| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 28,072 | C→T | G260G (GGC→GGT) | rihC → | ribonucleoside hydrolase 3 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 28,072 | 0 | C | T | 100.0% | 139.9 / NA | 42 | G260G (GGC→GGT) | rihC | ribonucleoside hydrolase 3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (19/23); total (19/23) | |||||||||||
GTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAA > NC_000913/27943‑28207 | gTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTAcc < 1:222670/139‑1 (MQ=255) cTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCacg > 2:329886/1‑139 (MQ=255) cTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCacg < 2:244391/139‑1 (MQ=255) tACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCacga < 2:108470/139‑1 (MQ=255) tACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCacga > 2:329638/1‑139 (MQ=255) tACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCacga < 2:417769/139‑1 (MQ=255) ccGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCacgacg < 1:399218/139‑1 (MQ=255) tAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACggtg < 1:16586/139‑1 (MQ=255) aGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGata > 1:217464/1‑139 (MQ=255) aGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGata > 1:58567/1‑139 (MQ=255) tATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATc > 2:116278/1‑139 (MQ=255) cAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTTGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACg < 1:100748/139‑1 (MQ=255) ggCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGcc > 2:244944/1‑139 (MQ=255) gCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCacgacg < 1:133162/116‑1 (MQ=255) gCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCacgacg > 2:133162/1‑116 (MQ=255) cACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAagccag < 1:357519/139‑1 (MQ=255) tGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCacga > 1:118753/1‑94 (MQ=255) tGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCacga < 2:118753/94‑1 (MQ=255) tCGCCTGGCTGGTGCGCCTGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAagcc < 1:286645/121‑1 (MQ=255) tCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACggtgg > 1:321047/1‑93 (MQ=255) tCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACggtgg < 2:321047/93‑1 (MQ=255) tCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAagcc > 2:286645/1‑121 (MQ=255) tCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGc > 1:389326/1‑139 (MQ=255) gctggTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGAt < 1:329886/139‑1 (MQ=255) ttCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCacgac < 1:276078/62‑1 (MQ=255) ttCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCacgac > 2:276078/1‑62 (MQ=255) tctcAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCcagcag > 1:393669/1‑139 (MQ=255) tctcAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTAcagcag > 2:294991/1‑139 (MQ=255) tcAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAgtg < 1:244944/139‑1 (MQ=255) cAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAgtgg > 2:399397/1‑139 (MQ=255) aaaCCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAgtggg < 1:329638/139‑1 (MQ=255) tGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCAt < 1:78353/100‑1 (MQ=255) tGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCAt > 2:78353/1‑100 (MQ=255) tgGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCa > 1:75819/1‑92 (MQ=255) tgGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCa < 2:75819/92‑1 (MQ=255) tgGCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCt > 2:223551/1‑139 (MQ=255) gCAGTGGAAACTCAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTgg < 2:217464/139‑1 (MQ=255) cAGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGcgtcgt < 1:116278/139‑1 (MQ=255) aGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAagccagc > 2:118897/1‑61 (MQ=255) aGGGTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAagccagc < 1:118897/61‑1 (MQ=255) gggTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTaa < 2:389326/139‑1 (MQ=255) gggTGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTaa < 1:223551/139‑1 (MQ=255) | GTTTAGCCACTACCGTAGCGGCAGTATGCAAAGCGGCTTGCGAATGCACGATCTCTGCGCCATCGCCTGGCTGGTGCGCCCGGACCTGTTCACTCTCAAACCCTGTTTTGTGGCAGTGGAAACTCAGGGCGAATTTACCTCAGGCACGACGGTGGTTGATATCGACGGTTGCCTGGGCAAGCCAGCCAATGTACAGGTGGCATTGGATCTGGATGTGAAAGGCTTCCAGCAGTGGGTGGCTGAGGTGCTGGCTCTGGCGTCGTAA > NC_000913/27943‑28207 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |