Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,571,036 | 0 | T | G | 45.7% | 93.6 / 15.0 | 71 | N239T (AAC→ACC) | eutE | aldehyde oxidoreductase, ethanolamine utilization protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (12/26); new base G (32/0); total (45/26) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.54e-10 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTTCATCGGCTACGCTATCAACAACAATCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGATATCCGGATTTGCCACAGTAACCA > NC_000913/2570899‑2571186 | gTTCATCGGCTACGCTATCAACAACAATCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCCGCGGGGTGCCAGCGcccg > 2:231042/1‑148 (MQ=255) tCATCGGCTACGCTATCAACAACAATCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCgg < 2:1083275/151‑1 (MQ=255) cGGCTACGCTATCAACAACAATCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTgcccgcgcc‑cgccggcat > 1:1633303/1‑145 (MQ=255) cGGCCACGCTATCAACAACAATCCGTACCTTTTCGTCGGTACAAATGATGTTGTTATCGAAAGACGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCCCTACCCGCGGGCTGCCTGCGCC‑TGCGG‑cctt > 1:310619/1‑148 (MQ=255) aTCAACAACAATCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTTCCCGCGCC‑TTCGG‑Cagctcgaccgttt > 1:290282/1‑139 (MQ=255) aTCAACAACAATCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCCACGCC‑CGCGG‑CA‑ATCAGaaggttt > 2:651180/1‑145 (MQ=255) aTCAACAACAATCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACCACCCGCGGGTTTCCAGCGCC‑TCCgggcaaccgacggtta > 2:1699057/1‑137 (MQ=255) tCAACAACAATCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTAt < 1:832640/151‑1 (MQ=255) acaacaaTCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTgg < 1:1713001/151‑1 (MQ=255) acaacaaTCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTgg < 1:1448797/151‑1 (MQ=255) acaacaaTCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCCGCGCC‑CGCCG‑CC‑ATCAGAA‑GCTTTTTgg > 1:1146930/1‑151 (MQ=255) aaTCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGGCAGCGCC‑TGGGG‑GA‑AACAGAC‑GGTTTTTTgtgggt > 2:1626021/1‑151 (MQ=255) aaTCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCCGCGCC‑CGCGG‑CC‑ATCAGAC‑GTTTTTTggggggg > 2:826802/1‑146 (MQ=255) aaTCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCCGCGCC‑CGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GGTTTTTtgtgtgg > 1:1706115/1‑150 (MQ=255) aTCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCCCTACCGGCGGGTTGCCCCCGCC‑CCCGG‑GA‑AATAAAC‑GTTTTTTtgtggggt > 2:1135963/1‑147 (MQ=255) aTCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCCGCGCC‑CGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GGTTTTTTGTGTGtt > 1:592824/1‑151 (MQ=255) gtcacTTTTCGTAGGCACAAATGAAGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGAAGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGGCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CACGTCAGAT‑GTGTTTTGTGGTGtttc > 1:3198/5‑149 (MQ=255) gTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATTCACCACTACCGGCGGGGTGCCAACGCC‑CGCGG‑CA‑AACAGAC‑GCTTTTTGGGGGGTTTTcg > 1:213820/1‑151 (MQ=255) gTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCCGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GGTTTTTTGGGGGTTTTcg > 2:430709/1‑151 (MQ=255) gTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCAGCGCC‑CGCGG‑GA‑ATCAGAC‑GTTTTTTTGGGTGTTTAcg > 1:556006/1‑151 (MQ=255) aCCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTAcgcg < 2:1706995/151‑1 (MQ=255) aCCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCAGCGCC‑CGGGG‑CA‑ATCCAAA‑GGTTTTTTGTGTGTTTGcggg > 2:133490/1‑149 (MQ=255) ccTTTTCGTCGGCACCAATGATGTTGTTATCGATAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGCTTCATCCACCACTACCCGCGGGTTGCCCGCCGC‑CGCGG‑CA‑AACACAC‑CTTTTTTTGTGTGgtttctcc > 1:1423642/1‑145 (MQ=255) cTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGGCAGCGCC‑TGGGG‑GA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGGGGGGTTACccgc > 2:737227/1‑150 (MQ=255) gCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTTCCCGCCCC‑CGCGG‑CC‑AACAGAC‑GGTTTTTGGGGGGGTTTCGCGCCGCCTcttcta > 1:1281800/1‑151 (MQ=255) gCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCCGCGCC‑TGCGGCCA‑ATC‑GAC‑GGTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTctcctt > 1:449767/1‑150 (MQ=255) gCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCCGCGCC‑TGCGG‑CG‑ATCCGAC‑GTTTATTTGGGTGGTTTCGCGCCGCCTcttcta > 1:965793/1‑151 (MQ=255) gCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCCGCGCC‑TGCGG‑CC‑ATCAGACGGTTTTTTGGGGGGTTT‑CGCGCCGCTTctacta > 1:36596/1‑151 (MQ=255) cacaAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCtactac < 2:416628/151‑1 (MQ=255) cacaAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCtactac < 1:139632/151‑1 (MQ=255) caAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCCGCGCC‑CGCGG‑CC‑ATCCGAC‑GGTTTTTTGGGGGTTTAAGCGCCGCTTcttctaac > 1:130412/1‑148 (MQ=255) caAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTTCCAGCGCC‑TTCGG‑CA‑ATCAGAC‑GGTTTTTTGTGTGTTTTCGCGCCGCCTCTTCTAcc > 2:42408/1‑150 (MQ=255) aaTGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCCCCACTACCGGCGGGGTGGCCGCGCC‑CGCGG‑CA‑CTCAGAC‑GGTTATTGGTGTGTTTTCGCGCCGCTTCTTCTAccc > 1:612051/1‑148 (MQ=255) atgatgTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCCGCGCC‑TGCGG‑GA‑AACCGGC‑GTTTTTTGGGGTGTTTTAGCGCCCCCTTTACTACCGCtt > 1:17542/1‑151 (MQ=255) atgatgTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCAACGCC‑TGCCG‑GA‑ATCAAAC‑GTTTATTTGGGTGTTTACGCGCCCCTTTTTCTACCGc > 2:422634/1‑149 (MQ=255) gttATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCAGCGCC‑CGCGG‑CC‑ATCAGAC‑GTTTTTTTGGGTGTTTTCGGGCCGCTTCTACTACCGCCTTGccc‑cc‑g > 1:1592272/1‑151 (MQ=255) gttATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCAGCGCC‑CGCGG‑CA‑ATCAGGC‑GTTTTTTGGTGTGTTTACGCGCCGCCTCTTCCACCGCTTCGccg‑cc‑g > 2:948501/1‑151 (MQ=255) cGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCCGCGCC‑TGCGG‑GA‑ATCAGAC‑GGTTATTGGGGTGTTTTCGCGCCCCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑gggtt > 1:598948/1‑147 (MQ=255) aaaGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTacca < 1:56340/151‑1 (MQ=255) aaaGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCCGCGCC‑TGCCG‑CA‑ATCAGAA‑GGTTTTTTGGGTAGTTTCCCGCCGCCTTTACTACCGCCTCGCCG‑CC‑GGGTatc > 2:682373/1‑148 (MQ=255) aaaGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCAATACCGGCGGGTTGGCCCCGCCTTGCGG‑CA‑AAC‑GGC‑GGTTCTTTGGGGGTTTACACGCCGCTTTTACTACCCCCTCGCCG‑CC‑CGTTacc > 2:1378335/1‑150 (MQ=255) aagaagCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTaccac < 2:720899/151‑1 (MQ=255) gaagCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTTCCAGCGCC‑TGCGG‑CG‑ATCAGAC‑GGTTTTTTGTGTGGTTTCGCCCCGCTTCTACTACCGCCTCCCCG‑CC‑GGGTAccacca > 1:815716/1‑151 (MQ=255) ccTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCCCTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGc < 2:36133/151‑1 (MQ=255) ccTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTTTTGGGGGGTTTTCGCGCCCCCTCTACTACCCCTTCCCCGCCC‑GGTTCcccccaccggg > 2:729748/1‑146 (MQ=255) ccTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGc < 1:509252/151‑1 (MQ=255) gACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCAGCGCC‑CGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTTTTTGTGTGTTTTCGCGCCCCTTCTACTACCCCCTCGCCC‑CC‑GGGTACCCCCAGCAGGCCGCTa > 2:1161471/1‑151 (MQ=255) aCGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCCGCGCC‑CGCGG‑CC‑AACAGAC‑GTTTTTTGGTGTGTTTTCCCGCCGCTTCTACTACCCCTTCGCCG‑CC‑CGGTTCCCCCAGCAGGCCGATaa > 2:424446/1‑150 (MQ=255) aCGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCAGCCCC‑CGCGG‑GC‑AACAGAC‑GGTTTTTTGTGGGTTTACGCGCCGCCTCTACTACCCCTTCCCCG‑CC‑GGGTatcacccacacggcgcta > 1:1313941/1‑138 (MQ=255) ggACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑CGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTTTTGGGGTGTTTTCGCGCCCCTTCTTCTACCGCCTCGCCG‑CC‑GGGTTCCACCAGCAGGCCGATACCCggg > 2:943147/1‑150 (MQ=255) aCTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGaaa < 2:159946/151‑1 (MQ=255) aCTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGaaa < 1:708827/151‑1 (MQ=255) gCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAA‑GGTTTTTGGGGTGGTTTCGCGCCGCTTCTACTAACCCCTCCCCG‑CC‑GGTTAACACCAGCAGGCCGGTACCCCGGAACCT‑GGACa > 1:970228/1‑151 (MQ=255) cACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGATTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTGCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACa < 1:1175635/150‑1 (MQ=255) aCGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAg < 2:636349/151‑1 (MQ=255) aCGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAg < 1:836218/151‑1 (MQ=255) ggCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGGTTCCAGCGCC‑CGCGG‑CC‑ATTAGAC‑GGTTATTTGGGGGGTTTCGCGCCCCTTCTCCTACCGCCTCGCCG‑CCGGGTTACC‑CCCGCAGGCCGGTACCCGGGAACTTGGAACAACCg > 1:1034406/1‑151 (MQ=255) gTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTgcg < 2:1531528/149‑1 (MQ=255) gTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAAAAAGCGGTGCGCGGGTTCGa > 2:22381/1‑151 (MQ=255) ttCATCCGCCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGata < 1:1682694/151‑1 (MQ=255) ttCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGata < 2:36617/151‑1 (MQ=255) ttCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGAAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGata < 2:599209/151‑1 (MQ=255) ttCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGGGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGata < 1:1426628/151‑1 (MQ=255) aTCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACgcgc < 1:124234/66‑1 (MQ=255) aTCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGGGTTTACgcgc > 2:124269/1‑66 (MQ=255) ccacTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGATATCCGGAtt < 2:128515/151‑1 (MQ=255) acTACCGGCGGGGTGCCAGCGCC‑CGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGGGGTTACGCGCCGCCTCCACCAACGCTTCGCCC‑CC‑GGGTAACACCAGCAGGCCGATACCCGGGAAACT‑GAACTAACGTTGCGCGGTTTCGCTATTCGGAtttt > 1:1201942/1‑150 (MQ=255) tACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTAGTGGTGTGTTTACGCGCCGCTGCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGATATCCGGATTTGcc < 1:1279746/151‑1 (MQ=255) tACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑GGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGATATCCGGATTTGcc < 2:1642767/151‑1 (MQ=255) cggGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGATATCCGGATTTGCCACAGTa > 1:881919/1‑151 (MQ=255) cggGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GGTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGATATCCGGATTTGCCACAGt < 1:327420/150‑1 (MQ=255) ttGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGATATCCGGATTTGCCACAGTAAcc < 1:1625212/150‑1 (MQ=255) ttGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGATATCCGGATTTGCCACAGTAAcc < 2:593082/150‑1 (MQ=255) ttGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGATATCCGGATTTGCCACAGTAAcc < 1:829237/150‑1 (MQ=255) ttGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGATATCCGGATTTGCCACAGTAACCa > 1:28543/1‑151 (MQ=255) | GTTCATCGGCTACGCTATCAACAACAATCAGTACCTTTTCGTCGGCACAAATGATGTTGTTATCGAAAGAAGCGCCTTTGACGATGGACTGAGCGGCACGGGCGAGGTCGGCGGTTTCATCCACCACTACCGGCGGGTTGCCAGCGCC‑TGCGG‑CA‑ATCAGAC‑GTTTATTGGTGTGTTTACGCGCCGCTTCTACTACCGCTTCGCCG‑CC‑GGTTACCACCAGCAGGCCGATACCCGGAAACTT‑GAACAAGCGTTGCGCGGTTTCGATATCCGGATTTGCCACAGTAACCA > NC_000913/2570899‑2571186 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |