAAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCACTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAATCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGCCTGTGTTAGCCTGGAGGTGCTTGTCCCAACTTTGTTTCTGAGCATGACCGCCCGACAGCCAACATGTTCGTTGAA > 2:109939/1‑298 TGGTTGTTTTTTATAGGTAATTTATATAACGACATTGAAAT‑ATTTTAAATAAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTCTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTTTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGAGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAA > 1:323006/1‑298 TGGTTGTTTTTTATAGGTAATTTATATAACGACATTGAAAT‑ATTTTAAATAAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTCTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAA > 1:323023/1‑298 ATAGGTAATTTATATAACGACATTGAAAT‑ATTTTAAATAAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCGTGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGA > 2:21910/1‑298 ATAGGAAATTTATATAACTACATTGAAAA‑ATTTTAAAAAAACATTACTGAGAGATCCCATCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGA < 2:84311/298‑1 AGGTAATTTATATAACGACATTGAAAT‑ATTTTAAATAAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATT > 1:43027/1‑298 GGTAATTTATATAACGACATTGAAAT‑ATTTTAAATAAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCTAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTA > 1:19286/1‑298 GGTAATTTATATAACGACATTGAAAT‑ATTTTAAATAAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTCCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTA > 1:202425/1‑298 ACATTGAAAT‑ATTTTAAATGAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTAGCAGCATGATATCAAA > 1:542415/1‑298 TTGAAAT‑ATTTTAAATAAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCACGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTAGCAGCATGATATCAAAACG > 1:367414/1‑298 AAAC‑ATTTTAAATAATCATTAATGAGATATCTCCTCATATTTTCCCCAAAACGTAACCATGTCTGAAGAAATTTTG‑AGCTAGTAGCGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATGGGGGAGCCAGAATGCCGCAAATCTTCCATGCCTAAGCGAACTGGTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTTTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTGTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTAGCAGCATGATATCAAAACGCTC < 2:253339/298‑1 AAT‑ATTTTAAATAAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCCAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCCGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTAGCAGCATGATATCAAAACGCTCT > 2:10304/1‑298 AAT‑ATTTTAAATAAACATTACTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTAGCAGCATGATATCAAAACGCTCT > 1:267382/1‑298 TTGAATGACATTGATAATAGCGCCGACGATGGCGTTAATCAGAGTAAACATCCAGTACTCTTTACGACGTGCGCGACCAGAGAAACCAACATAATTTTTTAATACGGCTAAATACCACTGCATAAAAACATCCCTTTAATTAAAAGTGACGAAAGTCTATTCCGGGTATTGTGTAAATGCTATTCGTATCTTTCTTTTTCGGATGTTATAAAGGTTTTGATATTTAAGATAAATACATGGTTGTTTTTTATAGGTAATTTATATAACGACATTGAAAT‑ATTTTAAATAAACATTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP006584/3379496‑3379202‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGAGAGATCCCCTCATAATTTCCCCAAAGCGTAACCATGTGTGAATAAATTTTG‑AGCTAGTAGGGTTGCAGCCACGAGTAAGTCTTCCCTTGTTATTGTGTAGCCAGAATGCCGCAAAACTTCCATGCCTAAGCGAACTGTTGAGAGTACGTTTCGATTTCTGACTGTGTTAGCCTGGAAGTGCTTGTCCCAACCTTGTTTCTGAGCATGAACGCCCGCAAGCCAACATGTTAGTTGAAGCATCAGGGCGATTAGCAGCATGATATCAAAACGCTCT < CP006584/3672183‑3671906 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |