New junction evidence | |||||||||||
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? | CP006584 | = 4334576 | 2 (0.030) | coding (21/1734 nt) | LY180_20755 | membrane protein |
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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTTGTGAT < CP006584/4334576‑4334286 TGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACCTGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCC < 2:466387/298‑1 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TGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTG > 1:499067/1‑298 CAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCAGCAGTAATCGGC > 1:170338/1‑298 AGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGGTGTTGATCCCGGTCTTCCTCTTTCCGCAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTACTCGGCGT > 2:516858/1‑298 GAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGT < 1:322730/298‑1 CTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTAT < 1:343552/298‑1 TCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCG < 1:453816/298‑1 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CTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCT > 1:306291/1‑298 TCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCT > 2:247593/1‑298 TCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCT < 1:250691/298‑1 TATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTC < 1:345697/298‑1 TTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCAT > 1:375288/1‑298 TTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCA > 2:29831/1‑242 TTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCA < 1:29831/242‑1 GTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAG < 1:31391/298‑1 TTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGG > 2:64754/1‑298 TACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTCACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGA < 1:373692/298‑1 TGAGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTTGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTCTTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTCTGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCCGTGCTACTACGTCACCTCCGGGCAGGAGTTCTCGCGGGGCGTGCT > 2:227916/1‑298 AGGGGATCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGATCGTTATGT > 1:293840/1‑298 gtctttgCAGGGCTACACCCCTTGTCAGCGTTAAAGACCGGGTTTGGCAACTGCTCTACTTTTGGTTTGTCTGTACTCAGATACAAGCCATGATTTGCATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCAACGCGATGTTATTCAGATCGCTGGTGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTGATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTTGT < 2:208156/291‑1 TCTCTCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCACCGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCCGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCCCTCTGGCGCCGCTATGCTACTCCGGCATCTACGGGCCGGAGTGTTCCGCGAGCGTTCTGTTTTTGt > 2:346943/1‑297 CTCGCAGGGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTTGTGAT < 1:136406/298‑1 TGATATCATGCTGCTAATCGCCCTGATGCTTCAACTAACATGTTGGCTTGCGGGCGTTCATGCTCAGAAACAAGGTTGGGACAAGCACTTCCAGGCTAACACAGTCAGAAATCGAAACGTACTCTCAACAGTTCGCTTAGGCATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACAAGGGAAGACTTACTCGTGGCTGCAACCCTACTAGCTCAAAATTTATTCACACATGGTTACGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCTCTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP006584/4187818‑4188086 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCTAAACCCCTTTTTAGCTGGAAAGCCCTGGGTTGGGCACTGCTCTACTTTTGGTTTTTCTCTACTCTGCTACAGGCCATTATTTACATCAGTGGTTATAGTGGCACCAACGGCATTCGCGACTCGCTGTTATTCAGCTCGCTGTGGTTGATCCCGGTATTCCTCTTTCCGAAGCGGATTAAAATTATTGCCGCAGTAATCGGCGTGGTGCTATGGGCGGCCTCTCTGGCGGCGCTATGCTACTACGTCATCTACGGGCAGGAGTTCTCGCAGAGCGTTCTGTTTGTGAT < CP006584/4334576‑4334286 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |