New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006584 | 2030792 = | NA (NA) | 57 (0.900) | 53/576 | 0.3 | 100% | intergenic (+74/+105) | znuB/LY180_09680 | zinc transporter/hypothetical protein |
? | CP006584 | 2414712 = | 0 (0.000) | coding (1018/1644 nt) | LY180_11545 | multidrug ABC transporter ATP‑binding protein |
TGATTATTACTTCACTGCTGATTATTCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTGCCATTAGCCGCCAGACGGTCGCGGAACGCCCGTCCCCACTCAGTCTTAC > CP006584/2030501‑2031063 | tGATTATTACCTCCCTGCTGATTATTCCTGCAGCTACTGCGTGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTAGGGATGGGGGCAGGAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGt < 1:59078/298‑1 (MQ=255) ttattaCTTCACTGCTGATTATTCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTAt > 2:311115/1‑298 (MQ=255) attCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTg > 2:502708/1‑298 (MQ=255) cTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATTTAGATCCTGTTCTGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTcc > 2:166155/1‑298 (MQ=255) cTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCCGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTTCTGGTcc > 1:557302/1‑298 (MQ=255) cTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCACGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCg > 1:59738/1‑298 (MQ=255) tgtttttGCCCGAGCGCCGGAGCAGATGGTTGGTGTTGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCa < 2:288419/294‑1 (MQ=255) cGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAg < 1:502708/298‑1 (MQ=255) tctggtcccGGACGCCGGAACCGGTGGCTGGTGTGGCTTTTTTTGTTGGGATGGGGGCAGTAACGGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTAGGTGGTGCCATGTGCGGCACTGTTATTGATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAgg < 2:562450/292‑1 (MQ=37) gCTTTGCCCGTACGCCCGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTCTGGTGGTGATGGTCGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGTCGCTGTTATCTATACTCAGTACGCTGCAGAAGCAGGCCAGCTAAGATATCTCTAACCACACTTGTCCGATTCCTCGAGTGTGCCTGATCCGCCCCACATCGTCAGAGCAGCTTGCAGCACCTGGTGGTGCCCGCCCGTTGTTTCCTGGCCCCGTTTCCCGGAGTGccgc > 2:175511/1‑295 (MQ=255) ccGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCa < 1:311115/298‑1 (MQ=255) cGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAg > 1:158434/1‑298 (MQ=255) gTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCTGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGa < 1:400221/298‑1 (MQ=255) gATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACATCGCCGTCa > 1:152625/1‑298 (MQ=255) tGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGGTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAgg > 1:183148/1‑298 (MQ=255) gtggtggCGCTGTTTTGGGGGGGATGGGGGCGGTAGCGGGGGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCGATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGgcgc < 2:81436/297‑1 (MQ=255) tggCTGTTTTGGTGGGGATGGGGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑tttt < 1:506077/296‑1 (MQ=255) gTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCa < 1:424973/298‑1 (MQ=255) ttGGGGGGGTTGGGGGCATTAATTTGCGTTTTAACCTGTTCCGCGTTTTACGGTACGCGGGGGGGGCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCAATGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGAGGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATcc < 2:393833/298‑1 (MQ=25) tAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGCCATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCACCGTCAGGCCCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGCTTTTTActcc > 2:587057/1‑298 (MQ=255) ggTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATATATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCTGGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTAATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCgg > 1:242957/1‑298 (MQ=255) ttAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGAtt > 1:57323/1‑298 (MQ=255) ttttCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTGTTTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGcc > 2:451023/1‑298 (MQ=255) tgTTTTACGGTACGGCGGGTGGTCCGTGGGTGGTGCTATGTGCGGCACTTTTATTTATTCTCAGGATGATGAGAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACAGTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCa < 2:382070/297‑1 (MQ=255) ggcggggTCCGTGGGTGGTGATATGTGGGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGGGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCt < 2:250636/294‑1 (MQ=255) ggCGGCCATGTTATTTATTCTCATGATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCTCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTACATACTGTGATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCCGACTTCAGCACTCCATACGCCACCt < 2:242957/297‑1 (MQ=255) gggCAGTGTTATTTATTCTCAGTATGGTGAAAAAGCGGGCCAGCTAATCTATCGCTGGACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGTACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCtgt < 2:419039/297‑1 (MQ=255) cACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGcc < 1:104129/298‑1 (MQ=255) ttatttatTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACGGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCtt < 1:166155/298‑1 (MQ=255) tcAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTTAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCTACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCCTCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCatcatc < 1:78064/298‑1 (MQ=255) tcAGTATGAGGAAAAAGCATGACAGATAATCTATCGCTGAACACATTTGGCGGATGCGGCGCGGGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGGGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCatcatc < 2:392522/298‑1 (MQ=255) aGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATcgc > 1:300997/1‑298 (MQ=255) aaaaaGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAAt > 1:453001/1‑298 (MQ=255) tAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCtt < 1:587057/298‑1 (MQ=255) cTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCCGCTTGCCCATCCTCGCGCCGCGAATCACCTTTCCTTTCTTTCCa > 2:481954/1‑298 (MQ=255) gAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGCAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCCGCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCCATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCAGTGACGCATCCAACGGCACGCCTGCCTCCAGCACCCCCTCCGCCACCTGCTGCAGCTGTCCCATCCTCCCCCCGACAACCACCTCTCCTTCCTTCCCCTTcgccgc > 2:79182/1‑298 (MQ=11) acccaTTTGGCGGGTGCGGGGCGAGGGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGGGACATTTTGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTGCCATTAGCCGCCa < 2:158434/295‑1 (MQ=255) aTTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGt < 2:426896/130‑1 (MQ=255) aTTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGt > 1:426896/1‑130 (MQ=255) aTGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTGCCATTAGCCGCCAGACGGTCGCGGaa < 1:470168/298‑1 (MQ=33) aTGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCATCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCCAACGCCACGCCTGACTTCAGCACTCCCTACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCCTCATCGCCCCGCGAAACCCCTTTCCCTTCTCGCCCTTACCCCCCCGAccgcccccgca > 2:419139/1‑288 (MQ=11) aCCTACATATTTCGTGCGACATTTAGATATTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTCCCTGGCCCTGTTTCCCTGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTGCCATTAGCCGCCAGACGGTCGCGGAACGCCCGTCCCCACTCAGTCTTAc < 1:462725/298‑1 (MQ=2) | TGATTATTACTTCACTGCTGATTATTCCTGCAGCTACTGCGCGTCGCTTTGCCCGTACGCCGGAACAGATGGCTGGTGTCGCTGTTTTGGTGGGGATGGTGGCAGTAACTGGCGGTTTAACCTTTTCCGCGTTTTACGATACGCCGGCGGGTCCGTCGGTGGTGCTATGTGCGGCACTGTTATTTATTCTCAGTATGATGAAAAAGCAGGCCAGCTAATCTATCGCTGAACACATTTGTCGGATGCGGCGCGAGCGCCTTATCCGACCTACATAGTTCGTGCGACATGTAGATACTGTTATGGCCTGCAAGTTTTTTCCTGGTCCGGTTTCCCGGATTGCAGGCATGCCAGACACAGCGCCGTCAGGCGCTG‑TTTTTTTCATCCCTTCCGCGATTTTTACGCCGCTACCGGATTATGCCGTGACGCATCGAACGGCACGCCTGACTTCAGCACTCCATACGCCACCTGTGCCAGCTTGCGCATCATCGCGCCGAGAATCACCTTTCCTTTCTTGCCATTAGCCGCCAGACGGTCGCGGAACGCCCGTCCCCACTCAGTCTTAC > CP006584/2030501‑2031063 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |