| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006584 | = 3305045 | 3 (0.050) | 71 (1.110) | 66/582 | 0.1 | 96.0% | intergenic (‑351/‑23) | ribB/LY180_15715 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone 4‑phosphate synthase/hypothetical protein |
| ? | CP006584 | 3344745 = | NA (NA) | coding (164/330 nt) | LY180_15880 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GGCGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGAC > CP006584/3304750‑3305339 | ggcggcATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAACGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtg > 1:298205‑M1/1‑296 (MQ=255) agctcagagcgttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATc > 1:118206‑M1/283‑298 (MQ=255) agagcgttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTAc > 1:18541‑M1/278‑298 (MQ=255) taGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatccc < 1:256210‑M1/298‑12 (MQ=255) gttttgatatcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacccatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcagaactcaacacccacacgtaccagga < 2:184194‑M1/26‑15 (MQ=255) aaaaTAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaat > 1:554925‑M1/1‑282 (MQ=255) aaaaTAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaat < 1:233348‑M1/298‑17 (MQ=255) aaCGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACACAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCACCACtgatcaatcccctaatgattt > 2:576722‑M1/1‑277 (MQ=255) atcatgctgctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATAAGTACAGGGAAACTACaa < 2:464273‑M1/34‑1 (MQ=255) ctaatcgccctgatgcttcaactaacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattccaacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACGACACAGATTGAcc < 2:455068‑M1/43‑1 (MQ=255) 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aacatgttggcttgcgggcgttcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAAtcgct > 2:496001‑M1/233‑298 (MQ=255) ctctcCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaaggtggatacacatct > 1:390001‑M1/1‑241 (MQ=255) ttgcgggcggtcatgctcagaaacaaggttgggacaagcacttccaggctaacacagtcagaaatcgaaacgtactctcaacagttcgcttaggcatggaagttttgcggcattctggctacacaataacaagggaagacttactcgtggctgcaaccctactagctcaaaatttattcacacatggttacgctttggggaaattatgaggggatctctcaGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCa > 2:103971‑M1/222‑298 (MQ=255) ccGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaaggtggatacacatcttgtcatatg < 1:232173‑M1/298‑67 (MQ=255) aCTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaaggtggatacacatcttgtcatatgataa > 2:470100‑M1/1‑228 (MQ=255) tctAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaaggtggatacacatcttgtcatatgatcaaa > 2:314894‑M1/1‑226 (MQ=255) 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aCCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACtgatgaatcccctaatgattttggtaaaaatcattaagttaaggtggatacacatcttgtcatatgatcaaatggtttcgcgaaaaatcaataatcagacaacaagatgtgcgaactcgatattttacacgactctctttaccaattctgccccgaattacacttaaaacgactcaacagcttaacgttggcttgccacgcattacttgactgtaaaactctcactcttaccgaactt > 1:584866‑M1/1‑31 (MQ=255) tCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAACCAGCCAGATCCaga > 1:138504/1‑298 (MQ=255) acacCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGAc > 1:279776/1‑298 (MQ=255) | GGCGGCATATAGCCAAAATAACGTGAGCGGGTCCATGCCCGACAGAATCGTTACTCTCTCCCATCCGGACTCTAACCGTCGGCCCCGGAATTACACCGGATCTGCTGTCCTTTGAGTTCGCACCCAAAGCGCTCGCGGGCTTTCAACTGAGTTGATTTACCGCCGGTGGGGAATTTCGCCCCGCCCTGAGAATAAGCGGATTCACTATAACGCTAATGATTAGCGGCAGCAACGCATAGCTTCACATAATTCTGGTTTATGACTTACCCTTATCGCACTACAATGGCACTCAACACCTATCAGTACAGGGAAACTACAATGATTGACCCGAAAAAAATTGAGCAAATCGCTCGCCAGGTTCACGAATCAATGCCTAAAGGAATCAGGGAGTTCGGGGAAGATGTGGAGAAAAAAATCCGCCAAACCCTACAAGCTCAGCTGACGCGCCTCGACCTTGTAAGCCGTGAAGAGTTCGACGTCCAAACGCAAGTCCTGTTACGGACTCGTGAGAAACTGGCGCTGCTTGAACAAAGAATGAGCGAACTGGAAAATCGCAGTACTGAGATTAAAAAGCAGCCAGATCCAGAGAC > CP006584/3304750‑3305339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |