New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3209213 | 65 (0.890) | 5 (0.070) | 5/276 | 6.9 | 7.9% | coding (1190/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
? | NC_000913 | = 3209256 | 56 (0.820) | coding (1233/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
TTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGCAGTGGTTATCTGCCAACGGCGGATTACTGG > NC_000913/3209110‑3209403 | tttGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgc < 2:452814/151‑1 (MQ=255) ggCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTgg > 2:511850/1‑151 (MQ=255) aCTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGaaa > 2:169321/1‑149 (MQ=255) cTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATg > 2:225423/1‑150 (MQ=255) cTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATg > 2:109009/1‑150 (MQ=255) gTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCg > 1:1150194/1‑151 (MQ=255) gTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCg > 1:172793/1‑151 (MQ=255) cagCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATccc < 1:438473/150‑1 (MQ=255) gTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGtt > 2:436165/1‑151 (MQ=255) gTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGtt > 2:1047519/1‑151 (MQ=255) tggCCGACGATGGTGATGGTGGCGTTGGTTGTGGTATGTTGTCTACTGCGCTACTTTTTCGCTAGCGCCACGTCGTATACCTCCGCTCTCGCACCACTGATGATTAATGTTGCGGTAGCGATGCCGGAGATCTCGTTGCCGATGTCCTGcc < 2:828323/149‑1 (MQ=255) tCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCGCCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGcc < 2:1124988/151‑1 (MQ=255) tCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTgtc < 1:634513/151‑3 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATCCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtgg < 1:71814/151‑1 (MQ=255) cGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggt > 2:521692/1‑151 (MQ=255) atggtgatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttg < 1:82733/151‑1 (MQ=255) ggtgatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGGATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGAtggttggt > 2:592301/1‑151 (MQ=255) tgatggtgGGGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGc < 1:461837/151‑1 (MQ=255) tgatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGc < 2:758277/151‑1 (MQ=255) tGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGt > 2:1158927/1‑149 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTTCGCTAGTTTTTCGCCAGCGCCAGGGCGTAGACCTCCGCTCGCGTACCTATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCTTGATGGTTGGTGCGGGAATTGGTCTggga < 2:166529/151‑2 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATTCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTgggg < 2:22944/151‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTgggg < 1:553442/151‑1 (MQ=255) gtggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTggggg > 2:249949/1‑150 (MQ=255) gtTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTg > 1:578507/1‑137 (MQ=255) gtTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTg < 2:578219/137‑1 (MQ=255) gtTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCAtt > 2:619559/1‑151 (MQ=255) gtTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGACACGGCGGAGACCTCCGCTCTCGAACCGATGATGATTGGTGCTGCGCTGGCGAGGACGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCAGCCTGTCGGTTGGAGAGGCAATTGGTCTGAGGaccgtt > 2:543447/1‑146 (MQ=255) ttttATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTc < 2:701145/151‑1 (MQ=255) ttttATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTc < 1:557112/151‑1 (MQ=255) aTCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTa > 2:850111/1‑150 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTacac < 1:874536/151‑1 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTacac < 2:780022/151‑1 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTacac < 1:731930/151‑1 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTacac < 1:383355/151‑1 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTacac < 1:225487/151‑1 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTacac < 1:214883/151‑1 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTacac < 1:171195/151‑1 (MQ=255) tACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACGcc < 1:1110049/151‑1 (MQ=255) aCTGCGCTACGTTTTCGTCCGCGCCACGGCGTATCCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCa < 2:608497/151‑1 (MQ=255) cTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCCCCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGcc < 1:217933/151‑1 (MQ=255) cTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGcc < 1:160720/151‑1 (MQ=255) gtttttCGCCAGCGCTACCGTGGATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGACATCCCGCTGACGGTGCTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGCATGGGGAGCATTCTTACACCATACGCTAc > 2:620706/2‑150 (MQ=255) cGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGcccc < 1:906342/151‑1 (MQ=255) cgcCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTc < 1:250024/149‑1 (MQ=255) ccACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGAt > 2:1024234/1‑151 (MQ=255) aCGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGAttt < 1:760672/151‑1 (MQ=255) gtcGTACATCTCCGTTCTCGCCCCGAGGATGATTGCTGCTGCACTGGCGATGCCGGAAATCCCGCCGCAGGGGTTCCGCCTGATGCTGGGTGCGGCACGTGGTCTGGGGCGCATGCTTACACCATACGCAACTGCACCCCGTCCGAATta > 2:839046/3‑150 (MQ=255) taCCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGc < 1:408010/151‑1 (MQ=255) ccTCCGCTCTGGCACAGATGATGAGTGCGGCTGCGCTGGAGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTCACTGTTGGTTGGTCCGGGCATTGGTGTGGGGAGCATTCTTAAACCATACGCCACCGGCCCCAGTCAGCATTACTACGGCAg > 2:990857/1‑151 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCCGTCCGATTTACTACGGCAg > 2:1081375/1‑151 (MQ=255) ccTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGCAg > 1:524004/1‑151 (MQ=255) ccGCTCTCGCCCCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATGCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGCAGTgg < 1:882682/151‑1 (MQ=255) ccGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGCAGTgg < 2:399992/151‑1 (MQ=255) ccGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGCAGTGGTTATCTGCCaa > 1:961137/1‑151 (MQ=255) gatgatgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGTGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGTTTTACTACGGCAGTGGCTATCTGCCAAcg > 2:551945/1‑151 (MQ=255) gatgatgatTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGCAGTGGTTATCTGCCAAcg > 2:233284/1‑151 (MQ=255) tgatgagTGCGGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAAGCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGCAGTGGTTATCTGCCAAcggc < 2:975494/151‑1 (MQ=255) tgctgcGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGCAGTGGTTATCTGCCAACGGCGGATTACTgg < 1:962842/151‑1 (MQ=255) | TTTGGCAAACTGTTAGCAGGCAGCTTAAGCGGTTATTCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCCGCTGCCGGTGTTCTGCCTGATGGTTGGTGCGGCAATTGGTCTGGGGAGCATTCTTACACCATACGCCACCGGCCCCAGTCCGATTTACTACGGCAGTGGTTATCTGCCAACGGCGGATTACTGG > NC_000913/3209110‑3209403 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |