New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 398392 | 45 (1.100) | 4 (0.110) | 4/270 | 3.9 | 8.7% | coding (521/1095 nt) | yaiW | microcin Bac7 uptake protein; outer membrane surface‑exposed lipoprotein |
? | NC_000913 | = 398378 | 43 (1.160) | coding (507/1095 nt) | yaiW | microcin Bac7 uptake protein; outer membrane surface‑exposed lipoprotein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
ATCAAATCGCCAAACGGCAAAAGTTATAGCGAACGGTTAGATTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAAT > NC_000913/398247‑398528 | atcaaatcGCCAAACGGCAAAAGTTATAGCGAACGGTTAGATTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGc < 2:536756/151‑1 (MQ=255) aaaCGGCAAAAGTTATAGCGAACGGTTAGATTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTc < 2:501051/151‑1 (MQ=255) cGGCAAAAGTTATAGCGAACGGTTAGATTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAg > 2:489440/1‑150 (MQ=255) cAAAAGTTATAGCGAACGGTTAGATTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCAt < 1:265039/150‑1 (MQ=255) aaGTTATAGCGAACGGTTAGATTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTg > 2:303485/1‑149 (MQ=255) ttATAGCGAACGGTTAGATTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCtt < 1:361445/149‑1 (MQ=255) ataGCGAACGGTTAGATTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTg > 1:250415/1‑150 (MQ=255) aCGGTTAGATTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAg < 1:386970/151‑1 (MQ=255) cGGTTAGATTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAg > 1:248265/1‑150 (MQ=255) ggTTAGATTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCa > 2:35152/1‑151 (MQ=255) tAGATTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATAc < 1:524182/151‑1 (MQ=255) gATTAGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGGGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCa > 2:128115/1‑151 (MQ=255) aTTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGGGCGCGATTTTGGCGGATCTGATCAACAGGGGGCCAATGGGGCAGACGCTGTTGGGTTCGCTCAATCCGGTGGGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATAcc < 2:166320/149‑1 (MQ=255) aTTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCaa < 1:305716/151‑1 (MQ=255) gTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAGCATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAGCAGCATACCAAAggg < 1:454403/150‑1 (MQ=255) tACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCg < 1:109514/151‑1 (MQ=255) gAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGAGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGa > 1:549740/1‑151 (MQ=255) cAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAAt < 2:438802/149‑1 (MQ=255) cAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAAt < 1:258101/149‑1 (MQ=255) aTTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGCTGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGGATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTc > 2:495839/1‑150 (MQ=255) aTTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTcc < 1:391353/151‑1 (MQ=255) aTTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTc < 2:379241/150‑1 (MQ=255) tGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAg < 2:220195/151‑1 (MQ=255) aCGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAgg < 2:293744/150‑1 (MQ=255) gATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAg > 2:353459/1‑151 (MQ=255) cTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGt > 2:322933/1‑149 (MQ=255) cTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCt < 1:291497/151‑1 (MQ=255) cTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGATCGCTCAATCCGGTGCGCTCCGGAGGGCCGATGCAGGTCAGTATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCCAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGt > 2:548562/1‑149 (MQ=255) gctCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCtt > 1:495996/3‑150 (MQ=255) gATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCtt > 1:402761/1‑150 (MQ=255) gATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACC‑AAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCa > 1:215740/1‑151 (MQ=255) aTCAACATGGGGCCAATGGGGAAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCGGATGCAGGTCAGCATTGGTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTc < 2:277087/150‑1 (MQ=255) ggggCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTcgccg > 2:489644/4‑150 (MQ=255) gTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCcgcg > 1:647501/1‑151 (MQ=255) ggCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTtgtg > 1:341004/1‑151 (MQ=255) aCGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCCCCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGtt < 2:379367/149‑1 (MQ=255) gTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTggga > 2:472046/1‑147 (MQ=255) gTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTAcc < 1:128090/150‑1 (MQ=255) tCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACt < 2:105036/151‑1 (MQ=255) aTCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGGTGTGGTTTGGGACTTACCATTTACTGaa > 2:543620/1‑151 (MQ=255) aTCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGGGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGaa > 2:237524/1‑151 (MQ=255) tCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAAt < 1:81937/151‑1 (MQ=255) tCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAAt < 2:647708/151‑1 (MQ=255) | ATCAAATCGCCAAACGGCAAAAGTTATAGCGAACGGTTAGATTCGGTGCGTACAGAAAAGCAATTGAGCGCGATTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAAT > NC_000913/398247‑398528 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |