| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 773,987 | C→T | P316S (CCG→TCG) | cydB → | cytochrome d terminal oxidase, subunit II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 773,987 | 0 | C | T | 100.0% | 183.9 / NA | 52 | P316S (CCG→TCG) | cydB | cytochrome d terminal oxidase, subunit II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (25/27); total (25/27) | |||||||||||
GGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTACACCGCCTGGTGTT > NC_000913/773854‑774116 | gggTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTcc > 2:919251/1‑139 (MQ=255) ggTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCAcc < 2:416444/139‑1 (MQ=255) tGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCatgat > 2:1173093/1‑139 (MQ=255) gctgctGACCATCCGGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAAc < 1:782841/139‑1 (MQ=255) ctgctgACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACg < 1:1002248/139‑1 (MQ=255) ccTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACa < 1:486069/139‑1 (MQ=255) ccTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACa < 2:276583/139‑1 (MQ=255) tGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGa < 1:127552/135‑1 (MQ=255) tGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGa > 2:127552/1‑135 (MQ=255) aCTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAAtgt < 1:424994/139‑1 (MQ=255) tAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTcc > 1:431915/1‑139 (MQ=255) aaGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTccag > 1:181743/1‑139 (MQ=255) ccGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTccagcca > 1:979610/1‑139 (MQ=255) gTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTg < 2:181743/139‑1 (MQ=255) tGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGa < 2:532465/139‑1 (MQ=255) cctccCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGAc < 1:584565/139‑1 (MQ=255) cccTGACGCTGGCCTGCGTCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTg > 2:436622/1‑139 (MQ=255) tGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGt > 2:47076/1‑139 (MQ=255) cGCTGGCCCGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATgtcgtc > 2:486890/1‑58 (MQ=255) cGCTGGCCCGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATgtcgtc < 1:486890/58‑1 (MQ=255) cTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAACCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCgg > 2:778270/1‑139 (MQ=255) tGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCggt < 2:576474/139‑1 (MQ=255) tGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTc < 1:1014402/139‑1 (MQ=255) catcatCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTg > 2:694311/1‑139 (MQ=255) tcCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACg > 2:538995/1‑60 (MQ=255) tcCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACg < 1:538995/60‑1 (MQ=255) tcCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACa > 2:928581/1‑71 (MQ=255) tcCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACa < 1:928581/71‑1 (MQ=255) tcCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAAtgt > 1:936055/1‑75 (MQ=255) tcCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAAtgt < 2:936055/75‑1 (MQ=255) tcCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTAcc > 2:63617/1‑139 (MQ=255) cTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGa < 1:47076/139‑1 (MQ=255) aCAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAg < 1:615915/59‑1 (MQ=255) aCAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAg > 2:615915/1‑59 (MQ=255) aGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCAtt < 2:286325/139‑1 (MQ=255) aGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCAtt < 1:1173093/139‑1 (MQ=255) ccGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCaa < 1:1027879/54‑1 (MQ=255) ccGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCaa > 2:1027879/1‑54 (MQ=255) ccGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCt > 2:967885/1‑139 (MQ=255) cGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTTCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGt > 2:718130/1‑126 (MQ=255) cGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCa > 1:708854/1‑38 (MQ=255) cGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCa < 2:708854/38‑1 (MQ=255) cGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTg > 1:200051/1‑139 (MQ=255) cGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTg > 2:281181/1‑139 (MQ=255) cGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATATGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGt < 1:718130/126‑1 (MQ=255) gTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGct < 2:979610/139‑1 (MQ=255) cGCAATGTTCCCGTTTGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTac < 1:694311/139‑1 (MQ=255) tttGTGATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTACACCGCCTGGTGtt > 2:999394/1‑139 (MQ=255) tgtgATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGAt < 2:571672/49‑1 (MQ=255) tgtgATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGAt > 1:571672/1‑49 (MQ=255) tgATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGAcc < 2:958501/83‑1 (MQ=255) tgATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGAcc > 1:958501/1‑83 (MQ=255) tgATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCAtt < 2:832608/113‑1 (MQ=255) tgATGTCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCAtt > 1:832608/1‑113 (MQ=255) | GGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTACACCGCCTGGTGTT > NC_000913/773854‑774116 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |