| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,284,931 | A→G | T83A (ACC→GCC) | agaC → | N‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IIC component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,284,931 | 0 | A | G | 100.0% | 31.3 / NA | 12 | T83A (ACC→GCC) | agaC | N‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IIC component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (6/6); total (6/6) | |||||||||||
CTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTGGCTTAATTACCGGTGGTCTGACAGAGTTGGCTTTCGCCGGATTAACCCCTGCAGGTGGTGTTCAGCCGCCCAACCCGATTATGGCGGGTCTGATGACCACCGTCATTGCATGGTCTACGGGCGTTGATGCCAAAACAGCAATTGGTCTTGGCCTGCCGTTTAGTTTGTTAATGCAGTACGTCATTCTGTTCTTCTATTCCGCTTTCTCATTATTTATGACCAAAGCC > NC_000913/3284799‑3285059 | cTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTGGCTTAATTACCGGTGGTCTGACAGAGTTGGCTTTCGCCGGATTAACCCCTGCAGGTGGTGTTCAGCCGCCCAACCCGATTATGGCGGGTCTGATGACCGCCGTCa > 2:99544/1‑139 (MQ=255) tGATATTCAGACTGGCTTAATTACCGGTGGTCTGACAGAGTTGGCTTTCGCCGGATTAACCCCTGCAGGTGGTGTTCAGCCGCCCAACCCGATTATGGCGGGTCTGATGACCGCCGTCATTGCATGGTCTACGGGCGtt < 1:99544/139‑1 (MQ=255) tAATTACCGGTGGTCTGACAGAGTTGGCTTTCGCCGGATTAACCCCTGCAGGTGGTGTTCAGCCGCCCAACCCGATTATGGCGGGTCTGATGACCGCCGTCATTGCATGGTCTACGGGCGTTGATGCCAAAACAGCAAt < 1:77504/139‑1 (MQ=255) cGCCGGATTAACCCCTGCAGGTGGTGTTCAGCCGCCCAACCCGATTATGGCGGGTCTGATGACCGCCGTCATTGCATGGTCTACGGGCGTTGATGCCAAAACAGCAATTGGTCTTGGCCTGCCGtt < 1:413690/126‑1 (MQ=255) cGCCGGATTAACCCCTGCAGGTGGTGTTCAGCCGCCCAACCCGATTATGGCGGGTCTGATGACCGCCGTCATTGCATGGTCTACGGGCGTTGATGCCAAAACAGCAATTGGTCTTGGCCTGCCGtt > 2:413690/1‑126 (MQ=255) ccTGCAGGTGGTGTTCAGCCGCCCAACCCGATTATGGCGGGTCTGATGACCGCCGTCATTGCATGGTCTACGGGCGTTGATGCCAAAACAGCAATTGGTCTTGGCCTGCCGTTTAGTTTGTTAATGCAGTACGTCATTc < 2:55623/139‑1 (MQ=255) gtgtTCAGCCGCCCAACCCGATTATGGCGGGTCTGATGACCGCCGTCATTGCATGGTCTACGGGCGTTGATGCCAAAACAGCAATTGGGCTTGGCCTGCCGTTTAGTTTGTTTATGCAGTACGTCATTCTGTTCTTCTa > 2:216262/1‑139 (MQ=255) ccgccCAACCCGATTATGGCGGGTCTGATGACCGCCGTCATTGCACGGTCTACGGGCGTTGATGCCAAAACAGCAATTGGGCTTGGCCTGCCGTTTAGTTTGTTAATGCAGTACGTCATTCTGTTCTTCTATTCCGCtt > 2:158295/1‑139 (MQ=255) gCGGGTCTGATGACCGCCGTCATTGCATGGTCTACGGGCGTTGATGCCAAAACAGCAATTGGTCTTGGCCTGCCGTTTAGTTTGTTAATGCAGTACGTCATTCTGTTCTTCTATTCCGCTTTCTCATTATTTATGACCa < 2:4321/139‑1 (MQ=255) cGGGTCTGATGACCGCCGTCATTGCATGGTCTTCGGGCGTTGATGCCAAAACAGCAATTGGTCTTGGCCTGCCGTTTAGTTTTTTAATGCAGTACGTCATTTTGTTTTTCTATTCCGCTTTCTCATTATTTTTGACCaa > 1:4321/1‑139 (MQ=255) gggTCTGATGACCGCCGTCATTGCATGGTCTACGGGCGTTGATGCCAAAACAGCAATTGGTCTTGGCCTGCCGTTTAGTTTGTTAATGCAGTACGTCATTCTGTTCTTCTATTCCGCTTTCTCATTATTTATGACCaaa < 2:445757/139‑1 (MQ=255) tCTGATGACCGCCCTCCTTGCATGGTCTACGGGCGTTGATGCCAAAACAGCAATTGGTCTTGGCCTGCCGTTTAGTTTGTTTATGCAGTACGTCCTTCTGTTCTTCTATTCCGCTTTCTCCTTATTTTTTACCAAAgac > 1:18183/1‑137 (MQ=255) | CTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTGGCTTAATTACCGGTGGTCTGACAGAGTTGGCTTTCGCCGGATTAACCCCTGCAGGTGGTGTTCAGCCGCCCAACCCGATTATGGCGGGTCTGATGACCACCGTCATTGCATGGTCTACGGGCGTTGATGCCAAAACAGCAATTGGTCTTGGCCTGCCGTTTAGTTTGTTAATGCAGTACGTCATTCTGTTCTTCTATTCCGCTTTCTCATTATTTATGACCAAAGCC > NC_000913/3284799‑3285059 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |