| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,401,844 | A→G | I471T (ATC→ACC) | abgB ← | p‑aminobenzoyl‑glutamate hydrolase, B subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,401,844 | 0 | A | G | 99.1% | 378.2 / ‑4.0 | 107 | I471T (ATC→ACC) | abgB | p‑aminobenzoyl‑glutamate hydrolase, B subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (66/40); total (66/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.83e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.63e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CCTTGTTACCAATTCTTTCGACCCAGCCATAGAGCTTCCCGGATTGGGAGGACGACGGTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGATAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCAAGGAAGAGATTGACTGTGGTTGCTGCCATAGTTTTCGCCGCCAGCAGCATTCCTTTATGAGCAATAGATGTT > NC_000913/1401698‑1401990 | ccTTGTTACCAATTCTTTCGACCCAGCCATAGAGCTTCCCGGATTGGGAGGACGACGGTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAgg > 2:1545325/1‑151 (MQ=255)ccTTGTTACCAATTCTTTCGACCCAGCCATAGAGCTTCCCGGATTGGGAGGACGACGGTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAgg > 2:220307/1‑151 (MQ=255)ccTTGTTACCAATTCTTTCGACCCAGCCATAGAGCTTCCCGGATTGGGAGGACGACGGTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGGGTCACGTTTTTCGGGGTAgg > 2:104394/1‑151 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |