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Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
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gCCctgagagatcccctcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagccacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaagcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtcccaaccttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgattagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggct > 1:351690‑M1/1‑3 (MQ=255) cctgagagatcccctcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagccacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaagcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtcccaaccttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgattagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctat > 1:479253‑M1/1‑1 (MQ=255) cctgagagatcccctcataatttccccaaagcgtaaccatgtgtgaataaattttgagctagtagggttgcagccacgagtaagtcttcccttgttattgtgtagccagaatgccgcaaaacttccatgcctaagcgaactgttgagagtacgtttcgatttctgactgtgttagcctggaagtgcttgtcccaaccttgtttctgagcatgaacgcccgcaagccaacatgttagttgaagcatcagggcgattagcagcatgatatcaaaacgctctgagctgctcgttcggctat < 1:439354‑M1/298‑298 (MQ=255) | AGTTACTAATCATTCATTTTCTACTTATATTTATATAAAGGAATATTATGTCTGCTTTTAAAAAGTCACTTCTTGTTGCTGGCGTAGCAATAATTCTTTCCAATAACGTATTTGCTGACGAAGGTCACGGCATTGTTAAATTTAAAGGTGAAGTTATCTCTGCTCCATGTTCAATTAAACCAGGTGACGAAGACTTAACTGTAAATCTGGGTGAAGTAGCAGATACCGTTCTGAAAAGCGACCAGAAATCTTTGGCTGAGCCTTTCACTATTCACCTGCAAGACTGCATGTTGAGCCAGGGTGGAACCACTTATTCAAAAGCGAAGGTTACTTTCACCACAGCGAATACTATGACGGGTCAGACTGACCTGCTGAAAAACACCAAAGAAACTGAAATCGGTGGTGCCACAGGCGTTGGCGTACGTATTCTGGATAGCCAGAGCGGCGAAGTGACTTTAGGTACTCCGGTAGTAATTACATTCAACAATACTAACAGCTATCAGGAACTGAACTTCAAAGCTCGTATGGAATCCCCAAGCAAAGATGCTACCCCGGGCAACGTTTACGCTCAGGCTGACTATAAGATTGCTTACG > CP006584/3305594‑3306187 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |