| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP006584 | 3305035 = | 2 (0.030) | 62 (0.970) | 53/582 | 0.3 | 96.9% | intergenic (‑341/‑33) | ribB/LY180_15715 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone 4‑phosphate synthase/hypothetical protein |
| ? | CP006584 | = 3672182 | NA (NA) | coding (475/477 nt) | LY180_17575 | membrane protein | |||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GTCTTAGGAGTGGCGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAA > CP006584/3304739‑3305321 | gTCTTAGGAGTGGCGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGc > 1:112295/1‑298 (MQ=255) tCTTAGGAGTGGCGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCa > 1:287477/1‑298 (MQ=255) gccgaacgagcagctcagagcgttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACt < 1:570740‑M1/5‑1 (MQ=255) gaacgggcaggtcgggggggttggatatcatgctgctaatcggcctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCaa > 2:301281‑M1/291‑298 (MQ=255) aacgagaagctcagagcggtttgatttcatgctgctaaccgccctgatgcttcaactaacatgttgggttgcgtgcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAac > 2:316430‑M1/290‑298 (MQ=255) acgagcagctcagagcgttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAaca < 1:496001‑M1/10‑1 (MQ=255) agctcagagcgttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATc > 1:118206‑M1/283‑298 (MQ=255) caggcctttttgatatcatcgtgctaatcgccctgatgattcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaagggtgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaattgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCGCTCAACACCTATCAGTa > 2:348184‑M1/279‑298 (MQ=255) agagcgttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTAc > 1:18541‑M1/278‑298 (MQ=255) taGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatccc < 1:256210‑M1/298‑12 (MQ=255) gttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacccatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcagaactcaacacccacacgtaccagga < 2:184194‑M1/26‑15 (MQ=255) aaCGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACACAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCACCACtgatcaatcccctaatgattt > 2:576722‑M1/1‑277 (MQ=255) tcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAAt < 1:336714‑M1/35‑1 (MQ=255) ctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattccaacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACGACACAGATTGAcc < 2:455068‑M1/43‑1 (MQ=255) taatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGAccc < 1:585635‑M1/44‑1 (MQ=255) tCCCTGCCCGACAGATTCGTTACCCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatca < 2:448564‑M1/298‑34 (MQ=255) 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aacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAAtcgct > 2:397110‑M1/233‑298 (MQ=255) ttgcgggcggtcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCa > 2:103971‑M1/222‑298 (MQ=255) ccGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaaggtggatacacatcttgtcatatg < 1:232173‑M1/298‑67 (MQ=255) 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aCCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaaggtggatacacatcttgtcatatgatcaaatggtttcgcgaaaaatcaataatcagacaacaagatgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacacttaaaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgcattacttgactgtaaaactctcactcttaccgaactt > 1:584866‑M1/1‑31 (MQ=255) aCCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaaggtggatacacatcttgtcatatgatcaaatggtttcgcgaaaaatcaataatcagacaacaagatgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacacttaaaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgcattacttgactgtaaaactctcactcttaccgaactt < 2:584866‑M1/269‑239 (MQ=255) | GTCTTAGGAGTGGCGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAA > CP006584/3304739‑3305321 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |