Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	CP006584	1644427–1644851	1645294–1644922	72–868	20 [17]	[18] 20	LY180_07765/LY180_07770	transposase/sulfatase

GTCGCTCTTTGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATCAACAACGCCAATTGCCTCATCGGTTAACTGATCGCTGATATAACCTTTT  >  CP006584/1645174‑1645592                                                                                                                          |                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gTCGCTCTTTGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTCCTGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAAGTCGGGGCAGAATTGGTAACGAGAGGCGTGTAAAATATCGATTTGGCAACTCTTGTTGTATGATTATTCATTTTTCGCGAAACCATTTGATCACATGACAACTTGTGTATCTCCcttaacttactt                                                                                                                           >  2:537366/1‑295 (MQ=11)      tctTTGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCAGTAAGAGTGCGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCACCGTTAAGCTGTTTAGTCGTTTTAAGTGTACTTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGGGTCGTTTAAAATATCGAGTTCGCACCTCGTGTTGTCTGATTATTTATTTTTCGGTAAACCATTTGATCATATGAAAAGAGTTGTATCTACTTTAATTTAATGAtttt                                                                                                                      >  2:535234/1‑298 (MQ=11)                                           ttCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCAt                                                                                 >  1:402023/1‑298 (MQ=21)                                                        atgttTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCa                                                                    <  1:29712/298‑1 (MQ=255)                                                         tgttTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCaa                                                                   <  2:110438/298‑1 (MQ=255)                                                         tgttTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCaa                                                                   >  1:535206/1‑298 (MQ=255)                                                                       tttGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGAATAACAGGCTGGTCACGTGTTTTGGCCCGa                                                     >  2:107103/1‑298 (MQ=255)                                                                         tggttggCAGGTTAAGGGCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTAAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTTTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATc                                                   <  2:17048/298‑1 (MQ=255)                                                                          ggttggCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATca                                                  <  2:443626/298‑1 (MQ=255)                                                                           gttggCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATcaa                                                 <  1:122645/298‑1 (MQ=255)                                                                                       cGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATCAACAACGCCAATTg                                     <  2:469490/298‑1 (MQ=255)                                                                                         gCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATCAACAACGCCAATTGcc                                   <  2:164647/298‑1 (MQ=255)                                                                                              gTTGGGTAAGTGTAGGAGTTTTACAGGCAATTAAGGGGTGGAAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGGGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACGTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATCAACAACGCCAATTGCCTCATc                              <  2:244792/298‑1 (MQ=17)                                                                                                       gagTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATCAACAACGCCAATTGCCTCATCGGTTAACTg                     <  1:532271/298‑1 (MQ=255)                                                                                                        agTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATCAACAACGCCAATTGCCTCATCGGTTAACtta                    >  1:424542/1‑296 (MQ=255)                                                                                                        agTGAGAGGTTTACATGCGAGTAGGGCGGGTGAAGCCAACGTTAAGGTGTGGAGGTGTTTTAAGTTTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATCAACAACGCCAATTGCCTCATCGGTTAACTGa                    <  2:558749/298‑1 (MQ=18)                                                                                                             gagTTTTACAGTTAAGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATCAACAACGCCAATTGCCTCATCGGTTAACTGATCGCt               >  1:243547/1‑298 (MQ=255)                                                                                                                 tgtaaaGTCAAGGAAGGAGTGGCAAGCCAACGGTAATCTGTTGATTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTTGTAAAGATAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGGCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATATACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTCGCACGATCAACAACGCCAATTGCCTCATCGGTTAACTGATCGCGGata           <  2:97215/293‑1 (MQ=18)                                                                                                                        taaaGTAAGGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATCAACAACGCCAATTGCCTCATCGGTTAACTGATCGCTGATATAACCtt    <  2:334986/296‑1 (MQ=255)                                                                                                                          aaGTAAGGCGTGGAAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATTTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTGGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATCAACAACGCCAATTGCCTCATCGGTTAACTGATCGCTGATATAACCtttt  <  2:558756/298‑1 (MQ=255)                                                                                                                          |                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTCGCTCTTTGTGGAGGTGACGATTACCTAACAATCGGTCGATTCGTTTGATGTTATGTTTTGTTCTCGCTTTGGTTGGCAGGTTACGGCCAAGTTCGGTAAGAGTGAGAGTTTTACAGTCAAGTAATGCGTGGCAAGCCAACGTTAAGCTGTTGAGTCGTTTTAAGTGTAATTCGGGGCAGAATTGGTAAAGAGAGTCGTGTAAAATATCGAGTTCGCACATCTTGTTGTCTGATTATTGATTTTTCGCGAAACCATTTGATCATATGACAAGATGTGTATCTACCTTAACTTAATGATTTTGATAAAAATCATTAGGGGATTCATCAGGGTAAAGCATAAAAGGCTGGTCAAGTGTTTTGGCACGATCAACAACGCCAATTGCCTCATCGGTTAACTGATCGCTGATATAACCTTTT  >  CP006584/1645174‑1645592

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑